1 / 18

Bildediagnostikk

Hovedoppgave 04-06 Ved HIB/UIB Informatikk Bruk av MATLAB for visualisering og analyse av FREESURFER-segmenterte MRI-opptak av den aldrende hjerne Roy Kjellid. Bildediagnostikk. Finnes flere ulike teknikker Røntgen Ultralyd MRI Klassifisere Manuell klassifikasjon Automatisk klassifikasjon.

ursa
Download Presentation

Bildediagnostikk

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. Hovedoppgave 04-06Ved HIB/UIB InformatikkBruk av MATLAB for visualisering og analyse av FREESURFER-segmenterte MRI-opptak av den aldrende hjerneRoy Kjellid

  2. Bildediagnostikk • Finnes flere ulike teknikker • Røntgen • Ultralyd • MRI • Klassifisere • Manuell klassifikasjon • Automatisk klassifikasjon

  3. MRI • MRI ”oppfunnet” av Bloch og Purcell • Stor utvikling siste 20 år • Segmenteringsteknikker • Bildekvalitet • Nye applikasjoner • Applikasjoner • Automatisk klassifikasjon • FreeSurfer

  4. ”FREESURFER” • Freesurfer er utviklet hos: • Cortechs og Martinos Center for Biomedisinsk Avbildning • Martinos Center er et samarbeid • Harvard-Massachusetts Institute of Technology (MIT) • Massachusetts General Hospital.

  5. Hva gjør FreeSurfer: • Vevsgjenkjenning og morfometri basert på MRI • Freesurfer er det mest avanserte av slike verktøy

  6. Hva gjør FreeSurfer: • Tar utgangspunkt i ett eller flere T1-vektete 3D hodeopptak • Automatisk segmentering av WM,GM,CSF • Segmenterer også anatomiske strukturer

  7. FreeSurfer • FreeSurfer = Linux basert • Visualiserings del i TCL/TK • Mål med oppgaven: • dels innsikt gjennom visualisering • dels tilrettelegging og gjennomføring av statistiske analyser av segmenterte volumer og flater

  8. Teknologi • Hvorfor Matlab? • MATLAB, Matematisk verktøy • Mange ToolBoxes • DICOM • Virker på ulike plattformer • Negative sider: • Funksjons og script basert • Bruker mye minne

  9. VizFree • VizFree • Sentralisert Kontroll Arkitektur • Bildebehandling og Matlab

  10. VizFree – Visualisere DICOM

  11. VizFree – Visualisere FreeSurfer aseg

  12. VizFree – Volum og hjernestruktur

  13. VizFree – Tydelige Bilder

  14. VizFree – 3D

  15. VizFree - Gruppeanalyse

  16. Hvorfor? • Måle ulike volumendringer • Effekt av medisinering • Sykdommer eller lidelser

  17. Spørsmål?

  18. HIB og Master…. • Tilrettelegging? • Software? • Kompetanse?

More Related