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fondé en 2001 (1996/2001) Réseau international pour la biodiversité But: Rendre les données scientifiques et les informations relatives à la biodiversité libres et disponibles, de façon durable, sous forme digitalisée à travers Internet. GBIF. Bases du GBIF.
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fondé en 2001 (1996/2001) Réseau international pour la biodiversité But:Rendre les données scientifiques et les informations relatives à la biodiversité libres et disponibles, de façon durable, sous forme digitalisée à travers Internet. GBIF
Bases du GBIF Pas de base de données centrale, mais des bases “éparpillées” Les données restent dans les bases d'originecontrôle total du fournisseur des données (Provider) concernant la mise à disposition des données Le provider décide lui-même des parties des collections accessibles au travers du GBIF L'accès au données se fait par l'intermédiaire d'un portal de recherche central
Déroulement d'une recherche dans le réseau GBIF Utilisateur http/html ? Portail de recherche ABCD ! ODBC Enregistrement Index Achillea atrata
Schéma de données ABCD Access to Biological Collection Data:Schéma de données basé sur XML pour la structuration de différents types de collections biologiques (vivant/conservé/observations,botanique/zoologie, marin/terrestre) Description complète des informations relatives aux collections(version actuelle: 1055 champs de données) Standard TDWG, actuellement v2.06
Provider-Software (“Wrapper”) Portail de recherche 2 Portal de recherche 1 ABCD Wrapper Collection A Collection D Collection B Collection C • Banques de données hétérogènes concernant: • Système de BD (Access, SQL-Server, mySQL, Postgres, ...) • Modèle de données • Étendue/Qualité des données • Degré d'atomisation
Conditions essentielles pour la connexion au GBIF Bases de données compatibles SQL: Access, mySQL, Oracle, Microsoft SQL Server, dBase, Postgres, FireBird, InterBase, Sybase, FoxPro Un serveur connecté en permanence à l'internet (Apache, Microsoft Internet Information Server) Installation du Provider-Software (Wrapper)
Étapes de la connexion Installation du provider software (“Wrapper”) Préparation de la base de données pour la publication (au besoin: transformation des données, création d'une copie avec les données à publier) Configuration du Wrapper: application de la structure de la base de données aux éléments du schéma ABCD Test de la nouvelle installation Inscription de la nouvelle installation
Helpdesk GBIF-France vous soutient pour: les questions d'ordre général et ambiguïtés rencontrées la préparation de la base de données pour la publication l'installation et la mise en place du provider software la configuration par aide téléphonique ou email configuration à distance soutien à domicile
Hébergement Hébergement d'une collection au travers d'une institution ayant une infrastructure pré-existante Inconvénient:Perte du contrôle direct sur la collection
Ce que GBIF ne peut pas faire Prendre en charge les enregistrements digitalisés de collections (images, vidéos, sons...) Fournir un accès internet à une collection MAIS: Le développement de portails de recherche spécifiques (contenu et forme) est possible
Contacts Support technique européen: Jörg Holetschek Botanischer Garten & Botanisches Museum Abteilung Biodiversitätsinformatik & Labors Königin-Luise-Straße 6-8 14191 Berlin-Dahlemj.holetschek@bgbm.org Tel. 0049 308 38 50 150 Support technique français: Adil El Filali & Patricia Kelbert GBIF-France / Point Nodal 12 rue Cuvier 75 005 Paris elfilali@gbif.fr kelbert@gbif.fr Tel: 01 44 27 49 84