780 likes | 1.05k Views
Membranproteiner. Kapitel 12. Membranproteiner. Perifera membranproteiner. Integrala membranproteiner. Colicin A. Paradox: Membranprotein Som är lösligt både i vatten och instopppat i membran Alternativ Konformation i lösning jämfört med i membran. Bakterierhodopsin. Bakterierhodopsin.
E N D
Membranproteiner Kapitel 12
Membranproteiner Perifera membranproteiner Integrala membranproteiner
Colicin A Paradox: Membranprotein Som är lösligt både i vatten och instopppat i membran Alternativ Konformation i lösning jämfört med i membran
Rhodopsin Retinal Blå= grundtillstånd Röd=exciterat tillstånd
K+-kanalen ”från sidan” ”uppifrån”
Fotosyntetiska pigment Ubikinon Klorofyll
Hydropathy plot • Beräkna utgående från ett ”fönster” (19 aa) hydrofobiciteten och plottar mot sekvensen • Kan förutsäga vilka delar av en transmembranhelix som är inbäddad i membranet • Kan även användas för cytosoliska proteiner, vilken information får man då?
Några exempel från PDB • K+-kanalen • Rhodopsin • Colicin A
Topologi cH-rasp21 Topologisk brytpunkt