170 likes | 271 Views
Krajowa Sieć Informacji o Bioróżnorodności www.ksib.edu.pl. Piotr Tykarski Uniwersytet Warszawski , Węzeł Główny KSIB. Historia. Marzec 2001 Podpisanie przez rząd RP Memorandum of Understanding : Polska staje się członkiem sieci 2003
E N D
Krajowa Sieć Informacjio Bioróżnorodnościwww.ksib.edu.pl Piotr Tykarski Uniwersytet Warszawski, Węzeł Główny KSIB
Historia • Marzec 2001 Podpisanie przez rząd RP Memorandum of Understanding: Polska staje się członkiem sieci • 2003 Środki finansowe z KBN na infrastrukturę(główny serwer) Decyzja w sprawie finansowania sieci • Styczeń 2004 Powstanie Sieci Krajowej GBIF
WWW.GBIF.ORG GLOBALBIODIVERSITY INFORMATIONFACILITY The GBIF Information System Slajd pochodzi z prezentacji wykonanej przez Sekretariat GBIF
GBIF objective • GBIF is an international scientific co-operative project based on a multilateral agreement (MoU) between countries, economies and international organisations, dedicated to: • establishing an distributed information infrastructure containing primary biodiversity data, • with initial focus on species- and specimen-level data, • with links to molecular, genetic and ecosystems levels • in order to make the world’s scientific biodiversity information freely and universally available to all Slajd pochodzi z prezentacji wykonanej przez Sekretariat GBIF
Australia Feb 2001 Belgium Feb 2001 Canada Mar 2001 Costa Rica May 2001 Denmark Jan 2001 Estonia Sep 2003 Finland Apr 2001 France Mar 2001 Germany Feb 2001 Iceland Jun 2001 Japan Feb 2001 Korea, Republic of May 2001 Mexico Mar 2001 Netherlands Feb 2001 New Zealand Feb 2001 Nicaragua Jun 2001 Norway Mar 2004 Peru Sep 2002 Portugal Jun 2001 Slovenia Feb 2001 South Africa May 2003 Spain Feb 2001 Sweden Feb 2001 United Kingdom Aug 2001 United States of America Jan 2001 PARTICIPATION • Argentina Mar 2002 • Austria Sep 2001 • Bulgaria Aug 2001 • Colombia Sep 2003 • Czech Republic Oct 2002 • Ghana Mar 2001 • India Aug 2003 • Indonesia Nov 2004 • Madagascar Jan 2003 • Morocco Jun 2003 • Pakistan Aug 2001 • Papua New Guinea Mar 2004 • Poland Mar 2001 • Slovak Republic Aug 2001 • Switzerland Feb 2001 • Taiwan (Economy) Sep 2002 • Tanzania Sep 2002 Slajd pochodzi z prezentacji wykonanej przez Sekretariat GBIF
PARTICIPATION Slajd pochodzi z prezentacji wykonanej przez Sekretariat GBIF
GBIF as a global inte-grator Slajd pochodzi z prezentacji wykonanej przez Sekretariat GBIF
Specimens: Flowering Plants of Africa Observations: Birds of Central America Specimens: Proteaceae of the World Observations: Butterflies of Belize Observer Network B Museum A Taxon Names: Proteaceae of the World Observations: Erinaceus of Europe Specimens: Bacteria Cultures Specimens: Mammals of North Europe GBIF Network Taxon Names: Mammals of the World Taxon Names: Bacteria Further Links: Mammals Further Links: Bacteria University D Museum C GBIF Data Providers install web services Data Providers Slajd pochodzi z prezentacji wykonanej przez Sekretariat GBIF
Class: Insecta Taxonomic Names ECAT + DADI Ecological Interactions Sequence Data Order: Lepidoptera Foodplant: Zea mais L. 1753 Locus: AAL35331Definition: acyl-CoA Z/E11 desaturase 1 mvpyattadg hpekdecfed... Family: Pyralidae Synonym: Pyralis nubilalis Hübner, 1796 Genus: Ostrinia Hübner, 1825 Species: Ostrinia nubilalis (Hübner, 1796) Taxonomic Descriptions Diagnosis: Wingspan 26-30mm; sexually dimorphic;male: forewings ochreous to dark brown; female: forewings pale yellow; … Vernacular (EN): European Corn-borer Vernacular (DE): Maiszünsler Vernacular (ES): Piral del maíz Vernacular (FR): Pyrale du maïs Digital Literature and Web Resources Pheromones of Ostrinia http://www.nysaes.cornell.edu/fst/faculty/acree/pheronet/phlist/ostrinia.html Collection: DGH Lepidoptera Record id: DGHEUR_003217 Country: France Coordinates: 03.047˚E 48.730˚N Date: 28 June 2003 Collector: Donald Hobern Abiotic Data Specimen & Observation Data DIGIT + DADI Average Rainfall Location: 48.82°N 2.29°E Jan Feb Mar Apr ... 182.3 120.6 158.1 204.9 ... GBIF deals with 1 biodiversity data o Slajd pochodzi z prezentacji wykonanej przez Sekretariat GBIF
June 2003 S M T W T F S 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 Users and applications need data structured according to standards <?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?> <response> <record> <darwin:DateLastModified>2003-06-08</darwin:DateLastModified> <darwin:InstitutionCode>DGH</darwin:InstitutionCode> <darwin:CollectionCode>DGH Lepidoptera</darwin:CollectionCode> <darwin:CatalogNumber>DGHEUR_0002976</darwin:CatalogNumber> <darwin:ScientificName>Dichomeris marginella (Fabricius, 1781)</darwin:ScientificName> <darwin:BasisOfRecord>O</darwin:BasisOfRecord> <darwin:Kingdom>Animalia</darwin:Kingdom> <darwin:Order>Lepidoptera</darwin:Order> <darwin:Family>Gelechiidae</darwin:Family> <darwin:Genus>Dichomeris</darwin:Genus> <darwin:Species>marginella</darwin:Species> <darwin:ScientificNameAuthor>(Fabricius, 1781)</darwin:ScientificNameAuthor> <darwin:IdentifiedBy>Donald Hobern</darwin:IdentifiedBy> <darwin:Collector>Donald Hobern</darwin:Collector> <darwin:YearCollected>2003</darwin:YearCollected> <darwin:MonthCollected>06</darwin:MonthCollected> <darwin:DayCollected>08</darwin:DayCollected> <darwin:ContinentOcean>Europe</darwin:ContinentOcean> <darwin:Country>Denmark</darwin:Country> <darwin:County>Gentofte Amt</darwin:County> <darwin:Locality>Merianvej, Hellerup</darwin:Locality> <darwin:Longitude>12.538</darwin:Longitude> <darwin:Latitude>55.737</darwin:Latitude> <darwin:CoordinatePrecision>100</darwin:CoordinatePrecision> <darwin:IndividualCount>1</darwin:IndividualCount> <darwin:Notes>1 in Skinner trap</darwin:Notes> </record> </response> Observation record formatted using the Darwin Core Slajd pochodzi z prezentacji wykonanej przez Sekretariat GBIF
<request> <response> <record> … User <response> <record> … <request> <response> <record> … <request> Web services enable the aggregation of structured data Web Services Heterogeneous Databases Standardised Structured Data Slajd pochodzi z prezentacji wykonanej przez Sekretariat GBIF
GBIF node responsibilities GBIF Registry, Index, and Portal • Coordination • Network • Registry • Standards • Tools • Consolidated Data • Network • Registry • Standards • Tools • Identify Data Nodes • Endorse and quality assure data nodes • National Language Interfaces Data Node Participant Node Portal • Metadata • Data • Encourage participation • Manage registration of Data Nodes Slajd pochodzi z prezentacji wykonanej przez Sekretariat GBIF
Zasady działania Sieci Krajowej • Ścisła współpraca z siecią GBIF • Struktura otwarta • Członkowie - 9 instytucji • Koordynator Sieci Krajowej: Wydział Biologii UW- Węzeł Krajowy GBIF • Węzły Danych- 6 aktywnych • ok. 68000 rekordów • Typy danych: • I: rozmieszczenie gatunków (wystąpienie w przestrzeni i w czasie: okaz/obserwacja) • II: dane z kolekcji szczepów, kultur, banków nasion etc.
Plany rozwoju Sieci • Zwiększenie liczby rekordów (250000 w 2005 r.) • Przyłączanie nowych uczestników • Digitalizacja informacji o bioróżnorodności • Standaryzacja: ustalenie wspólnych standardów wymiany i organizacji danych • Współpraca z innymi instytucjami i strukturami związanymi z tematyką bioróżnorodności w Polsce • Utworzenie wewnętrznego systemu wymiany informacji
Zadania koordynatora • Utworzenie i uzupełnianie rejestru instytucji posiadających wartościowe dane • Poszukiwanie potencjalnych uczestników • Kontakt z siecią GBIF • Koordynacja: bazy referencyjne dot. taksonomii i GIS dla uczestników Sieci • Rozwijanie funkcji węzła danych • możliwość udostępniania serwera na potrzeby innych członków sieci • Szkolenia i wsparcie techniczne dla członków • Działania integracyjne • wspólne projekty badawcze i aplikacyjne • utworzenie wewnętrznego systemu wymiany informacji dla członków Sieci • Zdobywanie środków na działanie Sieci • wniosek na lata 2005-2008
Dlaczego warto być w Sieci • Możliwość prezentacji własnego dorobku w sieci światowej • Dostęp do danych udostępnionych wewnątrz Sieci Krajowej • Dostęp do nowoczesnych technologii zarządzania i wymiany informacji • Możliwość uczestniczenia w projektach naukowych opartych o dane udostępnione w Sieci Krajowej