250 likes | 429 Views
Kampylobaktery v potravním řetězci. Iva Steinhauserová Gabriela Bořilová. Veterinární a farmaceutická univerzita Ústav hygieny a technologie masa Palackého 1-3 Brno, 612 42. KAMPYLOBAKTERIÓZA. epidemiologicky významné alimentární onemocnění – zoonóza
E N D
Kampylobaktery v potravním řetězci Iva Steinhauserová Gabriela Bořilová Veterinární a farmaceutická univerzita Ústav hygieny a technologie masa Palackého 1-3 Brno, 612 42
KAMPYLOBAKTERIÓZA • epidemiologicky významné alimentární onemocnění – zoonóza • původce: termofilní druhy rodu Campylobacter – C. jejuni, C. coli • kampylobakteriózy x salmonelózy • rozvinuté země x rozvojové země Vzhled C. jejuni pod elektronovým mikroskopem
NÁRŮST KAMPYLOBAKTERIÓZ • zlepšení diagnostických metod • zkvalitnění zdravotnické dokumentace / administrativy • nárůst konzumace drůbeže/drůbežích výrobků Produkce = vysoká efektivita výkrmu, vysoce prošlechtěná masá plemena Ekonomika = relativně nízká cena Společnost = přijatelné pro většinu skupin obyvatel, semivegetariáni, náboženské důvody Výživa = nízký obsah tuku, snadná stravitelnost, rychlá a snadná kulinární úprava, vysoká míra inovace nabízeného sortimentu (např. drůbež s prodlouženou dobou výkrmu, baby výrobky, apod.)
ZDROJENÁKAZY • kontaminované suroviny / potraviny = syrové maso, syrové mléko, syrová zelenina = nedostatečně tepelně upravené maso (chybná kulinární úprava), mražené výrobky • kontaminovaná voda = použití kontaminovaných povrchových nebo odpadních vod • kontakt se zvířaty = zemědělská prvovýroba, domácí mazlíčci (pets)
VÝSKYTCAMPYLOBACTER SPP. • caecum a colon hospodářských a volně žijících zvířat (většinou bez klinických příznaků) • drůbež = vysoký výskyt = 0 – 92 % farem (0 – 100 % jedinců v hejnu) = C. jejuni, C. coli, C. fetus subsp. fetus, C. lari = různá prevalence u různých druhů drůbeže (brojleři, křepelky, krůty) = různá prevalence u stejných druhů drůbeže v různých zemích = vliv chovné technologie, věk zvířat, zoohygiena farem, logistika porážek
VÝSKYTCAMPYLOBACTERSPP. • divocí ptáci = bažanti, vrabci, holubi, vrány,aj. • prasata = 30 – 70 % (C. coli) • hlodavci, hmyz • pets (častý a těsný kontakt s lidmi (dětmi) • skot = 10 – 30 % • ovce = 10 – 30 %
KULTIVACE CAMPYLOBACTER SPP. • ČSN EN ISO 102 72(2006) Horizontální metoda průkazu a stanovení počtu Campylobacter spp. Pomnožení = bujon dle Boltona = při 37°C po dobu 4h = dále při 41,5°C po dobu 44h ±4h = mikroaerobně (GeneratingKit CAMPsystem) Izolace = mCCDA agar + druhá izolační půda (Karmali agar) = při 41,5°C po dobu 44h ±4h = mikroaerobně = charakteristické kolonie Vzhled Campylobacter spp. na Karmali
IDENTIFIKACE PCR / RFLP • typizace termofilních Campylobacter – C. coli, C. jejuni, C. lari a C. upsaliensis = 491 bp: gen 23S rRNA = specifický pro termofilní Campylobacter spp. • štěpení produktu restrikční endonukleázou AluI: identifikace C. jejuni a C. coli • štěpení produktu RE Tsp509I = identifikace C. lari a C. upsaliensis)
PCR IDENTIFIKACE C. JEJUNI /C. COLI • identifikace pomocí multiplex PCR • 16S rRNA gen – 857 bp = Campylobacter spp. • mapA gen – 589 bp = Campylobacter jejuni • ceuEgen– 462 bp = Campylobacter coli Identifikace C. jejuni / C.coli pomocí mPCR M 1 2 3 4 5 857 bp 589 bp 462 bp 1 2 M 3 4 jejuni coli mix coli jejuni (M = marker, 1 = C. jejuni ATCC 33560, 2= C. coli ATCC 43478, 3 = mix, 4 = C. coli wild typ, 5 = C. jejuni wild typ)
REZISTENCE K ATB Agarová diluční metoda (CLSI M7 – A7) • ATB :NAL = kyselina nalidixová,CIP = ciprofloxacin, TET = tetracyklin, ERY= erythromycin, CMP = chloramphenicol, AMP = ampicilin, GEN = gentamicin + ENR = enrofloxacin, KAN = kanamycin, STR = streptomycin • inoculum:48 h kultura, ředěna v BHI do 0.5McF • kultivace:Mueller - Hinton agar • inkubace:42ºC po dobu 48±2h, mikroaerobně (GeneratingKit CAMPsystem) • vyhodnocení: CLSI M100 - S16 (2006) – Performance Standards for Antimicrobial Susceptibility Testing, Sixteenth Informational Supplement COMITE DE L’ANTIBIOGRAMME DE LA SOCIETE FRANCAISE DE MICROBIOLOGIE - Recommandations 2007
MECHANISMUS REZISTENCE • sledování pomocí molekulárně-biologických metod – PCR, mPCR, PCR/RFLP, MAMA PCR RFLP detekce mutace A2059G – štěpení RE BsaI • REZISTENCE K MAKROLIDŮM • PCR-RFLP + MAMA PCR • detekce dvou bodových mutací (A2074C + A2075G) v genu 23S rRNA • ERY 320 bp M 1 2 3 4 M = marker 1, 2 , 3 , 4 = resistant strains C. coli • REZISTENCE K TETRACYKLINŮM • MULTIPLEX – PCR • detekce tet genů • tet(O), tet(M) + tet(A), tet(B) tet(E) • TET • REZISTENCE K CHINOLONŮM • MAMA PCR • detekce mutací v genu gyrA • mutace na pozici Thr-86-Ile • NAL, CIP, ENR
VÝSKYT CAMPYLOBACTER SPP. U DRŮBEŽE VE VYBRANÝCH ZEMÍCH
VÝSKYT CAMPYLOBACTER SPP. NA FARMÁCH S RŮZNOU TECHNOLOGIÍ CHOVU BROJLERŮ V ITÁLII
FLA– RFLP SUBTYPIZACE C. JEJUNI • amplifikace variabilní částgenu proflagellinA • profily fragmentů po štěpení třemi RE: AfaI – 6 typů,MboI – 7 typů HaeIII – 5 typů • kombinací typů štěpení dosud nalezeno31 subtypů C. jejuni
PFGE SUBTYPIZACE C. JEJUNI • pulsní gelová elektroforéza celého chromozomu štěpeného RESmaI • fragmentyděleny na CHEF-DR III systému (BioRad), 1% agaróza, 200 V, úhel 120o, 9oC; 5 -10 s, 4 h; 10 - 40 s, 14 h; 50 - 60 s, 4 h. • dosud bylo nalezeno 32 PFGE subtypů b+b1, e+1+ e2 – příbuzné kmeny, * - C. coli
VÝSLEDKY SUBTYPIZACE • chovy nejsou infikovány různými bakteriálními klony, kombinace výsledků obou analýz naznačují, že jednotlivá hejna byla kontaminována převážně identickými klony u kterých během kolonizace došlo k mutacím • variabilitu subtypů lze vysvětlit především mutacemi v genu flaA (detekované PCR/RFLP) polymorfismy v oblastech štěpených SmaI (detekované PFGE) jsou méně časté. • genotyp zjištěný PFGE se jeví jako stabilnější, mutace v genu flaA jsou častější a vytvářejí tak větší variabilitu PCR subtypů
REZISTENCE - DRŮBEŽ Tab. : Monitoring rezistence/senzitivity k vybraným ATB u kmenů C. coli and C. jejuni izolovaných z brojlerů (2006)
BAŽANT OBECNÝ (Phasianus colchicus subsp. torquatus) Tab. : Monitoring výskytu termofilních Campylobacter spp. u bažanta obecného (2006)
KŘEPELKA JAPONSKÁ(Coturnix coturnix japonica) • vyšetřeno 50 ks zdravých zvířat z intenzivního chovu (2006) • pozitivní nálezy – 86 % (obsah caeca) • 70 % (36 %) -C. jejuni • 34 % -C. jejuni + C. coli • potencionální nebezpečí pro konzumenta (specifická skupina) – ostatní druhy chovaných ptáků (pernatá zvěř)
PRASE DOMÁCÍ(Sus scrofa f. domestica) Tab. : Monitoring výskytu termofilních Campylobacter spp. u jatečních prasat (2006) • vzorky odebírány z vnitřní části recta před vykolením • nízké nálezy na mase u prasat • 35 % vyšetřených kmenů C. coli - multirezistentní Monitoring ATB rezistence u izolovaných kmenů C. coli
HUMÁNNÍ KMENY CAMPYLOBACTER SPP. • získány jako klinické izoláty (n = 213) • typizace mPCR, PCR/RFLP x biochemické testy • C. jejuni – 80 % C. coli - 10 % C. jejuni + C. coli – 10 % • subtypizace C. jejuni – vysoká variabilita genotypů Monitoring rezistence/senzitivity k vybraným ATB u kmenů C. coli and C. jejuni izolovaných z humánních pacientů