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NF- k B : simulations stochastiques Alain Lilienbaum UMR 7000

NF- k B : simulations stochastiques Alain Lilienbaum UMR 7000 Groupe « Voies de signalisation du stress du cytosquelette » Faculté de médecine La Pitié - Salpétrière 105, bd. de l’hôpital 75013 PARIS. LE FACTEUR DE TRANSCRIPTION NF- k B. Signaux.

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NF- k B : simulations stochastiques Alain Lilienbaum UMR 7000

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  1. NF-kB : simulations stochastiques Alain Lilienbaum UMR 7000 Groupe « Voies de signalisation du stress du cytosquelette » Faculté de médecine La Pitié - Salpétrière 105, bd. de l’hôpital 75013 PARIS

  2. LE FACTEUR DE TRANSCRIPTION NF-kB Signaux FACTEURS DE TRANSCRIPTION Start Stop Eléments de contrôle GENE A Transcription ARN messager Traduction A A A Protéines A A A A A

  3. Rôles Biologiques du Facteur NF-kB • Réponse immunitaire • Inflammations • Survie face aux stress (oxydoreductions, ionisations,…) • Traumatismes neurologiques, maladie d’Alzheimer, • maladie de Parkinson, cancers, arthrites rhumatoïdes. - Plus d’une centaine de gènes « cibles » identifiés. - Recherche d’agents inhibiteurs spécifiques.

  4. Agents mitogènes Cytokines Facteurs de stress Produits viraux et bactériens PMA, Facteurs de croissance … TNFa, IL1, IL2 … ROS, UV, RX Taxol … VIH, HTLV I EBV, CMV … NF-kB Immuno Récepteurs Cytokines, F.C. Adhérence cellulaire Virus S Redox. CMH, TCR IL2Ra … TNFa, IL2, IL6, IL8 … ELAM1 VCAM1 ICAM1 SOD NOS-i GST VIH CMV SV40

  5. Mitogènes TGFb LPS Cytokines T b R PKC NAK PAK TAK NIK MEKK IKK NF-kB Gènes cibles

  6. RESEAUX DE GENES Le facteur NF-kB Récepteurs Gène A Gène B Gène C

  7. RESEAUX DE GENES Le facteur NF-kB SIGNAUX Récepteurs Voies de signalisation Gène A Gène B Gène C

  8. RESEAUX DE GENES Le facteur NF-kB SIGNAUX Récepteurs Voies de signalisation Gène A Gène B Gène C

  9. RESEAUX DE GENES Le facteur NF-kB Récepteurs Gène A Gène B Gène C

  10. p65 (p52, c-Rel, RelB) p50 IkBa IkBb (IkBe, IkBg, Bcl3, p105, p100) p50 p52 RESEAUX DE GENES Le facteur NF-kB

  11. SITES DE FIXATION DE NF-kB Immunoglobulines Igk : GGGACTTTCC c-myc : GGGAAAACCC TNFa : GGGAATTCAC IL8 : GGAATTTCCT

  12. 0 0,5 1,0 1,5 2,0 2,5 NF-kB actif (nucléaire) temps (h)

  13. RESEAUX DE GENES Le facteur NF-kB Récepteurs Gène A Gène B Gène IkB

  14. RESEAUX DE GENES Le facteur NF-kB Récepteurs Gène A Gène B Gène C

  15. RESEAUX DE GENES Le facteur NF-kB Récepteurs Gène A Gène B Gène C

  16. t < tmax Fonction Pseudo-aléatoire t n (Réaction n) t = t + t Réaction n : (A + B -> AB) A = A - 1 B = B - 1 AB = AB + 1

  17. 30 + 31 32 + 33 34 + 35 36 + 37 38 + 39 40 + 41 42 + 43 44 + 45 46 + 47 48 + 49 50 + 51 52 + 53 54 + 55

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