230 likes | 748 Views
Studiju kurss Bioloģija (nebiologiem). Bloks Šūnas bioloģija, bioķīmija, ģenētika. 4. laboratorijas darbs. Gela elektroforēze un plazmīdu DNS kartēšana. Māris Lazdiņš lazda@latnet.lv LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra. Gelelektroforēzes iekārta. Gelelektroforēzes iekārta.
E N D
Studiju kurssBioloģija (nebiologiem) BloksŠūnas bioloģija, bioķīmija, ģenētika 4. laboratorijas darbs. Gela elektroforēze un plazmīdu DNS kartēšana. Māris Lazdiņšlazda@latnet.lv LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML
Gelelektroforēzes iekārta LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML
Gelelektroforēzes iekārta LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML
Kas ir elektroforēze? Elektroforēzes pamatā ir lādētu daļiņu pārvietošanās elektriskajā laukā. + + + Katods Anods LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML
Elektroforeze - potenciālu starpība starp elektrodiem (V) l – attālums starp elektrodiem lq E – elektriskā lauka intensitāte (stiprums) =/l (V/cm) F =EqF=ma a=F/m=Eq/m + + LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML
Elektroforeze Ja tas notiktu vakumā, lādētās molekulas paātrinātos un ātri sasniegtu elektrodus. Vidē, kurā parasti veic elektroforezi, - viskozitātes dēļ, - dēļ daudzām sadursmēm starp molekulām LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML
Elektroforeze daļiņu kustība ir apgrūtināta, - tā notiek lēnāk, - ir vairāk atkarīga no - daļiņas lieluma un - ģeometriskās formas. LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML
Elektroforeze Sfēriskas daļiņa viskozā vidē: v = Eq/6r Tā kā molekulas viena no otras atšķiras ar savu - lādiņu un - izmēriem, tad pēc noteikta laka elektriskā lauka iedarbībā tās būs veikušas atšķirīgus attālumus. LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML
Elektroforeze Matemātiskie vienādojumi labi apraksta molekulu pārvietošanos viskozā cukuru šķīdumā, bet nav viennozīmīgi attiecināmi uz gelelektroforezi. Šeit papildus notiek gela struktūras un molekulu mijiedarbības. LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML
Elektroforezes vēsture + Pirmās elektroforēzes tika veiktas U veida caurulēs, cukuru šķīdumos. Pētāmo vielu sadalījuma atšifrēšana bija sarežģīta un sadalījums nestabils. LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML
Elektroforezes vēsture Metodi 1937. gadā ieviesa zviedru ķīmiķis Arne Tiselius. (1902 - 1971) Panākumi tika atzinīgi novērtēti. 1948. gadā saņem Nobela prēmiju. LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML
Elektroforezes vēsture Lai būtu vieglāk saglabāt vielu sadalījumu, sāka lietot nesējus: - papīru un - cietes gelus. LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML
Elektroforezes vēsture Taču arī šie nesēji deva diezgan nekvalitatīvu ainu. Vēlāk kā optimālākie nesēji izrādījās: - agarozes un - poliakrilamīda geli. LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML
Elektroforeze nesējos LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML
Elektroforeze nesējos Zonālā ierobežojošā (restriktīvā) elektroforēze LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML
Gelektroforeze Agarozes gels Lietojams molekulām, kuru izmēri ir lielāki par 10 nm. Lieto 2-0,5% . 1% poru izmērs 150 nm. LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML
Pie darba ? LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML