Lecointre et Le Guyader, 2006 (39 €)

1. Lecointre et Le Guyader, 2006 (39 €)

2. Eucaryotes Bactéries Archées L'arbre du vivant Les 10 règnes d'Eucaryotes, les 2 règnes d'Archées et les 5 règnes de Bactéries D'après Wolfe-Simon et al. (2005)

3. Position des Mimivirus dans l’arbre du Vivant Arbre phylogénétique construit à partir des séquences de 7 protéines universellement conservées dans les organismes cellulaires, et toutes présentes chez Mimivirus D’après Raoult et al., 2004.

4. L'appareil cinétique d'une Bactérie Salmonella typhimurium MotAB = moteur basal C rod  sens de la rotation D'après Morgan et Khan (2001)

5. 200 nm Microtubules (tubuline) Prolongement du plasmalemme undulipodium Cinétosome (granule basal) L'appareil cinétique des Eucaryotes : undulipodium et cinétosome D'après Margulis et Schwattz (1985)

6. Différences entre Bactéries et Archées

7. Chlorophylle b Les spectres d'absor-ption des pigments photosynthétiques Béta carotène Phyco-érythrine Bactério-chloro-phylle Chloro-phylla a Longueur d'onde Infra-rouge Bleu Vert Rouge Spectre visible

8. La chlorophylle a CH2 CH CH3 CH3 CH2 CH3 N N En vert : les 4 cycles pyrol Mg N N H CH3 CH3 H H O CH2 C OCH3 CH2 O En bleu : le phytol C O O H H D'après Jeffrey (1989) CH3 CH3

9. Une cellule de Cyanobactérie Paroi cellulaire : contient de la muréine (polymère d'acide di-amino-pimélique, d'acide muramique, etc.) caractéristique des Bactéries Plasmalemme Thylakoïde : Chloro-phylles, xanthophyl-les Cytoplasme Phycobilisomes : Phycoérythrine, phycocyanine, allo-phycocyanine ADN proca-ryo-tique Cyanamylon (proche du glycogène ; polysaccharide ; produit de la photosynthèse) Ribo-some 70S Globule lipidique Airosome (vacuole gazeuse) Granule structuré (réserves protéiques) Carboxysome : enzymes photosynthèse

10. Coefficient d'absorption de la lumière (%) 100 Phycoérythrine (phycobiline). N'absorbe pas dans le rouge 90 80 Phycocyanine (phycobiline). N'absorbe pas dans le bleu 70 Allophycocyanine (phycobiline). N'absorbe pas dans le bleu 60 50 40 Chlorophylle a : deux pics d'absorption. Le bleu et le jaune sont peu absorbés 30 20 10 Longueur d'onde (nm) 400 500 600 700 Spectre d'absorption de la lumière des pigments photosynthétiques D'après Gantt (1990). Noter qu'il s'agit en fait d'une Rhodobionte

11. Bilan en azote de l’océan mondial D’après Kolber (2006)

12. LES 10 RÈGNES D’EUCARYOTES D’après Baldauf (2003, 2008), simplifié et mis à jour (Boudouresque, 2010) Cours C.F. Boudouresque 2010 Bichontes = les 8 autres règnes ARCHAEPLASTIDIA (= PLANTAE) Euglyphides Embryo-biontes Chlorarach-niobiontes Rhodo-biontes Dinobiontes Streptobiontes Cercobiontes Glauco-cysto-biontes ALVÉOLÉS Phytomyxea Charo-phycées Ellobiopsidés Haplo-sporidies Apicomplexes Ciliés Viridiplantae Chloro-phycées Forami-nifères Centro-helida STRAMÉNOPILES Chlorobiontes Chromalvéolés Retaria Actinophryda Radio-laires Labyrinthulobiontes Prasinophycées Oobiontes RHIZARIA Chromobiontes Mycétobiontes Archamaeba Haptobiontes Lobosa Cryptobiontes AMOEBOBIONTES Euglé-noïdes Unichontes Eugléno-biontes Microsporidies Para-basalia Kinéto-plastides Fungi Choanoflagellés Acrasiobiontes (= Heterolobosa) Diplo-monadines Retorta-mona-dines Oxymo-nadines Métazoaires (= animaux) Percolobiontes EXCAVATES DISCICRISTATES OPISTHOCHONTES

13. Ce que la tradition (au sens large) a nommé ‘végétaux’ : un ensemble polyphylétique Il manque ici les Procaryotes : Cyanobactéries (‘algues bleues’), Actinobactéries et Planctobactéries Bichontes = les 8 autres règnes ARCHAEPLASTIDIA (= PLANTAE) Euglyphides Embryo-biontes Chlorarach-niobiontes Rhodo-biontes Dinobiontes Streptobiontes Cercobiontes Glauco-cysto-biontes ALVÉOLÉS Phytomyxea Charo-phycées Ellobiopsidés Haplo-sporidies Apicomplexes Viridiplantae Ciliés Chloro-phycées Forami-nifères Centro-helida STRAMÉNOPILES Chlorobiontes Chromalvéolés Retaria Actinophryda Radio-laires Labyrinthulobiontes Prasinophycées Oobiontes RHIZARIA Chromobiontes Mycétobiontes Archamaeba Haptobiontes Lobosa Cryptobiontes AMOEBOBIONTES Euglé-noïdes Unichontes Eugléno-biontes Microsporidies Para-basalia Kinéto-plastides Fungi Choanoflagellés Acrasiobiontes (= Heterolobosa) Diplo-monadines Retorta-mona-dines Oxymo-nadines Métazoaires (= animaux) Percolobiontes EXCAVATES DISCICRISTATES OPISTHOCHONTES

14. Ce que la tradition a nommé ‘Algues’ : un ensemble polyphylétique Il manque ici les Procaryotes : Cyanobactéries, D’après Baldauf (2003, 2008), simplifié et mis à jour (Boudouresque, 2010) Bichontes = les 8 autres règnes ARCHAEPLASTIDIA (= PLANTAE) Euglyphides Embryo-biontes Chlorarach-niobiontes Rhodo-biontes Dinobiontes Streptobiontes Cercobiontes Glauco-cysto-biontes ALVÉOLÉS Phytomyxea Charo-phycées Ellobiopsidés Haplo-sporidies Apicomplexes Ciliés Viridiplantae Chloro-phycées Forami-nifères Centro-helida STRAMÉNOPILES Chlorobiontes Chromalvéolés Retaria Actinophryda Radio-laires Labyrinthulobiontes Prasinophycées Oobiontes RHIZARIA Chromobiontes Mycétobiontes Archamaeba Haptobiontes Lobosa Cryptobiontes AMOEBOBIONTES Euglé-noïdes Unichontes Eugléno-biontes Microsporidies Para-basalia Kinéto-plastides Fungi Choanoflagellés Acrasiobiontes (= Heterolobosa) Diplo-monadines Retorta-mona-dines Oxymo-nadines Métazoaires (= animaux) Percolobiontes EXCAVATES DISCICRISTATES OPISTHOCHONTES

15. Ce que la tradition a nommé ‘champignons’ Il manque ici les Procaryotes : Planctobactéries et Actinobactéries D’après Baldauf (2003, 2008), simplifié et mis à jour (Boudouresque, 2010) Bichontes = les 8 autres règnes ARCHAEPLASTIDIA (= PLANTAE) Euglyphides Embryo-biontes Chlorarach-niobiontes Rhodo-biontes Dinobiontes Streptobiontes Cercobiontes Glauco-cysto-biontes ALVÉOLÉS Phytomyxea Charo-phycées Ellobiopsidés Haplo-sporidies Apicomplexes Ciliés Viridiplantae Chloro-phycées Forami-nifères Centro-helida STRAMÉNOPILES Chlorobiontes Chromalvéolés Retaria Actinophryda Radio-laires Labyrinthulobiontes Prasinophycées Oobiontes RHIZARIA Chromobiontes Mycétobiontes Archamaeba Haptobiontes Lobosa Cryptobiontes AMOEBOBIONTES Euglé-noïdes Unichontes Eugléno-biontes Microsporidies Para-basalia Kinéto-plastides Fungi Choanoflagellés Acrasiobiontes (= Heterolobosa) Diplo-monadines Retorta-mona-dines Oxymo-nadines Métazoaires (= animaux) Percolobiontes EXCAVATES DISCICRISTATES OPISTHOCHONTES

16. Ce que la tradition a nommé ‘algues’ (en vert) et ‘protozoaires’ (en jaune) En bleu : taxons revendiqués par les ‘botanistes’ et les ‘zoologistes’ D’après Baldauf (2003, 2008), simplifié et mis à jour (Boudouresque, 2010) Bichontes = les 8 autres règnes ARCHAEPLASTIDIA (= PLANTAE) Euglyphides Embryo-biontes Chlorarach-niobiontes Rhodo-biontes Dinobiontes Streptobiontes Cercobiontes Glauco-cysto-biontes ALVÉOLÉS Phytomyxea Charo-phycées Ellobiopsidés Haplo-sporidies Apicomplexes Ciliés Viridiplantae Chloro-phycées Forami-nifères Centro-helida STRAMÉNOPILES Chlorobiontes Chromalvéolés Retaria Actinophryda Radio-laires Labyrinthulobiontes Prasinophycées Oobiontes RHIZARIA Chromobiontes Mycétobiontes Archamaeba Haptobiontes Lobosa Cryptobiontes AMOEBOBIONTES Euglé-noïdes Unichontes Eugléno-biontes Microsporidies Para-basalia Kinéto-plastides Fungi Choanoflagellés Acrasiobiontes (= Heterolobosa) Diplo-monadines Retorta-mona-dines Oxymo-nadines Métazoaires (= animaux) Percolobiontes EXCAVATES DISCICRISTATES OPISTHOCHONTES