1 / 17

Molekulāro marķieru pielietojums gēnu kartēšanā un selekcijā

Molekulāro marķieru pielietojums gēnu kartēšanā un selekcijā . Dr. biol. Nils Rostoks Latvijas Universitāte. „Videi draudzīgu un ilgtspējīgu laukaugu šķirņu selekcijas tehnoloģiju izstrāde, pilnveidošana un ieviešana praksē” 2009/0218/1DP/1.1.1.2.0/09/APIA/VIAA/099. Darba mērķis .

patty
Download Presentation

Molekulāro marķieru pielietojums gēnu kartēšanā un selekcijā

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. Molekulāro marķieru pielietojums gēnu kartēšanā un selekcijā Dr. biol. Nils Rostoks Latvijas Universitāte „Videi draudzīgu un ilgtspējīgu laukaugu šķirņu selekcijas tehnoloģiju izstrāde, pilnveidošana un ieviešana praksē” 2009/0218/1DP/1.1.1.2.0/09/APIA/VIAA/099

  2. Darba mērķis Izstrādāt un adaptēt molekulāros marķierus videi draudzīgā lauksaimniecībā nozīmīgām augu pazīmēm 2009/0218/1DP/1.1.1.2.0/09/APIA/VIAA/099

  3. Molekulāro marķieru priekšrocības selekcijā • Ļauj būtiski saīsināt selekcijas laiku, jo dod iespēju jau agrīnās paaudzēs identificēt indivīdus ar noteiktu genotipu (gēnu alēļu kombināciju) , apejot ilgstošus, darbietilpīgus lauka izmēģinājumus • Ļauj identificēt indivīdus ar noteiktām gēnu alēļu kombinācijām, kuras nav iespējams noteikt fenotipiski lauka izmēģinājumos 2009/0218/1DP/1.1.1.2.0/09/APIA/VIAA/099

  4. Fenotipiskā un ģenētiskā dauzveidība Fenotipiskā daudzveidība atspoguļo atšķirības dažādu miežu šķirņu genomā 2009/0218/1DP/1.1.1.2.0/09/APIA/VIAA/099

  5. Marķieri Almost all aspects of life are engineered at the molecular level, and without understanding molecules we can only have a very sketchy understanding of life itself Francis Crick Tāpat kā ceļojumā orientēties palīdz ceļa stabi, genomā orientēties palīdz DNS marķieri Atšķirības genoma DNS sekvencē kalpo kā molekulārie marķieri genoma kartēšanai 2009/0218/1DP/1.1.1.2.0/09/APIA/VIAA/099

  6. No pazīmes līdz polimorfismam gēna sekvencē Pazīme Miežu genoms 5x109bp Pazīmi nosakošā gēna sekvence 2009/0218/1DP/1.1.1.2.0/09/APIA/VIAA/099

  7. Darba virzieni • Iepriekš izveidotu marķieru ieviešana selekcijas darbā • Publicētu marķieru adaptācija • Jaunu gēnu kartēšana un marķieru izveide 2009/0218/1DP/1.1.1.2.0/09/APIA/VIAA/099

  8. Marķieru ieviešana Miežu mloun Mla18 • Sekmīga sadarbība ar VPLSI Augu biotehnoloģijas un kvalitātes laboratoriju Mla18 mlo-11 2009/0218/1DP/1.1.1.2.0/09/APIA/VIAA/099

  9. Rezistences gēnu piramidēšana 2009/0218/1DP/1.1.1.2.0/09/APIA/VIAA/099

  10. Marķieru adaptēšana • Latvijas Universitātes un VPLSI sadarbība • Zinātniskās literatūras studijas • PCR apstākļu optimizācija, lietderības pārbaude citā selekcijas materiālā, atsevišķos gadījumos jaunu marķieru veidošana uz esošo bāzes • Miežu Un8 un fuzariozes izturības gēnu marķieri. Kartupeļu R1, R3a, Rystogēnu marķieri 2009/0218/1DP/1.1.1.2.0/09/APIA/VIAA/099

  11. Marķieru adaptēšana Un8 Rezistentās un uzņēmīgās alēles DNS sekvenēšana Publicēts marķieris Pārbaude LU un VPLSI Jauna, kodominantaUn8 marķiera Izveide LU un VPLSI 2009/0218/1DP/1.1.1.2.0/09/APIA/VIAA/099

  12. Jaunu marķieru veidošana • Gēnu un kvantitatīvo pazīmju lokusu kartēšana • Ilgstošs process, parasti analizē pazīmju iedzimtību divu vecāku krustojumu pēcnācējos • Kartēšanas populācijas fenotipēšana un genotipēšana 2009/0218/1DP/1.1.1.2.0/09/APIA/VIAA/099

  13. Asociāciju kartēšana • 154 Latvijas un ārzemju miežu šķirnes un selekcijas līnijas • Fenotipēšana 3 sezonu laikā (dotajā brīdī kartēšana balstīta uz 2 sezonu izmēģinājuma datiem), VSGSI, VPLSI, bioloģiskie un konvencionālie atkārtojumi • Genotipēšana 3072 punktveida mutāciju (SNP), veikta kā pakalpojums sadarbībā ar ASV un Lielbritānijas zinātniekiem 2009/0218/1DP/1.1.1.2.0/09/APIA/VIAA/099

  14. SNP lokusu identificēšana Pazīme – auga garums 1435-670, 3H, 114 cM Pazīme – proteīna saturs % 6519-812, 4H, 103.1 cM 2009/0218/1DP/1.1.1.2.0/09/APIA/VIAA/099

  15. Marķieru izveide Molekulāro marķieru izveide izvēlētām pazīmēm. Izvēlētā genoma rajona PCR amplifikācija un DNS polimorfisma noteikšana izmantojot restriktāzes Pazīme – auga garums Pazīme – proteīna saturs % 5945-748 Bsh1236I 1435-670 TaqI 2009/0218/1DP/1.1.1.2.0/09/APIA/VIAA/099

  16. 2009/0218/1DP/1.1.1.2.0/09/APIA/VIAA/099

  17. Aktivitātes realizācija: • LU (Nils Rostoks un viens tehniskais izpildītājs) • VPLSI (Ieva Mežaka un Daiga Vilcāne) • Pateicības: • VIAA par atbalstu projekta realizācijā • VPLSI kolēģiem par sadarbību • LU par atbalstu projekta administrēšanā 2009/0218/1DP/1.1.1.2.0/09/APIA/VIAA/099

More Related