400 likes | 1.05k Views
Chapter 36: Clinical microbiology. Näytteenotto. Pumpulituppo, kurkku Neula, veri Putki, ohut-/paksusuoli Ulostenäytteet Virtsanäytteet. Nielunäyte. pumpulituppo. Veri-/selkäydinäyte. Tavallisesti, veri on steriiliä. Kolonoskopia/ sisätähystys (=endoskopia). paksusuoli. mahalaukku.
E N D
Näytteenotto • Pumpulituppo, kurkku • Neula, veri • Putki, ohut-/paksusuoli • Ulostenäytteet • Virtsanäytteet
Nielunäyte pumpulituppo
Veri-/selkäydinäyte • Tavallisesti, veri on steriiliä
Kolonoskopia/sisätähystys (=endoskopia) paksusuoli mahalaukku
Anaerobinen kuljetus Redox indikatori
Säilytys • Viljely: +4°C, vähän aikaa • Ulostenäytteet anaerobisesti • Molekyylibiologiset tekniikat: -70°C, monta vuotta
Mikrobien identifiointi • Virukset • homeet/hiivat • Bakteerit • Riketsia, klamydia, mykoplasma • Parasiitit
Virusten identifiointi • Soluviljely • Immunologiset tekniikat • Fluoresoivat merkkityt vasta-aineet • ELISA • Lateksi agglutinaatio • Molekyylibiologiset tekniikat • PCR
Virusten identifiointi ELISA
Virus Virus Virus Virus Virus Virus Virus Virus Virusten identifiointi Lateksi agglutinaatio
Sieni/hiiva identifiointi • Morfologia • Biokemialliset ominaisuudet • Calcofluor valkoinen värjäys (kiinnittyy kitiiniin)
Parasiittien identifiointi • Suoraan näytteestä (mikroskopointi) • Immunologiset testit Nematodit Plasmodium vivax (malaria)
Bakteerien identifiointi • Selektiiviset mediumit: • vain yksi bakteeriryhmä kasvaa, muuiden bakteerien kasvu estynyt Gram - Gram + Gram - Gram +
Bakteerien identifiointi • Differentiaaliset mediumit MacConkey agar (selektiivinen ja differentiaalinen) Pseudomonas aeruginosa Escherichia coli
Bakteerien identifiointi • Rikastus liuos • Jos näyte sisältää vähän bakteereja (veri, selkäydinneste, jne.). • Bakteerien näytteenotto • selektiiviset agarit • differentiaaliset agarit
Gram värjäys Gram + Gram -
- + Happo - + + - + Kaasu - - + - + Hiilihydraattifermentaattio Glukoosi
Katalaasitesti katalaasi H2O2 O2 + H2O
Oksidaasitesti Sytokromioksidaasin läsnäolo aeroobeja
Liikkuvuustesti pehmeäagari
Koagulaasi- testi Gelatinaasitesti verihyytymä - + + Koagulaasi- ja gelatinaasitesti
Ureaasitesti ureaasi Urea CO2 + 2NH3
Riketsia, klamydia, mykoplasma • Riketsia: immunologiset testit (ELISA) • Klamydia: Giemsa värjäys • Mykoplasma: vasta-aine titteri inclusion body
Testit ilman viljelyä • Immunologiset testit • DNA hybridisaatio • Plasmidi sormenjälki • 16S rRNA sekvenssi • PCR
Immunologiset testit Bactigen Staphaurex (lateksitesti)
DNA hybridisaatio DNA probi Tuntematon DNA hybridisaatio substraati väri
AVAINSANAT (1) • Näytteenotto • Näytteensäilytys • Virusten identifiointi: immunologiset tekniikat • Sieni/hiiva identifiointi: Calcofluorvärjäys • Parasiittien identifiointi: immunologiset tekniikat
AVAINSANAT (2) • Bakteerien identifiointi: • selektiiviset, differentaaliset mediumit, Gram väräys • Biokemiset testit: • hiilihydraattifermentaatio, katalaasi-, oksidaasi-, liikkuvuus-, koagulaasi-, gelatinaasi-, ureaasitesti • Viljetön testit • Immunologiset testit, DNA hybridisaatio, Plasmidi sormenjälki, 16S rRNA sekvenssi, PCR