1 / 25

RNA ve miRNA

RNA ve miRNA. Merve YÜRÜK ERCİYES ÜNİVERSİTESİ PARAZİTOLOJİ AD. Post- transkripsiyonel kontrrol mekanizması: interferens RNA. Kodlanan RNA Kodlanmayan RNA (ncRNA). Non-Coding RNA : önceleri hurda diye bilinirdi!!!. siRNA nedir?. Küçük kodlama yapmayan , çift zincirli RNA

asha
Download Presentation

RNA ve miRNA

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. RNA ve miRNA Merve YÜRÜK ERCİYES ÜNİVERSİTESİ PARAZİTOLOJİ AD.

  2. Post-transkripsiyonelkontrrol mekanizması: interferens RNA

  3. Kodlanan RNA • Kodlanmayan RNA (ncRNA)

  4. Non-Coding RNA: önceleri hurda diye bilinirdi!!!

  5. siRNA nedir? • Küçük kodlama yapmayan , çift zincirli RNA • 20-25 nt uzunluğunda • 3’ uçta 2 nt’ lik çıkıntı • Virüslerde bulunur, memeliler için eksojen kaynaklı • Primer siRNA, sekonder siRNA, tasiRNA, natsiRNA

  6. miRNA nedir? • Küçük kodlama yapmayan , çift zincirli shRNA • 19-20 nt uzunluğunda • Komplementeri olan iplikle aktifleşme • Omurgalı ve omurgasızlar arasında korunmuşlardır • Kurt, mantar, bitki ve memeli….

  7. miRNA ile siRNA arasındaki fark?

  8. miRNA avantaj ve dezavantajları Avantajlar: – RNA ile çalışmaya gerek yoktur – DNA taşıma ve dağıtım yöntemleri iyi bilinmektedir – Geçici veya sabit ifade – Uzun vadeli denemeler için uygun maliyetli – İndüklenebilir ekspresyon sistemleri mevcuttur – havuz taramak mümkündür Dezavantajlar: – Klonlama ve doğrulama eklemeye ihtiyaç duyar – Vektör hazırlama ve transfeksiyon deney sürecinde zaman gerektirir – genom içine entegrasyon kısımları içerir

  9. siRNA avantaj ve dezavantajları Avantajları: – Kullanmak için hazır reaktifler mevcuttur,araştırmacılar için fazla zaman tutmaz,spesifik bir geni knock down etmenin en hızlı yoludur – siRNAs etiketli olabilir – genellikle oldukça kolay transfeksiyon – vektör ile sürüm yaklaşımına göre siRNA miktarının kontrolü daha doğru ve kesindir – hedef dışı ve nonspesifik etkiler minimize edilmiştir – kimyasal değişimlerle stabiliteyi arttırmak mümkündür Dezavantajları: – Daha büyük deneyler için pahalıdır – İndüklenemeyen ifade – Sadece kısa dönem, geçici knock down – Uzun süreli çalışmalar için kullanışlı değildir

  10. Mekanizmayı uyaran nedir?

  11. Pri-miRNA • Birincil miRNA nükleusta ifade edilir ve genellikle birkaç kb uzunluğunda, • 5’ cap ve poli A kuyruğu işlenmiştir.

  12. Nükleusta Drocha enzimi ile kesilerek 70 nt lik saç tokası transkriptleri oluşturulur.

  13. Dicer enziminin domain yapısı

  14. 1. Nükleusta 2. sitoplasmada

  15. Tanınmayı sağlayan uçlar

  16. Argonaute proteininin domain yapısı • N terminal, • PAZ; domaini rehber zincirin 3´ ucuna bağlanmada • MID; stabil olan zincirin tanınması • PIWI;hedef mRNA’nın kesiminde

  17. Argonaute proteininin domain yapısı

  18. Gen ifadesinin engellenmesi

  19. Sonuç olarak; • RNA interferans, transkripsiyon sonrası gen ekspresyonunun susturulması/baskılanması için etkili bir metotdur. • Bu mekanizma doğada var olan bir mekanizma olup, aynı zamanda moleküler biyolojide gen-protein işlevi analizinde, fonksiyonel genomik araştırmalarında ve • Gen tedavisinde geniş bir uygulama alanına sahiptir.

  20. Teşekkürler…

More Related