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Introdução aos Scratchpads: Aproveitando melhor seus dados

Introdução aos Scratchpads: Aproveitando melhor seus dados. Brazil November, 2012. Laurence Livermore Natural History Museum, London l.livermore@nhm.ac.uk. O que é Scratchpads?. Sítios prontos para dados de biodiversidade, com apoio institucional

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Introdução aos Scratchpads: Aproveitando melhor seus dados

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Presentation Transcript

  1. Introdução aos Scratchpads:Aproveitando melhor seus dados Brazil November, 2012 Laurence Livermore Natural History Museum, London l.livermore@nhm.ac.uk

  2. O que é Scratchpads? • Sítios prontos para dados de biodiversidade, com apoio institucional • Plataforma virtual para pesquisa e publicação • Acesso livre, fonte livre • Modular e flexível

  3. O que Scratchpads não é! • Um banco de dados unitário de biodiversidade • Restringido por tema, geografia ou táxon • Uma ferramenta excluisiva aos taxonomistas

  4. De onde vêm os recursos financeiros? 2011 2007 2014 ViBRANT Virtual Biodiversity Research &

  5. Exemplos de utilização: Taxa (Classificações, pérfis de táxons, espécimes, literatura, imagens, mapas, conjuntos de dados do fenótipo, genótipo, de morfometria, chaves, filogenias) Conservação Projetos Regiões Sociedades

  6. Quem usa Scratchpads? Users Sites SP 2 ViBRANT • Pesquisadores profissionais • Naturalistas amadores • Cientistas cidadão • Indivídos, grupos e sociedades • No. total de sítios: 400+ • No. total de usuários: 7,000+ • Usários ativos: 5,500+ (273 w / 759 m) • Contéudo : 430,000+ (nodos)

  7. eMonocot Scratchpads • 15 sítios e crescendo • 40+ usuários internacionais • Scratchpads / eMonocot Portal online! Listagem dos sítios: http://about.e-monocot.org/list-emonocot-scratchpads

  8. Por que Scratchpads? • A Ciência é global • Precisa de padronização global • Workflows globais • Cooperação de institutos e organizações de grande porte

  9. Por que Scratchpads? • Ciência é realizada “locally” • Por cientistas do local • Em colaboração com infraestruturas locais • Com apoio financeiro do local

  10. Por que Scratchpads? • Isso resulta em : • Uma paisagem complexa, fragmentada e de navegação difícil • Fontes dispersas de dados • Dificuldades em coletar informações para pesquisa

  11. Porque precisa mudar? • Problemas com dados publicados pela maneira tradicional: • Maioria de descrições sob controle de reprodução (~1923) • Acesso Livre limitado • Ausência de mecanismo para atualização e correção • Ausência (quase) de integração de dados (exceto citações) • Ausência de mecanismos para engajar a comunidade

  12. Porque precisa mudar? • Resultado: • Grandes quantidades de “conhecimento” taxonômico não publicado • Conhecimento não publicado não pode ser mobilisado para fins úteis • Impact científico baixo (mas longa meia-vida)

  13. O Conceito Scratchpad • Um Scratchpad é sítio que abriga dados para voce e sua comunidade Dados externos e serviços Seus dados

  14. O que pode fazer Scratchpads? • Páginas de taxon (geradas a partir de conteúdo etiquetado) • Mapas de distribuição (a partir de espécimes e regiões TDWG - Brummitt, 2001) • Registros de espécimes • Matrizes de caracteres

  15. Example Taxon Page

  16. Example regional distribution

  17. O que pode fazer Scratchpads? • Gerência de bibliografia • Imagens, video e som (importação em massa) • Importação de planilhas Excel

  18. Example Literature

  19. O que pode fazer Scratchpads? • Editação de dados em tabela • Conteúdo específico ao pedido de usuário • Gerenciamento dos usuários • Formulários (planilhas) específico ao pedido de usuário • Medidas analíticas do uso do sítio.

  20. Medidas analíticas

  21. O que pode fazer Scratchpads? • Exportação de Darwin Core Archive (links a eMonocot Portal e EOL) • Importação de dados de EOL (taxonomia, informação sobre espécies) • Integração de mapas da GBIF

  22. Importação e exportação de dados de Scratchpads

  23. Quais novas funções vêm logo? • Chaves baseadas em matrizes (usando projeto de caracteres) • Ferramenta para publicação- submeter manuscritos pelo seu site para Phytokeys ou Biodiversity Data Journal (NOVO) • Checklists, apoio para linguagens múltiplas, outros!

  24. Amostras do protótipo: ferramenta de publicação Manuscript preview Multi-figure plates Plate layout ID Key preview ID Key builder

  25. Apoio • In-site Support • One click help within your site • Wiki • Training manuals, videos & glossary • Training Courses (12 in 2012) • UK (6), Sweden, (2) Greece (1), Bulgaria (1), South Africa (1), Brazil (1) • Ambassadors Programme • Enthusiastic experienced users • Local support • Embedded Issues Queue • Bug reports • Feature requests • Sandbox Site • http://sandbox.scratchpad.eu http://scratchpad.eu/help

  26. Agradecimentos • Scratchpad technical development • Simon Rycroft, Ben Scott, Ed Baker, Alice Heaton & Katherine Boulton • Scratchpad outreach • Irina Brake & Dimitris Koureas • E-Monocot • Paul Wilkin & the Kew team, Charles Godfray & the Oxford team • ViBRANT • Vince Smith, Dave Roberts & Lucy Reeve • Our 7,000+ users

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