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1 K M 1 1 Vo= Vmax [S] + Vmax. Y = m x + b. = m. = b. INHIBICIÓN DE LA ACTIVIDAD ENZIMÁTICA Compuestos que bloquean la actividad enzimática Pueden ser parecidos o no al sustrato. INHIBICIÓN COMPETITIVA. Dihidrofolato. Dihidrofolato reductasa.
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1 KM 1 1 Vo= Vmax [S] + Vmax Y = m x + b = m = b
INHIBICIÓN DE LA ACTIVIDAD ENZIMÁTICA Compuestos que bloquean la actividad enzimática Pueden ser parecidos o no al sustrato
INHIBICIÓN COMPETITIVA Dihidrofolato Dihidrofolato reductasa Inhibe reductasa: elimina biosíntesis DNA Preferencia por células en proliferación Precursor de timidina: biosíntesis DNA
INHIBICIÓN COMPETITIVA [E]T= [E] +[EI] +[ES] I reduce [E] disponible para S Vo= Vmax [S] / aKM + [S] a = ( 1 + [I]/Ki ) m= aKM/Vmax Incremento inhibidor 1/Vmax a= 1
m= a KM / Vmax a= 1 1/Vmax no cambia: se intersectan: INH. COMPETITIVO Sustrato se percibe como diluido -1/ a KM INH. COMPETITIVOS IRREVERSIBLES: REDUCEN [E] LIBRE A CUALQUIER VALOR DE [Sustrato]
INHIBICIÓN ACOMPETITIVA I a’/Vmax 1 KM 1 a’ Vo= Vmax [S] + Vmax (NO SE EVITA UNIÓN AL SUSTRATO, PERO SI LA TRANSFORMACIÓN A PRODUCTO) 1/V a’ = ( 1 + [I]/K’i ) a’ =2 a’ =1.5 a’ =1 m= KM/Vmax 1/[S] -a’ / KM
1/V a’ =2 a’ =1.5 a’/Vmax a’ =1 m= KM/Vmax 1/[S] -a’ / KM [S] precisa para alcanzar 1/2 vmáx serámenor. No es que haya aumentado la afinidad de E por S: se mantiene igual, pero como la vmáx ha disminuido, se precisará menor [S] para alcanzar 1/2 vmáx y por eso la Km disminuye -y la afinidad aumenta- "aparentemente". Kmaparente DISMINUYE en la misma proporción que la vmáx(como el I se une al complejo ES, su presencia se manifiesta también a elevadas [S], por lo que disminuye vmáx).
INHIBICIÓN MIXTA (NO COMPETITIVA) (INHIBIDOR SE UNE A LA ENZIMA LIBRE O AL COMPLEJO ES) a’ a 1/V m= a KM/Vmax Vmáx DISMINUYE (no se compensa por elevadas [S] a’ =1.5 a’/Vmax a’ y a =1 1/[S] -1 a’ / a KM
INHIBICIÓN COMPETITIVA: Si se alcanza Vmax, pero se requiere más [S] Se requiere más [S] para Vmax/2 \ KM es mayor (aKM) INHIBICIÓN ACOMPETITIVA : La Velocidad se reduce para cualquier [S] Vmax y Vmax/2 se reducen KM cambia INHIBICIÓN MIXTA (NO COMPETITIVA): Disminuye Vmax y Vmax/2 KM DISMINUYE APARENTEMENTE
EFECTO DEL pH Enzimas generalmente activas a pH 5-9 Puede alterar: Unión sustrato-enzima Actividad catalítica Ionización del sustrato Variación de la estructura de la proteína Cambios en pH alteran el estado de ionización de aa cargados (e.g., Asp, Lys): unión a sustrato o acción catalítica Actividad enzimática pH
k1 k2 EH + S ES P + E k-1 E- ES- H+ KE2 KES2 H+ H+ KES1 H+ KE1 EH2+ ESH2+- Ctes. Ionización de las enzimas KE2
pK’s ´de aminoácidos esenciales para la actividad Aa ionizables en sitios activos como Aspartato Histidina Glutamato Lisina pK 4 pK 6-10 Recordar que: Las interacciones entre grupos cargados cercanos Y/o con regiones de baja polaridad: Cambian pK´s
Actividad enzimática Temperatura °C Puentes de hidrógeno se rompen por incrementos de temperatura : altera la conformación 3D
REGULACIÓN DE LA ACTIVIDAD ENZIMÁTICA Actividad eficiente y bien coordinada: 1) CONTROL DE LA DISPONIBILIDAD DE LA ENZIMA SÍNTESIS Y DEGRADACIÓN DE LA ENZIMA 2) CONTROL DE LA ACTIVIDAD ENZIMÁTICA CAMBIOS ESTRUCTURALES
2) CONTROL DE LA ACTIVIDAD ENZIMÁTICA: CAMBIOS ESTRUCTURALES Anclaje a membranas Precursores inactivos: proteasas: pepsinógeno/ pepsina: hidrólisis de porción inhibitoria por pH ALOSTERISMO MODIFICACIÓN COVALENTE
ALOSTERISMO Las enzimas alostéricas poseen, además del centro catalítico, otro espacio al que se enlaza de modo reversible y no covalente el efector o modulador. En general, el centro alostérico es tan específico para la unión del modulador como el centro catalítico (o centro activo) lo es para la unión del sustrato.
Los moduladores pueden aumentar la actividad enzimática y llamarse moduladores activos o estimuladores (Activación por precursor ) También hay moduladores negativos o inhibidores, que actúan dificultando la actividad enzimática (es el caso de la inhibición por el producto final, inhibición feed-back o retroinhibición).
Cooperatividad Las enzimas alostéricas no muestran generalmente la clásica relación cinética de Michaelis-Menten entre [S], vmáx y Km. Muchas presentan una gráfica sigmoidea en vez de hiperbólica cuando se representa la velocidad en función de la [S]. Esto es un ejemplo de cooperatividad positiva (la unión de una molécula de sustrato a un centro incrementa la unión de las moléculas de sustrato a los demás centros). No todas las enzimas alostéricas exhiben curvas sigmoidales al representar v0 frente a [S]; además, no todas las enzimas que muestran tales curvas son necesariamente alostéricas. Otras enzimas presentan cooperatividad negativa: la unión de una molécula de sustrato provoca un descenso en la unión de moléculas de sustrato subsiguientes
Respuesta a corto plazo Reversible MODIFICACIÓN COVALENTE
Alteración ESTRUCTURA-FUNCIÓN Unión grupos químicos PO43- ,-CH3, -adenil Formación enlaces covalentes Intra/intermoleculares (-SH HS- S-S)
S - Cys Cys SH S - Cys HS Cys Cys SH .