1 / 12

ODDĚLENÍ BIOFYZIKY

ODDĚLENÍ BIOFYZIKY. Členové oddělení : 6 Pracovníků Studenti (Ph.D., Mgr., Bc.) Sídlo: Ke Karlovu 5: blok pracoven a laboratoří ve 2. patře laboratoře ve 2. suterénu Domácí stránka: http://alma.karlov.mff.cuni.cz/biofyzika /. S. cerevisiae. VÝZKUMNÉ AKTIVITY. K. lactis.

brent
Download Presentation

ODDĚLENÍ BIOFYZIKY

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. ODDĚLENÍ BIOFYZIKY Členové oddělení: 6 Pracovníků Studenti (Ph.D., Mgr., Bc.) Sídlo: Ke Karlovu 5: • blok pracoven a laboratoří ve 2. patře • laboratoře ve 2. suterénu Domácí stránka: http://alma.karlov.mff.cuni.cz/biofyzika/

  2. S. cerevisiae VÝZKUMNÉ AKTIVITY K. lactis Buněčné linie – KBV buňky • Transportní procesy v kvasinkách • Metody studia buněčných stěn kvasinek • Transmembránový transport léčiv v buněčných liniích • Výzkum strukturně funkčních vlastností proteinů

  3. FLUORESCENČNÍ SONDY Sondují své okolí = citlivě reagují na změny prostředí. Reakce jsou opticky DETEGOVATELNÉ = změny emisních parametrů. Látky vykazující silnou fluorescenci po ozáření excitačním světlem vhodné vlnové délky.

  4. MIKROBIOLOGICKÉ LABORATOŘE • možnost kultivace buněčných kultur (kvasinky, buněčné linie) • provádění biologických testů přímo ve Fyzikálním ústavu UK Laboratoř pro kultivaci kvasinek a buněčných linií –2. patro Laboratoř pro kultivaci kvasinek–2. suterén

  5. SPEKTROSKOPICKÉ LABORATOŘE 2. patro 2. suterén Laboratoře pro měření stacionární fluorescence Laboratoř pro měření časově rozlišené fluorescence–2. suterén

  6. POUŽÍVANÉ METODY • Fluorescenční spektroskopie • stacionární • časově rozlišená • Fluorescenční mikroskopie • Modelování biologických procesů • Vývoj experimentálních a analytických metod Ve spolupráci s dalšími pracovišti • AFM (Atomic Force Microscopy) (ÚMCH) • Konfokální mikroskopie (ÚEM)

  7. Studium transportních procesů v membránách kvasinek • Regulace membránového potenciálu a vnitrobuněčného pH kvasinek • Vliv chemických stresorů na membránový potenciál aaktivitu MDR (Multidrug resistance) pump kvasinek: identifikace jejich inhibitorů • Interakce léčiv s povrchovými strukturami kvasinkových buněk (BS, PM): stanovení mechanismu a rychlosti účinku Schematické znázornění membrán a vnitřní struktury kvasinek (vlevo), a jejich elektronově mikroskopický snímek (vpravo)

  8. Studium MDR pump v rakovinných buňkách • Aktivita MDR pump (P-glykoprotein, MRP1, BCRP) v buněčných liniích a identifikace jejich inhibitorů • Studium mechanismů vyvolávajících buněčnou smrt rakovinných buněk • Transmembránový transport léčivv buněčných liniích Fluorescence DiSC3(3) vKBV buňkách obsahujícíchP-glykoprotein

  9. 5mm 1mm Studium buněčné stěny kvasinek pomocí fluorescenční mikroskopieaAFM Fluorescenční mikroskopie stěny kvasinek S. cerevisiae barvených calcofluorem. Vlevo je neobvyklé seskupení starých buněk, které ztratily schopnost dokončit proces dělení. Zobrazení stěny kvasinky S. cerevisiae pomocí Atomic Force Microscopy (AFM): jizvy po pučení – náhled (vlevo) a detailní snímek jedné z nich (vpravo).

  10. Studium strukturně funkčních vlastností proteinů, biosenzory, vývoj pokročilých fluorescenčních technik Vliv vazby glukózy a vápníku na dynamiku a termální stabilitu transportéru D-Galaktózy/D-Glukózy z Escherichiacoli Odezva fluorescence pyruvát kinázy na přítomnost sodíku: časově rozlišené měření ve frekvenční doméně Sledování vlivu vazby proteinu 14-3-3 na fosforylovaný mutant proteinu FoxO-SC s tryptofanem v pozici 183: tryptofanová fluorescence, časově korelované čítání fotonů, analýzametodou maximální entropie

  11. Zahraniční spolupráce • Prof. B.D. Lemire, University of Alberta,Edmonton, AB, CANADA • Prof. D. Stuart, University of Alberta,Edmonton, AB, CANADA • Prof. J.C. Lee, UTMB, Galveston, Texas, USA • Prof. M. Hoefer, Dr. J. Ludwig,RFW University, Bonn, GERMANY • Prof. M. Ameloot, LUC Diepenbeek, BELGIUM • Prof. S. d’Auria, Inst. of Protein Biochemistry, CNR, Naples, ITALY • Prof. S. Milewski, Dept. of Pharmaceutical Technology and Biochemistry, Gdansk, POLAND • Prof. P. Miškovský, Dept. of Biophysics, P.J.Safarik University, Kosice, Slovakia • Prof. Y. Gbelská, Dept. of Microbiology and Virology, Bratislava, Slovakia

  12. Domácí spolupráce PřF UK • Dr. T. Obšil- struktury a funkceregulačníchbílkovin (AFX, 14-3-3, Fosducin) • Prof. Z. Palková - kvasinkovékolonie, příprava mutantních kmenů AV ČR • Dr. K. Sigler, MBÚ- studiummnohočetnélékovérezistence astresu u kvasinek • Ing. A. Pichová, MBÚ- struktura buněčné stěny u kvasinek, replikativní stárnutí buněk • Dr. H. Sychrová, FgÚ- úloha transportních systémů K+ v regulaci DY - mutantní kmeny, heterologní exprese genů z jiných organismů • Dr. V. Obšilová, MBÚ-molekulárníbiologie, proteinová chemie • Dr. J. Malínský, ÚEM- procesy v buněčném jádře, membrány • Dr. P. Ježek, FgÚ– Biplane FPALM mikroskopie a mitochondrie • Dr. J. Janata, Dr. A. Matušková,MBÚ– regulacemitochondriálnípeptidázy(MPP) • ÚHKT • Dr. A. Holoubek - časově rozlišená fluorescence Hella cells značených GFP FÚ UK • Prof. J.Štěpánek– v rámci projektu „Nanobiofotonika pro medicínu budoucnosti“ • … a další

More Related