670 likes | 1.89k Views
TRANSKRIPCIJA. RNK nukleotidi. RNK polimeraza. 3’. matri čni lanac D NK. pravac transkripcije. sintetisana RNK. rastući RNK lanac. RNK polimeraza. formiranje fosfodiestarske veze. ribonukleozid trifosfat. 5’-3’ pravac polimerizacije. matrični lanac DNK. nematrični lanac. 5’. 3’.
E N D
RNK nukleotidi RNK polimeraza 3’ matrični lanac DNK pravac transkripcije sintetisana RNK
rastući RNK lanac RNK polimeraza formiranje fosfodiestarske veze ribonukleozid trifosfat 5’-3’ pravac polimerizacije matrični lanac DNK
nematrični lanac 5’ 3’ 3’ 5’ matrični lanac mesto otpočinjanja transkripcije mesto završetka transkripcije PROKARIOTSKI G E N RNK kodirajuća sekvenca promotor terminator DNK
1. Prepoznavanje promotora 5’ 3’ 3’ 5’ 2. I n i c i j a c i j a 5’ 3’ 3’ 5’ DNK matrica RNK transkript OSNOVNE FAZE TRANSKRIPCIJE PROMOTOR RNK polimeraza
3. E l o n g a c i j a 4. Terminacija 5’ 3’ 3’ 5’ 5’ 3’ 3’ 5’ RNK transkript
STARTNI SIGNAL DNK transkripcija start matrični DNK lanac RNK
promotor DNK - 35 - 10 DNK s faktor Inicijacija transkripcije kod prokariota RNK polimeraza sfaktor inicijalni ribonukleotid
smer transkripcije DNK sfaktor DNK/RNK hibrid oslobadjanje s faktora RNK
segment sa dvostrukom simetrijom DNK RNK transkript formiranje terminalne petlje
intron intron nematrični lanac 5’ 3’ DNK 5’ 3’ matrični lanac mesto otpočinjanja transkripcije poly (A) mesto EUKARIOTSKI G E N egzon 3 promotor egzon 1 egzon 2
produkti lokalizacija nukleolus 28S , 18S , 5.8S rRNK nukleus iRNK i neke snRNK nukleus tRNK , 5S rRNK ineke snRNK RNK polimeraze u eukariotskoj ćeliji RNK pol I RNK pol II RNK pol III
promotor DNK II D II D II D GC -90 CAAT -75 početak transkripcije TATA box - 30 II F II F RNK polimeraza II TF IIB + TF IIF II B II B TATA box TF IIE + TF IIH II H II E kompletni preinicijalni kompleks (PIK)
transkripcija transkripcija iRNK obrada polipeptid translacija polipeptid EUKARIOTE PROKARIOTE DNK DNK pre-iRNK iRNK translacija
metil grupa guanin početak iRNK CAP (7’ metil-guanozin) metil grupe baza
SINTEZA poly (A)REPA pre-iRNK RNK polimeraza sinteza RNK
jedinica transkripcije 5’ egzon 1 intron egzon 2 intron egzon 3 3’ DNK 3’ promotor 5’ transkripcija intron egzon 1 intron egzon 2 egzon 3 5’ 3’ obrada intron egzon 3 egzon 1 intron egzon 2 OH 5’ 3’ obrada intron egzon 3 egzon 1 intron egzon 2 Cap 5’ 3’ isecanje introna egzon 3 egzon 2 egzon 1 AAAAA…. poly(A) rep Cap 5’ 3’ hn RNK (primarni transkript) m7GpppN1 (Cap) pre-i RNK AAAAA…. poly(A) rep zrela iRNK
RNK transkript (pre-iRNK) Egzon 2 Egzon 1 protein drugi proteini snRNK snRNK splajsozom komponente splajsozoma isečeni intron iRNK Egzon 1 Egzon 2
pre-iRNK zasecanje na 5’ egzon-intron granici zasecanje na 3’ egzon-intron granici 2’ - 5’
PROKARIOTSKI RIBOZOM EUKARIOTSKI RIBOZOM 70s 80s 30s 50s 40s 60s 5S RNK 23S RNK 16S RNK 5S RNK 5,8 S RNK 18S RNK 28S RNK 34 proteina 49 proteina 21 protein 33 proteina
repetitivna jedinica ribozomske DNK transkripciona jedinica ribozomske DNK DNK gen za 28S gen za 18S gen za 5,8S transkripcija 45S pre-rRNK 41S pre-rRNK 20S pre-rRNK 32S pre-rRNK 28S rRNK 18S rRNK 5.8S rRNK
3’ mesto vezivanja aminokiseline ACC 5’ antikodon
petlja IV 3’ kraj za koji se vezuje AMK C C A petlja I petlja III antikodon
A C C A A A C C G A G T 3’ 5’ TRANSKRIPCIJA 5’ 3’ U G G U U U G G C U C A Trp TRANSLACIJA ACC Trp Phe Gly Ser DNK matrični lanac kod kodon iRNK tRNK antikodon polipeptid
3’ II nukleotid 5’ U C A G III nukleotid I nukleotid U C A G Phe Phe Leu Leu Ser Ser Ser Ser Tyr TyrSTOP STOP Cys CysSTOPTrp U Leu Leu Leu Leu U C A G Pro Pro Pro Pro His His Gln Gln Arg Arg Arg Arg C U C A G Ile Ile Ile Met Ser Ser Arg Arg Thr Thr Thr Thr Asn Asn Lys Lys A U C A G Asp Asp Glu Glu Gly Gly Gly Gly Val Val Val Val Ala Ala Ala Ala G
5’ 3’ C U C A G C G U U A C C A U 1. Leu Ser Val Thr 5’ 3’ C U C A G C G U U A C C A U 2. Ser Ala Leu Pro 5’ 3’ C U C A G C G U U A C C A U 3. Gln Arg Tyr His
AMK tRNK AMK antikodon antikodonska petlja antikodon kodon iRNK
kodoni za leucin kodoni za glicin iRNK I = inozin
AMK (triptofan) tRNKTrp aminoacil-tRNK sintetaza antikodon (specifična za triptofan) kodon iRNK
aminoacil-tRNK sintetaza aminokiselina pirofosfat tRNK cAMP aminoacil tRNK
SHINE-DALGARNO SEKVENCA startni kodon 3’ kraj 16S rRNK
f Met UAC AUG 5’ 3’ f Met UAC 3 2 1 GTP AUG 5’ 3’ 3 faktori inicijacije INICIJACIJA TRANSLACIJE KOD E. coli SHINE-DALGARNO SEKVENCA iRNK inicijator tRNK 30S 30S inicijalni kompleks
f Met UAC AUG 5’ 3’ P A GDP + P 1 2 INICIJACIJA TRANSLACIJE KOD E. coli 50S f Met UAC AUG 5’ 3’ 70S inicijalni kompleks
Ser GTP EF AGG Ser GDP EF-Tu AGG f Met Ser UAC AGG AUG UCC AAG P A ELONGACIJA KOD E. coli f Met + UAC AUG UCC AAG P A
f Met Ser UAC UAC AGG AUG UCC AAG P A ELONGACIJA KOD E. coli peptidna veza f Met Ser AGG AUG UCC AAG P A
EF-G GDP + P GTP EF-G f Met Ser AGG AUG UCC AAG P A ELONGACIJA KOD E. coli f Met Ser AGG AUG UCC AAG P A
Met Met UAC 5’ iRNK AUGCUGUUU UAC AUGCUGUUU 3’ P A I N I C I J A C I J A kod eukariota inicijator tRNKMet + mala subjedinica ribozoma velika subjedinica ribozoma
peptidna veza Leu Met Leu UAC GAC GAC AUG CUG UUU P A E L O N G A C I J A Met UAC AUG CUG UUU P A
pomeranje za jedan kodon Leu Met UAC GAC AUG CUG UUU GAC P A E L O N G A C I J A Met Leu GAC AUG CUG UUU P A
Phe Met Leu Phe AAA GAC AAA AUG CUG UUU GAC P A E L O N G A C I J A Met Leu GAC AUG CUG UUU GAC P A
pomeranje za jedan kodon Met Leu Phe GAC AAA AUG CUG UUU GAC P A E L O N G A C I J A Met Leu Phe AAA AUG CUG UUU GAC P A
Ala Tyr Asp Phe Leu Met Gly Ala Cys Val Ala Tyr Asp Phe Leu Met Gly faktor terminacije Ala Cys Val CAA CAA GUU UAG A P GUUUAG AUGCUGUUU T E R M I N A C I J A
DNK transkripcija RNK polimeraza egzon RNK transkript RNK obrada pre-iRNK intron aminoacil-tRNK-sintetaza nukleus AMK citoplazma aktivacija AMK tRNK m RNK polipeptid ribozomske subjedinice translacija antikodon m RNK
RNK polimeraza transkripcija ribozomi DNK poliribozom m RNK polipeptid
sintetisani polipeptid 60S 40S stop kodon startni kodon iRNK polipeptid 100 nm
ribozom m RNK signalni peptid SRP receptori SRP odvajanje signalnog peptida membrana ER citosol lumen cisterne ER
ANTIBIOTICI KOJI DELUJU SAMO NA PROKARIOTE Deluju na translaciju T e t r a c i k l i n blokira vezivanje aminoacil-tRNK za A mesto S t r e p t o m i c i n blokira prelazak sa inicijacije na elongaciju H l o r a m f e n i k o l blokira peptidil-transferaznu aktivnost E r i t r o m i c i n blokira translociranje duž ribozoma Deluju na transkripciju blokira inicijaciju kompetitivnim vezivanjem za RNK polimerazu R i f a m i c i n
ANTIBIOTICI KOJI DELUJU I NA PROKARIOTE I NA EUKARIOTE Deluju na translaciju P i r o m i c i n dovodi do prerane terminacije translacije Deluju na transkripciju blokira kretanje RNK polimeraze A k t i n o m i c i n D