220 likes | 405 Views
E. coli-utbruddet 2006. Laboratorie-basert etterforskning. Georg Kapperud. Smitteverndagene mai 06 X. E. coli O157. Avdeling for næringsmiddelbårne infeksjoner (SMAN). Laboratorie-basert etterforskning. Nasjonalt referanselaboratorium. Samme system ved utbrudd som til daglig.
E N D
E. coli-utbruddet 2006 Laboratorie-basert etterforskning Georg Kapperud Smitteverndagene mai 06 X
Avdeling for næringsmiddelbårne infeksjoner (SMAN) Laboratorie-basert etterforskning Nasjonalt referanselaboratorium
Samme system ved utbrudd som til daglig Medisinsk mikrobiologi MELDINGER VARSLER BAKTERIER Mattilsynet Andre FoU-institusjoner Næringsmiddelindustrien S M A N S M A O Epidemiologisk etterforskning Laboratorie-etterforskning
Hva er diagnosen? Vi trenger en etiologisk diagnose for å: • Lage en spesifikk kasusdefinisjon • Avgjøre hvem som tilhører utbruddet – og hvem som ikke gjør det • Bidra til å danne hypoteser om smittekilder og årsaker • Avsløre kilden: Sammenligne bakterier fra pasienter og mistenkte kilder • Spore årsaken til utbruddet gjennom produksjonskjeden
Agens Virulens Fingeravtrykk Vi sjekker bakterier fra pasienter og mat Hvilken E. coli-bakterie er det? Hvilke virulensgener har bakterien? Hvilken DNA-profil har bakterien?
Agens Er det E. coli O103 ? Serotyping Agglutinasjon på objektglass
Virulens Bakteriens våpenarsenal Virulensgenene • Eae (Gjør at bakterien kan feste seg i tarmen) • Stx1 (Et toksin bakterien lager) • Stx2 (Et annet toksin, gir alvorlig nyresvikt) Bakteriene i utbruddet hadde Eae og Stx2 Men de fleste hadde ”kastet fra seg” stx2 – genet !
Fingeravtrykk Bakteriens fingeravtrykk DNA-profilen Bakteriene i utbruddet hadde en veldig sjelden DNA-profil • Danner en ”gjeng” med nær beslektete medlemmer • ”Gjengen” skiller seg tydelig fra alle andre E. coli O103 • Har kanskje vært her i landet lenge
1. PCR og DNA-analyse 2. Fingeravtrykk 3. Data-analyse av tallkoder 3. Tallkode 07-03-00-05-00-07-01 Slik undersøker vi DNA-profilen MLVA
Slektstreet til E. coli O103 ”Gjengen” som forårsaket utbruddet
Rulleblad Overvåking Reservoar Hypoteser om smittekilden Hva sier vår egen overvåking? Har bakterien forårsaket utbrudd før? Hva var smittekilden da? Fra hvilke kilder er bakterien isolert i det siste? Har bakterien et kjent reservoar? Kjente smittekilder?
Vi kontakter Enter-Net Interpol for tarmbakterier Internasjonalt nettverk for overvåking av bakterier som smitter via mat og vann Har andre land sett bakterien?
Påvise Sammenligne Kan vi bekrefte mistanken? Veterinærhøgskolen: Kan bakterien påvises i den smittekilden vi mistenker? Folkehelseinstituttet: Er bakterier fra mistenkte smittekilder og fra pasientene like?
Slik fant Veterinærhøgskolen E. coli O103 Immunomagnetisk separasjon Kulene såes ut på agarskåler Immunomagnetisk separasjon Prøvematerialet blandes med kuler
Hvor kommer bakterien fra? DNA-profilen gjør det mulig å spore bakterien Besetninger Sauekjøtt Slakterier Morrpølse Her har vi funnet bakterien
Konklusjon Laboratorie-etterforskningen har bidratt til å: Pasienter der den sjeldne bakterien er påvist, tilhører utbruddet Avgrense utbruddet Spekepølse – det eneste stedet der den sjeldne bakterien er påvist Identifisere smittekilden Kjøttdeig, storfe etc. Bakterien kunne ikke påvises der Ekskludere andre kilder Kjøttråvarer fra sau – den eneste ingrediensen i pølsa der bakterien ble funnet Spore årsaken til utbruddet