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BIOLOGÍA MOLECULAR. Alejandrina Vega 192933. Función de las proteinas que participan en la transcripción. Tema 4.2.1. Transcripción en procariotas. RNA polimerasa En E. coli tiene un peso aproximado de 465 kDa. Es una holoenzima formada por varias subunidades proteicas:
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BIOLOGÍA MOLECULAR Alejandrina Vega 192933
Función de las proteinas que participan en la transcripción Tema 4.2.1
Transcripción en procariotas RNA polimerasa En E. coli tiene un peso aproximado de 465 kDa. Es una holoenzima formada por varias subunidades proteicas: • Dos subunidades a encargadas del ensamblaje del núcleo enzimático, intervienen en el reconocimiento del promotor y en la interacción de la enzima con factores auxiliares. • Las subunidades b y b´ que constituyen el centro catalítico. • Subuniddad s cuya función recae en el reconocimiento del promotor.
Transcripción en procariotas Rho (r): proteina que se una al RNA en lugares específicos y migra en dirección 5' 3' hasta encontrar el complejo de transcripción detenido en el lugar de la terminación. Posee actividad RNA-DNA helicasa dependiente de ATP, promueve la traslocación de la proteina a lo largo del RNA .
Transcripción en procariotas Existen otras subunidades que operan junto con la RNA polimerasa. Los loci “nus” (N-utilization-substance) que codifica proteínas que forman parte del aparato de transcripción, pero que no se aislan con la RNA polimerasa en su forma usual. Las proteínas Nus A, Nus B y Nus G están relacionadas con la transcripción. Nus E es una proteína ribosómica cuya función no está clara en la terminación.
Factores NUS Nus A es una factor general de transcripción que aumenta la eficiencia de la terminación, probablemente favoreciendo la tendencia de la RNA polimerasa al detenerse en los terminadores quizá estabilizando la estructura de horquilla del RNA. Nus G puede estar relacionada con el ensamblaje general de todos los factores en un complejo con la RNA polimerasa. Nus A se une al núcleo de la RNA polimerasa pero no a la holoenzima.
RNA polimerasa Tres tipos de RNA polimerasas que transcriben grupos de genes diferentes en lugares específicos del núcleo. Estas enzimas son proteínas grandes, que aparecen como agregados de 500 kDa o más y tienen de forma típica entre 8 y 14 subunidades. Las RNA polimerasas de mitocondrias y cloroplastos son menores y se asemejan más a la RNA polimerasa bacteriana dada la menor complejidad de los genomas de estos organelos.
RNA polimerasa I • Se localiza en el nucleolo, transcribe los genes que codifian para los RNA ribosomales. Esta enzima sintetiza un unico transcrito, el RNAr 45s, precursor del RNAr 18s, 28, y 5.8s. • Requiere de 2 factores auxiliares: UBF1 es un polipéptido que se une a una región rica en G-C tanto en el núcleo del promotor como en UCE. SL1 está formada por 4 proteínas entre las que se encuentra la TBP (del inglés TATA binding protein), su nombre se debe a que fue descrita en los promotores de tipo II donde esta proteína se une a una secuencia consenso denominada TATA.
RNA polimerasa II Se encuentra en el núcleo, específicamente en el nucleoplasma, sintetizandomoléculas de RNAhn (RNAheterogéneo nuclear), el precursor del RNAm, también sintetiza algunos RNAsn. Tiene 12 subunidades. La subunidad más grande RBP1, muestra un alto grado de homología con la subunidad b´ de la RNA polimerasa bacteriana. Otra subunidad RPB2 es estructuralmente similar a la subunidad bbacteriana y otras dos RBP3 y RBP11 muestran alguna homologia estructural con las 2 subunidades abacterianas.
RNA polimerasa III Se encuentra en el nucleoplasma del núcleo y es la encargada de la síntesis de los RNA de transferencia (RNAt), el RNAr 5S y otros pequeños RNA (RNAsn, del inglés smoll nuclear). Utiliza factores transcripcionales: TFIIA: proteína con motivos de dedos de cinc. TFIIB: complejo formado por tres proteína, una TBP y dos proteínas más. TFIIC:es un gran complejo proteínico de mas de 500 kDa.
