Recherche dans PubMed

1. Recherchedans PubMed Bibliothèque des sciences de la santé Automne 2013

2. SURVOL • Qu’est ce que PubMed • Accès • Énoncé/stratégie de recherche • Opérateurs logiques • Recherche Simple • Les termes MeSH (Medical Subject Headings) • Interroger PubMed avec les MeSH • Historique de recherche et combinaisons • Limitez votre recherche • Repérez les références non-indexées • Gérez vos références • Sauvegarde des références dans RefWorks • My NCBI : Sauvegarde des recherches • Aide additionnelle Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

3. Qu’est-ce que PubMed? • Une base de données bibliographiques • Plus de 22 millions de références bibliographiques à des articles de périodiques • Produite par la National Library of Medicine (NLM), U.S. • Plus de 5600 périodiques indexés dans Medline • Contenu international (75% anglais) • 1950-présent • + références non indexées dans Medline • Détails du contenu: http://www.nlm.nih.gov/pubs/factsheets/dif_med_pub.html Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

4. Accès • Page d’accueil de la Bibliothèque des sciences de la santé: • Ressources principales à la page d’accueil • Liste A-Z des bases de données • Pages Trouver des articles de nos Libguides • Pubmed.gov : disponiblegratuitementsur Internet ATTENTION: sivous ne passez pas par nos pages Web, les liens vers les textesintégraux des articles de périodiquesauxquels nous sommesabonnéespourraient ne pas fonctionner. Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

5. Stratégie de recherche • Énoncé de recherche: Mme Smith, une patiente âgée de 50 ans, se demande si le cancer du seinpeut être prévenu grâce aux vitamines ou aux suppléments nutritionnels. • Concepts clés: • Cancer du sein Prévention 2. Vitamines 3. Suppléments nutritionnels Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

6. Opérateurs logiques • ET • Relie 2 ou plusieurs idées différentes. Permet de mieux cibler les résultats de recherche. • OU • Relie 2 ou plusieurs synonymes ou termes connexes. Permet d’élargir votre résultat de recherche. • NON (SAUF) • élimine les idées ou concepts non désirés. Réduit la recherche. Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

7. Stratégie de recherche:relations entre les concepts Concept 1: cancer du sein ET prévention (un aspect du concept 1) ET (Concept 2: vitamines OUConcept 3: suppléments nutritionnels) Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

8. Représentation graphique Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

9. Recherche intuitive dans PubMed Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

10. Caractéristiques de la recherche intuitive • Facile, rapide • Exige une connaissance minimale des opérateurs logiques • Le système fait tout le travail (renvois aux termes appropriés) • Repérage maximum • Précision laisse à désirer Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

11. MeSHMedicalSubjectHeadings pourquoi les utiliser? • Des listes de mots et d’expressionsuniformisés: cancer=neoplasms • Éliminent les variations terminologiques et orthographiques: tumor ou tumour=neoplasms • Couvrent tout un éventail de synonymes ou de termes plus spécifiques: neoplasms inclut Lung neoplasms, Kidney neoplasms, Breast neoplasms, etc. Pour de plus amples explications: vidéo sur le vocabulaire MeSH (en anglais seulement) Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

12. MeSH (suite) • Permettent de réduire l’étendue de la recherche du sujet grâce à la fonction sujet principal (major topic) • Permettent de réduire l’étendue de la recherche du sujet en le combinant avec les qualificatifs (subheadings) désignant des aspects spécifiques - ex. : BreastNeoplasms – prevention & control Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

13. Interroger PubMed avec les MeSH – recherche du concept 1 • Ch 1. Choisir la base MeSH soit du menu déroulant ou directement en cliquant sur ce lien 2. Taper le terme ou l’expression dans la case et cliquer sur Search Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

14. Renvoi au MeSH (mapping) Cliquer sur le MeSH Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

15. Identifier / utiliser les MeSH (suite) Choisir les sous-catégories pertinentes et décider du poids du MeSH (« major » ou pas) puis ajouter au « Search builder » Cliquer sur Search PubMed Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

16. Résultats de la recherche – 1er concept Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

17. Recherche du 2ème concept: vitamines 1.Cochez tous les termes pertinents. 2.Ajoutez au Searchbuilder 3.Combinez avec le OR (OU) 4.Cliquez sur Search Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

18. Résultats, 2ème concept Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

19. Recherche du 3ème concept Vous pouvez cliquer dans la case pour choisir le MeSH, puis Add to search builder, et Search PubMed Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

20. Résultats, 3ème concept Cliquez maintenant sur Advanced Search pour voir l’historique de la recherche Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

21. Historique de la recherche et combinaisons logiques Les concepts apparaissentdans les boîtes lorsque vous cliquez sur Add. Choisissez l’opérateur pertinent pour votre combinaison. Avec le bouton de gauche, cliquez sur Addpour chaque ensemble à combiner. Dans cette recherche, commencez par combiner « vitamines » OR « suppléments nutritionnels ». Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

22. Résultat du OR et retour à l’historique de recherche Cliquez Historique de recherche enrichie d’un ensemble Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

23. Complétez votre recherche en combinant les concepts devant être reliés par ET (AND) Toujours avec le bouton gauche de la souris, cliquez Add pour les ensembles à combiner avec le AND. Dans la section en haut de l’écran, cliquez sur Search pour exécuter la combinaison. Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

24. Vos résultats: concept 1 ET (2 OU 3) • Les filtres sont des critères de limites que vous pouvez appliquer à vos résultats 1.Cliquez pour ajouter des critères de limites tels âge, langue des asrticles… 2. Choisissez les filtres et cliquez sur Show Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

25. Filtres 1. Choisissez une ou plusieurs valeurs pour chaque filtre désiré, puis cliquez sur Show N’oubliez pas que les limites demeurent actives pour toute la session, à moins que vous les enleviez. 2. Limitez ensuite vos résultats en cliquant sur un filtre pour l’appliquer. Ici, on passe de 155 à 62 références. Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

26. Repérez les références non-indexées • Utilisez tous les synonymes possibles (pas de MeSH) • Utilisez les parenthèses et les opérateurs logiques pertinents entre vos concepts (Breast cancer* OR breast carcinoma* OR breast neoplasm* OR breast tumor*) AND prevent* AND (Vitamin* OR ((nutrition* OR dietary) AND supplement*)) Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

27. Exécution de la recherche 1. Cliquez sur ce filtre 2. Limitezaux 7 derniers mois et appliquez Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

28. Résultat limité On constate que plusieurs références sont « in Process» (en cours de traitement) ou « Epubahead of print» Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

29. Votre stratégie de recherche élargie N’oubliez pas d’enlever la limite de temps! Il vous suffit maintenant de combiner #13 OR #17 pour obtenir toutes les références, indexées ou non, sur votre sujet. Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

30. Vos résultats N.B.: Cliquer pour choisir les références. Si aucune référence n’est choisie, tout l’ensemble est traité lors de la prochaine action. Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

31. Visionnez vos résultats Cliquez sur Display settings pour voir les options d’affichage Affichez suffisamment de références pour voir tout votre ensemble sur un seul écran, si possible Cliquez pour valider vos choix Choisissez le format Abstract pour voir le bouton , les MeSH et les résumés Choisissez le format MEDLINE si vous exportez à un gestionnaire bibliographique Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

32. Gérez vos références Cliquez sur Send to pour imprimer, sauvegarder sur une clé usb ou sur votre poste de travail, acheminer par courriel ou créer un fichier qui pourra être importé dans un gestionnaire bibliographique comme RefWorks. Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

33. Sauvegarde du fichier pour importation dans RefWorks • Veillez à modifier le nombre de références à envoyer en fonction de vos résultats. Ici, le nombre le plus petit que l’on devrait choisir est 100, si on veut les 65 références en un seul envoi. Cliquer sur Save File Le fichier est sauvegardé dans les téléchargements. Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

34. Connexion à RefWorks Saisissez vos coordonnées si vous êtes déjà inscrit(e) ou inscrivez-vous - c’est gratuit! Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

35. Importation dans RefWorks • Cette page estdisponibledans les guides de recherche, (sciences infirmières, physiothérapie, ergothérapie, audio/ortho) sous l’ongletTrouver des articles Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

36. Importation dans RefWorks Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

37. Résultat de l’importation Cliquez ici pour obtenir cela Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

38. Aide sur RefWorks • Consultez le Tutoriel de RefWorks http://refworks.scholarsportal.info/tutorial Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

39. Sauvegardez des recherches Cliquez Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

40. Sauvegardez la recherche Connectez-vous à MyNCBI ou inscrivez-vous Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

41. Sauvegardez la recherche Cliquez Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

42. Rappelez la recherche • Cliquez sur MyNCBI: • Aide dans MyNCBI Cliquez sur votre recherche pour la ré-exécuter Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

43. Aide exhaustive (en anglais seulement) • Le fichier d’aide de PubMed : http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query/static/help/pmhelp.html • PubMed FAQ : http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK3827/#pubmedhelp.FAQs • Tutoriel interactif sur PubMed : http://www.nlm.nih.gov/bsd/pubmed_tutorial/m1001.html Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

44. Des questions? • refrgn@uottawa.ca • 613-562-5800 x 8294 • Clavardez en direct Bibliothèque des sciences de la santé MERCI! Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013