470 likes | 625 Views
Ikke-parametriske tests. Dagens menu. t – testen… Hvordan var det nu lige det var? Wilcoxson Mann – Whitney U Kruskall Wallis Friedman Kendalls og Spearmans correlation. t -testen. t-testen. Men er data normal fordelte? Vi spørger SPSS! – Table 4-1 Armitage.
E N D
Dagens menu t – testen… Hvordan var det nu lige det var? Wilcoxson Mann – Whitney U Kruskall Wallis Friedman Kendallsog Spearmanscorrelation
t-testen Men er data normal fordelte? Vi spørger SPSS! – Table 4-1 Armitage
t-testens begrænsninger • Hvis vi tvivler på normalfordeling • Hvis vores outcome (dependent variable) er ordinal (ordnet kategorisk) fx ’--’, ’-’, ’0’, ’+’, ’++’ • Hvis vi kan nøjes med en simpel metode
The sign test • Den non-parametriske version af one-sample t-test • H0 for One-sample t-test: Middelværdien er 0 • H0 for sign testen: Fordelingen er symmetrisk omkring 0
The sign test • Er der lige mange plusser og minusser? • Der er 4 plusser og 6 minusser. • Binomial fordelingen fortæller om sandsynligheden for at få 4 plusser ud af 10 mulige. • (One sided!)
The sign test • Det er altså ikke særligt usandsynligt at observere 4 eller mindre minusser ud af 10 mulige
Men fortegnet beskriver jo ikke hele forskellen… • Hvis fx de negative værdier er større end de positive • Wilcoxon’ssigned rank sum test Tager højde for det
Wilcoxon’ssigned rank sum test • Opstil tallene efter størrelse uden at tage hensyn til fortegnet, men noter det blot • Hvis flere tal har samme rank, bruges den gennemsnitlige rank • Plussernes hhv. minussernes rank summeres • T+ = 2,5+2,5+2,5+9,5 = 17 • T- = 2,5+5+6,5+6,5+8+9,5 = 38
Wilcoxon’ssigned rank sum test • Der slås op i tabel for at se om ranken af den mindste er lille.
Pause Opgave • Use Wilcoxon’s signed rank sum test to test if there is a statistical difference between the number of attacks in the placebo and the Pronethaol groups
Sammenligning mellem to uafhængige grupper Mann Whitney U test Eller Wilcoxon’s rank sum test Eller Kendall’s S test t-testen for ikke-parametrisk data
Mann Whitney U (Wilcoxon’smetode) test H0: Fordelingerne som de to grupper stammer fra er identiske Sådan gør man: ovnen tændes på 200C Opstil tallene fra begge grupper i rækkefølge (Ranking) Beregn summen af rank’ene for hver gruppe Tæl antallet af tal i hver gruppe Se om den mindste rank sum er mindre end den der er opgivet i tabel A8
Mann Whitney U test (Wilcoxon’s metode) - I SPSS Tabel 4-2 Armitage Bemærk opsætningen af data!
Mann Whitney U test (Wilcoxon’s metode) - I SPSS Bemærk at man skal definere gruppe inddelingen!
Sammenligning af flere usammenhængende grupper Kruskal-Wallis test H0: Fordelingerne som gruppere stammer fra er identiske En-vejs ANOVA for parametrisk data
Kruskal-Wallis test Et par definitioner: k er antallet af grupper ni antallet af observationer i den i’te gruppe N er det samlede antal observationer Ri summen af ranks i den i’te gruppe Sådan gør man: Rank alle observationer Beregn rank summen for hver gruppe Beregn H (Det der i bogen kaldes T) Dette H er en chi-kvadrat fordeling med k-1 frihedsgræder Slå p-værdien op i en tabel
Kruskal-Wallis test – Et eksampel De rå data rankes
Kruskal-Wallis test – Et eksampel De rå data rankes H beregnes
Kruskal-Wallis test – Et eksampel De rå data rankes H = 6,2 Antallet af frihedsgrader = k-1 = 3
Sammenligning af flere sammenhængende grupper Friedman’s test Repeated ANOVA for parametrisk data
Pause opgave? • Er der forskel på grisebassernes vægt i de forskellige fodergrupper?
RankedCorrelation Kendall’s Spearman’s rs Korrelation koefficienten er mellem -1 og 1. Hvor -1 er perfekt omvendt korrelation, 0 betyder ingen korrelation, og 1 betyder perfekt korrelation. Pearson is the correlation method for normal data Remember the assumptions: Dependent variable must be metric continuous Independent must be continuous or ordinal Linear relationship between dependent and all independent variables Residuals must have a constant spread. Residuals are normal distributed