1 / 35

populaciona genetika

Proučavanje genetičkih fenomena i procesa mo že biti na nivou ćelije, jedinke, populacije Mendelovi zakoni - na nivou populacija MENDELOVSKA POPULACIJA – Zajednica jedinki neke vrste na jednom području, koja se polno razmnožava Evolucija – rezultat promena genetičke strukture populacija.

darren
Download Presentation

populaciona genetika

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. Proučavanje genetičkih fenomena i procesa može biti na nivou ćelije, jedinke, populacije Mendelovi zakoni - na nivou populacija MENDELOVSKA POPULACIJA – Zajednica jedinki neke vrste na jednom području, koja se polno razmnožava Evolucija – rezultat promena genetičke strukture populacija populaciona genetika

  2. Raznovrsnost medju jedinkama, grupama jedinki Procena varijabilnosti – na osnovu uzorka populacije različitost jedinki humanih subpopulacija genetička uniformnost na nivou cele populacije

  3. Fenotipska varijabilnost bubamare Chiricahua planina Arizone.

  4. Učestalost fenotipskih klasa

  5. Panaxia dominula BB Bb Bb bb

  6. BOJA KOŽE OTISCI PRSTIJU KRVNE GRUPE

  7. Hromozomska varijabilnost

  8. varijabilnost na nivou proteina- krvne grupe 85% var. je unutar populacija 7% unutar geografskih rasa 8% izmedju geografskih rasa

  9. Varijabilnost na nivou strukturnih gena Hb osnovna šema elektroforeze sa primerom gela Tpi lokus biljke Helonias bullata (triofosfat izomeraza) Multipli aleli

  10. Učestalost genotipova Učestalost alela

  11. POLIMORFNOST (P) Lokus je polimorfan ako je učestalost najučestalijeg alela manja od 99% ili 95% P = br. polimorfnih lokusa / br. lokusa HETEROZIGOTNOST (H) H = br. heterozigotnih jedinki za neki lokus / br. Jedinki Parametri kvantifikovanja genske varijabilnosti

  12. Izuzetno visoka varijabilnost u P i H - generalno je visoka korelacija P i H ALOZIMSKI POLIMORFIZAM beskičmenjaci ↓ biljke ↓ kičmenjaci Drosophila MAX H Sisari MIN H

  13. Genetička varijabilnost populacije je promenljiva • sredina, sistemi parenja, veličina populacije, evolutivni faktori

  14. DNK polimorfizam • Razlika u DNK sekvenci medju jedinkama, grupama, populacijama • Mutacija:vid genetičkog polimorfizma – nasledna promena u nukleotidnoj sekvenci

  15. GENSKE MUTACIJE • bez efekta na fenotip • “tihe”- NE MENJAJU AMINO KISELINU • neutralne– MENJAJU AMINO KISELINU • NE MENJAJU POLIPEPTID • sa efektom na fenotip • 1. na nivou translacije proteina • nonsens - zaustavljanje translacije • missens - zamena amino kiseline • “frameshift”-promena celog polipeptida • U odnosu na adaptivnu vrednost • NE UTIČU NA ADAPTIVNU VREDNOSTI • UTIČU NA ADAPTIVNU VREDNOST

  16. DNK polimorfizam • sinonimne i nesinonimne zamene • u kodirajućim i nekodirajućim regionima • SNP (zamene pojedinačnih nukleotida • Mikrosatelitni ponovci • Minisatelitni ponovci (VNTR) • RFLP

  17. RFLP polimorfizam dužine restrikcionim fragmenata

  18. Procenjena nukleotidna heterozigotnost za neke DNK sekvence H nuc= [n(∑ci) - ∑ci2] / j [(∑ci)(n-1)] n = br DNK molekula j = br. nukleotida na 1 restrikcionom mestu i = br. restrikcionih mesta c = broj molekula po 1 restrikcionom mestu • DNK sekvence organizam Hnuc • beta-globinski geni čovek 0.002 • gen za hormon rasta čovek 0.002 • Adh gen voćna mušica 0.006 • mtDNK čovek 0.004 • region H4 gena morski jež 0.19

  19. VNTR - varijabilni broj tandemskih ponovaka

  20. mtDNK i cpDNK polimorfizam -Manji genomi, puno kopija -Visoka stopa mutacija -Unipartentalno nasledjivanje -Nema rekombinacija Geografska distribucija mtDNK sekvenci kod Geomys pinetis na jugoistoku SAD Geografsko odvajanje “mitohondrijalnih linija”, nakon restrikcije mtDNK sa BamHI, u restrikcione tipove MabHI M i BamHI N.

  21. Hipotetičko filogenetsko stablo na osnovu polimorfnosti mtDNK humanih populacija

  22. migranti iz istočne afrike nose novi marker, imaju ga svi ne-afrikanci novi marker, euroazijati, pojavio se na srednjem istoku

  23. Hipotetičko filogenetsko stablo na osnovu polimorfnosti mtDNK humanih populacija Afrikanci Ostali (i Afrikanci) mtDNK Minisateliti Protein-kodirajuće sekvence 10 000 jedinki osnivačke populacije 100 000 -200 000 godina

  24. Globalna genetička različitost humanih populacija - uslovljena geografijom, Genetička diferencijacija raste sa geografskom udaljenošću, a unutar populacijska opada sa udaljenošću od afričkog kontinenta

  25. Učestalosti različitih genskih varijanti u različitim populacijama otkrivaju koliko skoro su one delile zajedničke pretke. Geografska udaljenost od istočne Afrike objašnjava 85% opadanja genetičke varijabilnosti medju ljudskim populacijama (mikrosateliti) Malo je polimorfizama koji su unikatni za pojedine populacije

  26. Jaka veza izmedju genetičke varijabilnosti i lingvističkih grupa

  27. Prostorna i vremenska varijabilnost genetičke strukture populacije DAGNJA: variranje učestalosti LAP94, LAP96, LAP98 alela LAP lokusa - za enzim leucin amino peptidazu Variranje učestalosti 5 tipova inverzija kod D.pseudoobscura

  28. Distribucija B alela u Evropi

  29. Učestalost mutacije Δ32 u CCR-5 alelu (rezistentnost na HIV infekciju) Malo je polimorfizama koji su unikatni za pojedine subpopulacije ili rase Ljudske populacije su genetički uniformne Veći deo varijabilnosti je unutar nego izmedju populacija Razlike postoje u učestalosti pojedinih alela

  30. Čemu služi analiza genetičkog polimorfizma? • Procena nivoa genetičke varijabilnosti populacija različitih vrsta koje se razlikuju prema veličini, genetičkoj organizaciji, sistemu parenja ili osobinama životnog ciklusa • Razumevanje nastanka različitih vidova polimorfizma i razumevanje evolutivnih mehanizama održavanja genetičke varijabilnosti i procesa kojim se on unutar vrste pretvara i genetičku divergenciju izmedju vrsta

  31. Razumevanje evolutivne istorije populacija, subpopulacija i vrsta i evolutivnih faktora koji na to utiču kao i odredjivanje filogenetskih odnosa vrsta Razumevanje evolutivnog porekla, globalne ekspanzije i diversifikacije humanih populacija

  32. Upotreba DNK različitosti za identifikaciju jedinki u populaciji sa ciljem forenzike, sudstva, odredjivanja genetičkog srodstva, praćenja epidemija, itd. Upotreba DNK polimorfnih sekvenci kao genetičkih markera u analizama rodoslova putem genetičke vezanosti, sa ciljem utvrdjivanja gena faktora rizika za pojedina nasledna oboljenja kod ljudi ili gena povezanim sa poželjnim osobinama u kultivaciji biljaka i životinja

  33. Monitoring nivoa genetičkog diverziteta kao ključnog indikatora vrsta u biološkoj zajednici i staništima izloženim hemijskom, biološkom ili fizičkom stresu • Monitoring nivoagenetičkog diverzitetasa ciljem konzervacije ugroženih vrsta

More Related