1 / 64

Marta Arcabell Dora Cano Blanca Puchau Verónica Rodilla

FACTORS DE TRANSCRIPCIÓ. Marta Arcabell Dora Cano Blanca Puchau Verónica Rodilla. Proteïnes que reconeixen seqüències específiques de DNA. Regulació de la transcripció. Dominis: Activació de la transcripció Unió a DNA. S’uneixen a regions de menys de 20 nt Mòdul de control:

enye
Download Presentation

Marta Arcabell Dora Cano Blanca Puchau Verónica Rodilla

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. FACTORS DE TRANSCRIPCIÓ Marta Arcabell Dora Cano Blanca Puchau Verónica Rodilla

  2. Proteïnes que reconeixen seqüències específiques de DNA. • Regulació de la transcripció. • Dominis: • Activació de la transcripció • Unió a DNA. S’uneixen a regions de menys de 20 nt • Mòdul de control: • Core o elements promotors basals • Elements promotors proximals • Enhancers distals

  3. Tipus: • Ubicus. Requerits per l’expressió de tots els gens estructurals. Complex de preiniciació. • Només en determinats tipus cel·lulars o en condicions fisiològiques o ambientals particulars. • Famílies segons motius estructurals d’unió a DNA: • Hèlix-turn-hèlix • Leucine-zipper • Hèlix-loop-hèlix • Dits de zinc

  4. TATA-BINDING PROTEIN • La TATA-box és l’element promotor core més ben caracteritzat • Seq DNA rica en A-T localitzada 25 pb upstream de l’inici de transcripció. • Reconeguda per TBP que forma part del TFIID • La TBP s’uneix a RNApol II i altres FT per formar el complex de preiniciació. • C-terminal: 2 regions homòlogues de 88 aa que s’uneixen a la seq consens.

  5. Asn 159 Asn 69 Thr 124 Thr 215

  6. HOMEODOMINI • Domini d’unió a DNA constituït per 60 aa. • Homeobox: regió de DNA que codifica per l’homeodomini. 180 bp. • Les proteïnes amb homeodomini s’uneixen al DNA com a monòmers a través d’una estructura supersecundària del tipus hèlix-turn-hèlix. • Unió específica: 5’-A-T-T-A-3’ • Unió inespecífica.

  7. Hèlix 3 Hèlix 1 Hèlix 2

  8. Antennapedia: residus 30-50 Mat alfa 2: residus 162-182 Fragments de H-T-H Repressor cro Tot el motiu H-T-H

  9. Gln 8 Arg 6 Arg 5

  10. 15,025 Å 12,277 Å 14,818 Å 15,592 Å Groc: Iso 47-A Verd: Asn 51-T Taronja: Glu 50-T Blau: Arg 53- A

  11. Nucli hidrofòbic: Trp 48 i Phe 49

  12. Interacció de l’Homeodomini amb altres proteïnes

  13. REGIONS POU homeodomini • Regió POU domini POU-específic 150-160 aa regió linker variable

  14. Homeodomini POU-específic

  15. Homeodomini 5’-ATGC POU-específic AAAT-3’

  16. Val 47, Cys 50, Asn 51 Arg 5

  17. Gln 44, Thr 45, Arg 49 Arg 20, Gln 27, Glu 51

  18. MOTIU: ZN-FINGER • 30aa aprox. • Fulla beta antiparal.lela (residus 1-10) • Alpha helix (3 ½ voltes)

  19. C-term His2 • Patrons de Cys i/o His units a àtoms de Zn • 2Cys separades per 2-4 aa • -2His separades per 3-5 aa • El linker entre Cys2 y His1 és de 12 residus Cys2 His1 Cys1 N-term

  20. TF-IIIA (Xenopus laevis)

  21. Zif268 (Mus musculus)

  22. G6 Ser45 Arg46 G7 P5 Arg42 Cys37 His49 Cys40 P4 His53 His57

  23. Rcp.glucocorticoides (Homo sapiens)

  24. Arg466-G4: ponts d’H Lys461-G7: ponts d’H Val462-T5: F.Waals Ser448 His451 G7 Lys461 Val462 T5 Arg466 G4

  25. -Domini Zn-finger: 4Cys conservades -Unió no-específic a DNA: *His452 *Ser448 (Thr) -Unió específica a DNA: *Lys461 *Val462 (no conservada) *Arg466

  26. MOTIU: LUECINE-ZIPPER

  27. C-term • Alfa-helix amb 3’6 residus/gir. • Regió de 30 residus separats en mòduls de 7 residus: *1er: Hidrofòbic • *4rt: Leu • Nucli hidrofòbic: és el responsable de la estabilitat del dímer. Les Leu queden encarades. • Residus carregats, promouen dimerització o l’eviten depenent de les càrregues dels aa. • Homodímers o heterodímers. N-term

  28. C-term -281 aa -La regió C-term consta de 55aa, responsable de la dimerització, unió al solc major del DNA. -3 regions: *cremallera de leucinas *regió bàsica (20aa) amb 8 residus carregats *regió àcida (40aa) Regió bàsica GCN4 (S.cerevisiae) N-term

  29. Leu Val Leu Met Nucli hidrofòbic

  30. Lys Glu Interacció electrostàtica Centre de dimerització

  31. Asn235 Interacció amb DNA

  32. MOTIU: HLH MyoD Max

  33. Monòmer MyoD loop H2 H1 N-term bàsica C-term

  34. Seqüèmcia palindròmica Glu118 Thr115 Arg111 Interacció MyoD-DNA

  35. H1 H2 bàsica b/HLH/zp N-term C-term zipper • Familia de factors de transcripció: • b/z • b/HLH • b/HLH/z

  36. PREGUNTES PEM

  37. Senyala l’opció incorrecta: • L’homeodomini consisteix en un motiu d’unió al DNA del tipus Hèlix-loop-hèlix. • L’homeodomini consta de 3 alfa-hèlix connectades per loops curts. • L’hèlix 2 i 3 de l’homeodomini presenta una similitut estructural molt significativa amb el domini HTH de procariotes. • L’homeodomini interacciona amb el solc major del DNA a través de l’hèlix 3 i amb el solc menor a través del N-terminal. • Per tal d’estabilitzar el complex de l’homeodomini amb el DNA, s’estableixen ponts d’H no específics principalment amb lys i Arg • La opció correcte és la “a”

More Related