110 likes | 312 Views
Simulátor riasy Chlorella kessleri. bunky Chlorella kessleri. Ťažké kovy a riasy. ťažké kovy - riasy - jednoduchý a lacný spôsob od-stránenia kovov biol. experimenty - vysoké náklady => simulátor riasy. ?. ALife prístup. bunky riasy = agenti
E N D
bunky Chlorella kessleri Ťažké kovy a riasy • ťažké kovy - • riasy - jednoduchý a lacný spôsob od-stránenia kovov • biol. experimenty - vysoké náklady => • simulátor riasy
? ALife prístup • bunky riasy = agenti • agenti neinteragujú pria-mo, iba skrz prostredie • sledujeme, čo „vyemer-guje” (rast populácie rias, spracovávanie ťažkého kovu)
agenti minerály kov metabolit Model • Bunka (autonómny reaktívny agent) • Prostredie (4-vrstvová 2-D mriežka)
Model - prostredie • Parametre (svetlo, difúzia, globálne platné parametre buniek, ...) • Inicializácia (počiatočné množstvo a umiestnenie buniek a látok) • Akcie (difúzia)
Model - Bunka • Parametre (energia, voľné väzbové miesta pre kov, zásoba minerálov, vek, rôzne hraničné hodnoty, ...) • Inicializácia (- zdedenie / náhodné vy-generovanie hodnôt parametrov) • Akcie (- zoznam pravidiel modelujúcich životné funkcie bunky)
Experimenty • odhadovanie parametrov ...
a) b) Použitie GA • jedinec = jedno spustenie simulácie • genotyp = 7 vybratých parametrov • fenotyp = dynamika sorpcie kovu • gen. operátory (mutácia, cross-over) • fitness-funkcie:
Použitie GA • algoritmus: • populácia: 10 / 20 jedincov • výber rodičov (ruleta) • aplikácie genetických operátorov • vytvorenie novej populácie
Experiment • cross-over: 0.8, mutácia: 0.2, 200 gene-rácií, fitness-f.: „b“