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Eröffnungskolloquium „Environmental Informatics“ am 27.01.2006

Eröffnungskolloquium „Environmental Informatics“ am 27.01.2006. Ökoinformatik B.Sloboda. Gliederung. Werkzeuge der Ökologischen Informatik Skalenebenen der Ökologischen Informatik Beispiele Beispiel 1: Pappel: vom Gen zum Individuum

jaafar
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Eröffnungskolloquium „Environmental Informatics“ am 27.01.2006

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Presentation Transcript

  1. Eröffnungskolloquium„Environmental Informatics“am 27.01.2006 Ökoinformatik B.Sloboda

  2. Gliederung • Werkzeuge der Ökologischen Informatik • Skalenebenen der Ökologischen Informatik • Beispiele • Beispiel 1: Pappel: vom Gen zum Individuum • Beispiel 2: Überwindung der Skalenebene bei der Rhizosphäre • Beispiel 3: Struktur- und Funktionsmodellierung • Beispiel 4: Räumlicher Ansatz der Simulation forstlicher Biodynamik • Themenschwerpunkte für PhD Ökoinformatik / B. Sloboda

  3. Ökologische Informatik Die ökologische Informatik wird in der internationalen Forschung als ein neues Forschungsgebietin der Ökologie und in der angewandten Informatik definiert. Sie ist ein interdisziplinäres Rahmenwerk, welches die Entwicklung und Anwendung der neuesten Informationstechnologien und mathematischen Modellierung in und zwischen allen Komplexitäts-und Skalenstufen eines Ökosystems fördert. Ökoinformatik / B. Sloboda

  4. Werkzeuge der Ökologischen Informatik Ökoinformatik / B. Sloboda

  5. Skalenebene der Ökologischen Informatik • Die Ökologische Informatik behandelt Skalenebenen von der Genetik bis zur Landschaft • enge Verknüpfung mit Bioinformatik, Geoinformatik und wissenschaftlichem Rechnen • im folgenden erläutert durch 4 Beispiele Ökoinformatik / B. Sloboda

  6. 1 Individuenebene: Wurzelsystem Beispiel 1 nächste Skalenebene: Organ Ökoinformatik / B. Sloboda

  7. 1 Organebene: Wurzelsegmente nächste Skalenebene: Zelle Ökoinformatik / B. Sloboda

  8. 1 Zelluläre Ebene: Wurzelhaare nächste Skalenebene: regulatorisches Netzwerk Ökoinformatik / B. Sloboda

  9. TTG ETR1 R homolog AXR2 CTR1 CPC GL2 RHD6 *nach Mendoza & Alvarez-Buylla 2000 GEN Protein Up-Regulation DownRegulation 1 Genetisches Regelungsnetz der Wurzelhaarbildung oder in der Landwirtschaft Ökoinformatik / B. Sloboda

  10. Agrarwissenschaft: Gerstenmodell Formalismus RGG Sprache XL Software GroIMP Modell j k, l m ==>j m,l k; GroIMP: Growth-grammar related Interactive Modelling Platform Teil des regulatorischen Netzwerks (Gibberellinsäure-Biosynthese) Ökoinformatik / B. Sloboda

  11. Projektintegration mit multiskaliertem Ansatz Beispiel 2 Ökoinformatik / B. Sloboda

  12. 3 Struktur- und Funktionsmodellierung • Struktur und Funktionsmodellierung mit extended Lindenmayer-Grammatiken (XL) • Simulation mit GroIMP • Simulation der Ontogenese der Pappel Beispiel 3 Ökoinformatik / B. Sloboda

  13. 4 Räumlicher Ansatz der Simulation forstlicher Biodynamik • Simulator SIBYLA im GK 1086 Hainich – Biodiversität • Beispiel zum Vergleich der Biodiversität im Laufe des Bestandeswachstums Beispiel 4 Ökoinformatik / B. Sloboda

  14. Themenschwerpunkte für PhD Themen • Ökoinformatik • Skalentransfermodelle • Struktur und Funktionsmodelle • für Biota • Erweiterte Lindenmayersysteme • Neuronale Netze • Artificial Life • Biodiversitätsmodelle • Ökosystemmodelle • RaumbezogeneUmweltinformationssysteme • Visualisierung • Biometrische Modelle • u.ä. • Sprecher Sloboda Ökoinformatik / B. Sloboda

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