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Reaxys 搜尋使用教學 MarvinSketch 使用方式

Reaxys 搜尋使用教學 MarvinSketch 使用方式. 搜尋設定. 設定欲搜尋化合物之角色 產物 起始物 任何位置 試劑 / 催化劑. 忽略立體結構 排除同位素 不含電荷 不含自由基 不額外加環 保持分離片段 忽略原子對應. 部分結構搜尋 完全相符 次結構 於雜原子上取代 於所有原子上取代. 消除不必要搜尋結果. 為了消除一些不必要的結果可使用以下方法 ( 尤其是在部分結構搜尋 ) 控制取代基 對於高對稱性分子，畫反應時標記反應位置 指定開、閉環之位置. 取代基控制. Reaxys 選項 ：

jerusha
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Reaxys 搜尋使用教學 MarvinSketch 使用方式

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Presentation Transcript

  1. Reaxys 搜尋使用教學MarvinSketch使用方式

  2. 搜尋設定 • 設定欲搜尋化合物之角色 • 產物 • 起始物 • 任何位置 • 試劑/催化劑 • 忽略立體結構 • 排除同位素 • 不含電荷 • 不含自由基 • 不額外加環 • 保持分離片段 • 忽略原子對應 • 部分結構搜尋 • 完全相符 • 次結構 • 於雜原子上取代 • 於所有原子上取代 April 2, 2014 Slide 2

  3. 消除不必要搜尋結果 為了消除一些不必要的結果可使用以下方法(尤其是在部分結構搜尋) • 控制取代基 • 對於高對稱性分子，畫反應時標記反應位置 • 指定開、閉環之位置 April 2, 2014 Slide 3

  4. 取代基控制 Reaxys選項： 可以有取代基：Substructure / on all atoms 無取代基：As drawn 不加取代基最快的方法就是直接加入氫。 取代基位置 取代基位置 取代基位置 • ①選擇要加入取代基的原子 • ②依序鍵入”.”, “s” 再鍵入取代數 • 取代數設定(MarvinSketch) • ＊：鎖定不取代 • ６：該原子最大取代數 April 2, 2014 Slide 4

  5. 在反應中使用Mapping功能 1 3 2 4 • 點選在左側”1”的圖案 • 選擇“Manual Atom Map” • 點選反應物的原子並拖曳 • 拖曳至產物的選定原子 • 原子上會出現對應標記 5 April 2, 2014 Slide 5

  6. 指定開/閉環位置 在指定位置點擊右鍵 1 選擇”Edit Bond” > “Reaction Center 2 選擇 “Make or Break” 3 April 2, 2014 Slide 6

  7. G G* Any Group Any Group with ring closure ACY CYC Cyclic Acyclic ABC CXX CBC AHC CHC Carbocyclic Heterocyclic Cyclic, Heteroacyclic Carbacyclic N no carbon N N N N 使用舉例：烷化反應 ALK AEL AYL AOX HAR ARY CAL CEL Alkyl Alkenyl Alkynyl Alkoxy Heteroaryl(6) Aryl Cycloalkyl Cycloalkenyl N O Reaxys Generic Group M：Metal X：Halogen Reaxys Generic Group只能擺於末端 April 2, 2014 Slide 7

  8. Reaxys Generic Group • 在左側視窗點選此圖後，即出現右圖 • 選擇所需要的Group • 按下Close關閉 April 2, 2014 Slide 8

  9. 多原子搜尋方式 點擊原子 點選上方圖案，出現左側圖示 選取”Atom List” 點選元素 按下Close關閉 April 2, 2014 Slide 9

  10. 鍵結種類設定 對任意鍵結按右鍵， ”Edit Bond”>”Type” • 單鍵 / 雙鍵 / 参鍵 / 苯環雙鍵 • 單鍵朝上 / 單鍵朝下 / 單鍵朝上or下 / Cis or Trans / Cis or Trans or 不確定 • 單 or 雙鍵 / 單 or 苯環雙鍵 / 雙 or 苯環雙鍵 / 任何鍵結 • 配位鍵 April 2, 2014 Slide 10

  11. 如有相關問題請連絡： • 陳建丞 • c.chen@elsevier.com 相關網頁： • www.reaxys.com(首頁) • taiwan.elsevier.com • (台灣官網，包含產品介紹及教學檔下載) • www.facebook.com/reaxysclub • (Facebook粉絲團，包含最新消息及線上交流)

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