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Reaxys Searching Chemical Information in Chemist way

Reaxys Searching Chemical Information in Chemist way. 陳建丞 Trainer, Elsevier Taiwan. 大綱. Reaxys 簡介 搜尋頁面簡述 Rapamycin 搜尋 自訂帳號 相關資訊. 2014年10月29日星期三 Slide 2. Reaxys 簡介. 2014年10月29日星期三 Slide 3. Reaxys. Rea reaction Xy unknown sustances

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Reaxys Searching Chemical Information in Chemist way

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Presentation Transcript

  1. ReaxysSearching Chemical Information in Chemist way 陳建丞 Trainer,Elsevier Taiwan

  2. 大綱 Reaxys簡介 搜尋頁面簡述 Rapamycin搜尋 自訂帳號 相關資訊 2014年10月29日星期三Slide 2

  3. Reaxys簡介 2014年10月29日星期三Slide 3

  4. Reaxys • Rea reaction • Xy unknown sustances • S several things 希望大家能使用Reaxys找到所需要的資訊

  5. 找尋化學相關資訊  搜尋與閱讀  花時間 擷取：資料抽出 Time 方法：資料來源 Time 目的：找資料 2014年10月29日星期三Slide 5

  6. 較容易的搜尋方式 – Reaxys • 流程化的工作方式 • 快速提供驗證過的詳細實驗步驟及數據 • 完整列出被測試過的化合物各項性質 • 減少建構合成流程的時間 • 直觀的介面 • 易於使用的網路介面，不必安裝軟體 • 由化學家所設計 • 任何時間及任何地點(校內)皆可使用 • 不受人數限制 2014年10月29日星期三Slide 6

  7. 豐富的內涵 2014年10月29日星期三Slide 7

  8. Chemical Spider? Reaction Bioactivity Product or Reactant? Drug or Poison? Substance Patent/Article Ecotoxic Effect on environment? Application? Identified? Spectroscopy 2014年10月29日星期三Slide 8

  9. Reaxys如何建立? – 將 journal articles and patents抽絲剝繭 Physical Data Physical Data Spectra Spectra Bioactivity Data Bioactivity Data Natural Product Natural Product Reaxys 23 March 2010 ‹6›

  10. 發展方向 *紙本的歷史累積 *電子化的開端 *語言與搜尋方 式的改變 *簡易的介面 *資料庫的擴容 *搜尋方式再進化 2014年10月29日星期三Slide 10

  11. 搜尋頁面簡述 2014年10月29日星期三Slide 11

  12. 1 2 3 搜尋頁面介紹 (Reactions) 搜尋頁面可以分為繪圖區、基本條件區、條件限定區等三部分 2014年10月29日星期三Slide 12

  13. 條件限定 可以利用不同敘述得到更好的搜尋結果 文字清單說明各文章的不同用語 2014年10月29日星期三Slide 13

  14. 1 2 3 搜尋頁面介紹 (SubstanceandProperties) 搜尋頁面可以分為繪圖區、基本條件區、條件限定區等三部分 2014年10月29日星期三Slide 14

  15. 條件限定 五大分類：(自訂)/基本資料/物性/光譜/生物活性/環境毒性 2014年10月29日星期三Slide 15

  16. 搜尋頁面介紹 (Text, Authors and more) 這裡提供了利用文字比對的方式搜尋，例如聚合物、蛋白質或文具等 在文字搜尋頁面中，另外提供了輸入專利號及專利出處的選項 2014年10月29日星期三Slide 16

  17. Rapamycin搜尋 2014年10月29日星期三Slide 17

  18. Rapamycin 在腫瘤細胞中，抑制mTOR基因來進行標靶治療是目前的研究目標。 最早的發現是由Rapamycin的藥理研究而來，研究指出其具有抗生素、免疫抑制及抗腫瘤的作用，以下將以 Rapamycin為例，利用 Reaxys進行搜尋。 • Start a search ： mTOR inhibitor 2014年10月29日星期三Slide 18

  19. 如果要手動畫分子結構，可以在空白處點兩下，會跳出繪圖程式。如果要手動畫分子結構，可以在空白處點兩下，會跳出繪圖程式。 也可以利用 ”Generate structure from name” 鍵入化學名以產生分子。 現在要以 Rapamycin 開始進行搜尋。 rapamycin mtor 2014年10月29日星期三Slide 19

  20. 搜尋結果為 11個化合物在461篇文章出現。 若是想先看結構而非文字時，可以選擇 ”Substance(Grid)” 以進行結果檢視。 若是單純想看文獻列表時，可以選擇 ”Citation” 以進行結果檢視。 2014年10月29日星期三Slide 20

  21. 此為文獻列表的顯示方式，包含篇名、作者、年份、來源及被引用次數。此為文獻列表的顯示方式，包含篇名、作者、年份、來源及被引用次數。

  22. 以下這些聯結表示對於此分子在Reaxys內所有的可用數據。以下這些聯結表示對於此分子在Reaxys內所有的可用數據。 利用左側的Filter可以指定結果中出現您所需要的數據或性質。 點擊“e”會連結至emolecules website，此頁面包含的該分子的來源廠商及價格資訊 2014年10月29日星期三Slide 22

  23. 點擊 會出現進階選項及”View related markush”，可提供您專利相關資訊。 點擊 ，可以以3D模式檢視分子。 使用”Filter”中的”Sub-structure”，可以再加入某個官能基將結果範圍縮小。 2014年10月29日星期三Slide 23

  24. 使用”Filter”中的”Bioactivity”，其中提供多項選擇可以將結果範圍縮小至相關資訊。使用”Filter”中的”Bioactivity”，其中提供多項選擇可以將結果範圍縮小至相關資訊。 在”Filter”中所顯示的數字代表著該項數據所包含的資料筆數。 2014年10月29日星期三Slide 24

  25. 上方的”Breadcrumbs”讓您隨時注意自己進行到哪一個步驟，點擊其中一個可回到該步驟。上方的”Breadcrumbs”讓您隨時注意自己進行到哪一個步驟，點擊其中一個可回到該步驟。 “No of preparations”讓您知道關於此化合物的製備方法數及參與反應數。 若有特別指定，搜尋結果會以”Hit Data”顯示。 2014年10月29日星期三Slide 25

  26. Reaxys的Output提供多種輸出功能。 資料輸出種類：Substance Grid、 Substance Details Table、Substance Citation Table 資料輸出格式：PDF、Word、Excel…. 資料輸出範圍 資料輸出選擇 2014年10月29日星期三Slide 26

  27. Reaxys提供”Synthesis Plan”的功能，讓您在查詢資料的同時，也能建構自己的合成流程圖。 點擊“Synthesize”，會自動跳轉到”Synthesis Plan”的頁面，此頁顯示的是”Synthesis Plan”頁面上半部。 2014年10月29日星期三Slide 27

  28. 此頁顯示的是”Synthesis Plan”頁面下半部。 Reaxys會將所有可能路徑列出供使用者參考選擇，除此之外，還可以藉由排序或”Filter”的方式來找尋所需之反應。 2014年10月29日星期三Slide 28

  29. 反應圖中若有出現“ViewScheme” ，表示該反應為多步反應，點擊可觀看其流程圖。 此流程圖下方會顯示此反應的詳細步驟。 點擊Output可以將此圖及實驗細節輸出，或是以XML格式儲存，下次再以Reaxys開啟。 2014年10月29日星期三Slide 29

  30. 反應圖中若有出現“Show Experimental Procedure”，表示可直接觀看該反應的詳細實驗內容，點擊後會直接顯示在下方。 點擊”Title/Abstract”，下方會出現其篇名及摘要。 2014年10月29日星期三Slide 30

  31. 點擊每一篇的” Show Details”，可觀看該篇部分內容，包含所有參與化合物及反應等。

  32. 自訂帳號 2014年10月29日星期三Slide 32

  33. 自訂帳號 設定帳號後： 可自訂預設繪圖程式 可留下搜尋歷史紀錄 可設定新知通報 *帳號只在同一所校內有效 2014年10月29日星期三Slide 33

  34. 改變分子繪圖程式 2014年10月29日星期三Slide 34

  35. 相關資訊 2014年10月29日星期三Slide 35

  36. taiwan.elsevier.com ，台灣官網:Reaxys 資訊下載 2014年10月29日星期三Slide 36

  37. www.facebook.com/reaxysclub,FB粉絲團:最新消息與討論www.facebook.com/reaxysclub,FB粉絲團:最新消息與討論 2014年10月29日星期三Slide 37

  38. 如有相關問題請連絡： • 陳建丞 • c.chen@elsevier.com 相關網頁： • www.reaxys.com(首頁) • taiwan.elsevier.com(台灣官網) • www.facebook.com/reaxysclub(FB粉絲團)

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