Pål A. Jenum Avdelingssjef professor drd

1. Møteplassen Torsdag 5. juni 2014 Mage - tarm Urinveisinfeksjon Luftveisprøver Puss Pål A. Jenum Avdelingssjef professor dr.med

2. Generelt om prøvetaking Prøver inneholder ofte levende mikroorganismer Krever rask og profesjonell prøvebehandling: • Riktig anatomiske lokalisasjon • Riktig teknikk og utstyr(minimalisere kontaminering) • Korrekt transportmedium • Rask transport til laboratoriet. RELEVANTE KLINISKE OPPLYSNINGER !

3. HVA LETER VI ETTER?Diare - definisjoner • Akutt diaré ≤ 14 dagers varighet • Persisterende diaré > 14 dager • Kronisk diaré > 30 dagerNon-infeksiøse årsaker er mer vanlig ved persisterende og kronisk diaré ”Langvarig”? 2 dager–2 måneder? – Hvor lenge!

4. Fæcesprøver • } Duplex-PCR HVA LETER VI ETTER? Campylobacter-Salmonella-Shigella-Yersinia Cary Blair medium EHEC, EPEC, (ETEC) – spesiell indikasjon dyrkning pluss PCR Norovirus (PCR, to genotyper) Uten tilsetning Rotavirus (antigen test) Adenovirus (antigen test) Clostridiumdifficiletoxin A+B (antigen test) Uten tilsetning/CBM GDH-test (glutamat dehydrogenase) → CD-toxin→ dyrk→ CD toxin Parasitter (mikroskopi) Parasittmedium HUSK gode kliniske opplysninger

5. Fæcesprøver EHEC + EPEC • Dyrker frem E.coli • Genetisk analyse på forekomst av Stx1+ Stx2 + eae (intimin) gener • Klassisk EHEC har alle disse tre genene • Atypisk EHEC har minst ett Stx-gen, men kan mangle andre • EPEC har kun eae intimin-gen • Klassisk ETEChar lt1, st1a og st1b gen (testes ikke rutinemessig) • Andre enteropatogene E.coli: • EIEC enteroinvasiv: ipah-gen • EAEC enteroaggregerende: aggr-gen

6. Utstyr Cairy-Blair transport medium Transporttid: 24-48 t Campylobacter Salmonella Shigella Yersinia EHEC/EPEC Para-Pak for parasitter Giardia Cryptosporidium Entamoeba Cyclospora (Oxuris, ascaris, shcistosomiasis, trichuris etc) Steril kontainer uten tilsetning Norovirus Rotavirus Adenovirus Clostridium difficile toxin A+B (etter AB-behandling) (OBS max 24 timer)

7. Urin KLINISK BILDE • «UVI symptomer» • UVI • Dysuri • Minst to av følgende: • feber (OBS eldre infeksjonstegn uten klart fokus) • pollakisuri • hematuri • bankeømhet i nyreregion • «Ikke UVI symptomer» • UVI? • vond lukt av urin, grumset urin • positiv stix • ingen opplysninger NB

8. Urin KLINISK BILDE • Asymptomatiskbakteriuri ? • Gravide • Etter behandling ved residiverende UVI • Før kirurgi i urinveiene

9. Urin PRØVETAKING Hovedpoeng: UNNGÅ kontaminering • Midtstrømsprøve • NB: Klamydia: førstestråle!! • Blærepunksjon • Kateterprøve • Engangskateter • Permanentkateter NB: Kolonisering • Poseprøve for spebarn? • «Alltid» kontaminert. Kun negativ dyrkning har sikker verdi.

10. Urin FORSENDELSE Hovedpoeng: RASKT til laboratoriet • Urin uten tilsetning • Kun dersom levert lab umiddelbart for utsæd • Urin på borsyre • Foretrukket valg. Borsyre er bakteriostatisk (2-3 dgn) • Dyppeagar Fordeler • Raskt negativt svar, indikasjon på species Ulemper • Forsinket svar ved positivt funn, • vanskelig å vurdere forurensning, • vanskelig å vurdere lave bakterietall ved reell infeksjon

11. Urin forsendelse Urin beholder MED borsyre Urin beholder UTEN borsyre

12. Urin TOLKNING Hovedpoeng: Hvilken bakterie! • Primær- og sekundærpatogene: • E.coli, S.saprophyticus, Salmonella • Klebsiella, Proteus, EnterobacterEnterokokker, S.aureus, Pseudomonasaeruginosa • Tvilsomt patogene, apatogene • KNST, Aerococcus, Pseudomonas, gjærsopp, Gruppe B streptokokker (OBS gravide), grønne streptokokker, Lactobaciller, Gardnerella

13. Urin TOLKNING Hovedpoeng: UVI kontra Assymptomatisk Primær- og sekundærpatogene • Renkultur • UVI >10.000 bakterier/ml • 103 – 104 bakt/ml: Forurensning mulig • Assympt > 100.000 bakterier/ml • 103 – 104 bakt/ml: Ingen signifikant vekst • 104 – 105 bakt/ml: Forurensning mulig • Blærepunksjon • >100 bakterier/ml

14. Urin TOLKNING • Én i dominans (>80%): Dominerer i blanding Forurensning mulig • 2 arter isolert • Lik mengde: Forurensning sannsynlig • > 2 arter: Blandingsflora. Forurensning (sannsynlig) • Tvilsomt patogene og apatogeneUansett mengde: Forurensning (sannsynlig)

15. Luftveisprøver HVA LETER VI ETTER? Bakteriologisk dyrkning ved klinisk sykdom • NESE • Ved otitt, sinusitt, rhinitt, bronkitt (?), pneumoni (?) Pneumokokker, H.influenzae, Beta-hemolytiske streptokokker Moraxellacatharrhalis • HALS • Ved tonsilitt, hissig pharyngitt Beta-hemolytiske streptokokker (Gruppe A, C og G) Bordetella pertussis, Corynebacteriumdiphtheriae dyrkes ikke

16. Luftveisprøver HVA LETER VI ETTER? Bakteriologisk dyrkning ved klinisk sykdom • EKSPEKTORAT • Sjelden indisert (obs TB) • ØYE, ØRE (perforert otitis media) • Funn som ved neseprøve

17. Luftveisprøver HVA LETER VI ETTER? Genmolekylær analyse ved klinisk sykdom • Nasopharynxpensel /halspensel E-swab ØLI, NLI • Mycoplasmapneumoniae, Chlamydia pneumoniae, Bordetella pertussis (Hostepakke) • Influensa A og B, Parainfluensa 1-2-3 • Rhinovirus, Metapneumovirus, RSV (barn), • Enterovirus, parechovirus • Adenovirus

18. Luftveisprøver eSwab transportmedium (flytende!)Leveres med tynn eller tykk pensel. Fargen på korken kan variere. AMIES transportmediumfor bakterier E-swab Pensler til PCR Amies Pensler til bakteriologisk dyrkning Benyttes til prøver som skal: 1. Undersøkes på kravstore bakterier Anaerobe bakterier (dype sår), Gonokokker 2. Undersøkes med PCR teknikkVirus(Herpes Simplex,Varicella, RSV, Influensa m.m), Mycoplasmapneum., Respiratorisk chlamydia, B.pertussis Eswab utleveres fra laboratoriet. Brukes rutinemessig. Prøven bør oppbevares i kjøleskap før forsendelse. Benyttes for undersøkelse av: Pussprøver, overflatiske sår, øre, nese, hals, sopp og MRSAPrøven bør sendes samme dag, evt oppbevares i kjøleskap for så å sendes neste dag.

19. Sårprøver HVA LETER VI ETTER? Postoperative sår / skadesår • Stafylococcusaureus (inklusive MRSA) • Beta-haemolytiske streptokokker • Pseudomonasaeruginosa • Pasteurella (bittsår) • Blandingsinfeksjoner -> kolonisering (obs diabetes) • Anaerober (abscesser, bitt, diabetes) Trykksår • Oftest blandingsinfeksjoner KOLONISERING – LOKALBEHANDLING SÅRSTELL