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PubMed. 网址: www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed 主讲 : 何卫华 (广西医科大学图书馆). 教学要求. 了解 PubMed 数据库的基本概况 熟悉 PubMed 的检索界面 掌握 PubMed 的基本检索方法. PubMed. 美国国立医学图书馆国家生物技术信息中心开发 特点: 1. 免费提供题录和文摘 2. 可与提供原文的网址链接 ( 部分免费获取) 3. 提供检索词自动转换匹配 4. 操作简便、快捷. 数据收录范围. OldMEDLINE : 1966 年以前的文献
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PubMed 网址:www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed 主讲:何卫华 (广西医科大学图书馆)
教学要求 • 了解PubMed数据库的基本概况 • 熟悉PubMed的检索界面 • 掌握PubMed的基本检索方法
PubMed • 美国国立医学图书馆国家生物技术信息中心开发 • 特点: 1.免费提供题录和文摘 2.可与提供原文的网址链接(部分免费获取) 3.提供检索词自动转换匹配4.操作简便、快捷
数据收录范围 • OldMEDLINE:1966年以前的文献 • MEDLINE:1966至今,收录世界上70多个国家和地区的4500多种生物医学期刊,数据每周更新。[indexed for MEDLIEN] • PreMEDLINE:提供MEDLINE尚未经规范处理的数据,经标引后再加入MEDLINE。记录中有[in process]的标记,日更新。 • Publisher Supplied Citations:出版商直接向PubMed提供电子记录,包括MEDLINE未收录的部分记录,时时更新。
执行检索 基本检索输入框 特征栏提供辅助检索功能 侧栏提供其他检索如期刊数据库检索、规范词数据库检索、特定文献检索
PubMed检索方法 • 1.基本检索:在基本检索界面下完成的检索方法。 • 2.高级检索:在特征栏和左侧栏的辅助下进行的检索方法。
在检索栏中输入: 一个或多个检索词(系统默认空格为AND检索)如:hepatitis virus 著者姓名,姓在前,名在后,如:smith ab 刊名,可输全称或MEDLINE认可的标准缩写形式如:clin exp immunol 布尔逻辑运算式(运算符须大写)如: stem[ti] AND neuroscience PubMed 基本检索规则
多个检索词输入: Moore AM撰写的有关接触性皮炎的文章
刊名的输入 (字段限定来源出处SO)
检索式输入 仅检索有文摘的文献
常用字段标识符: • AD 作者地址 • AB 文摘 • AU 著者姓名 • JA 期刊名称 • LA 语言文种 • MAJR 主要MeSH主题词 • MH 全部MeSH主题词
PG 期刊页码 • DP 文献出版日期 • PT 文献类型 • SH 副主题词 • TW 文本词 • TI 题名词 • VI 卷 • IP 期
检索系统的主要特点: 1、检索词自动转换功能 • 自动对照MeSH词表、刊名转换表、短语表、著者名索引, 依次寻找转换 • 短语寻找转换单词转换 • 单词在上述四个字段寻找转换在所有字段中转换 2、截词检索功能:treat*
3、强制检索功能:“single cell”(不再自动转换匹配和扩展检索) 4、链接功能: (1)链接相关文献。 (2)链接 NCBI其他数据库。 (3)链接外部资源。 (4)链接相关图书。
高级检索一、PubMed的辅助检索(特征栏) 1、限制检索( Limits ) • 字段限制:著者、刊名、篇名等 • 数据录入时间:限制选择30天~10年 • 出版日期限制 • 文献类型限制: 7种 • 语种限制: 7种 • 子文档: 13种
输入检索词,系统默认空格为AND关系 限制检索界面 检索词来源字段限制 研究对象年龄限制 文献类型 选择限制 数据录入 时间限制 语种 限制 只要有文摘 的文献限制 文献发表 日期限制 子文档
2、预览/索引(Previw/Index) • 预览检索式和检索结果的记录数 • 修改检索策略 (可用检索式编号#1 OR #2) • 从索引表(Index)中选词检索
检索预览 检索结果 索引加词 检索
步骤1 点击预览和索引 步骤2 输入待选词 步骤4 确定与检索栏中检索提问的逻辑关系 步骤3 索引选词
3、检索史(History) • 检索式回顾:检索号、检索式、检索时间、检索记录数 • 编辑检索式 如:#3 AND child 注:最多可保留100个检索式。
检索历史回顾 检索号 检索时间 检出篇数 检索式 清除检索史
4、粘贴板(Clipboard) • 存放检索结果,最多可存放500条记录。 2.选择Clipboard 1.选择记录
5、细节(Details) • 显示检索词转换匹配运算详细过程 • 用途: (1)转换、确定规范词 如:liver cancerliver neoplasms (2)修改检索策略
检索明细 数据库匹配过程 规范词转换 你输入的检索式
修改检索策略的方法: • 1.检索框中随时修改 • 2.利用“Limit” 、 “Preview/Index”、 “History”、“Details”功能键实现。
二、左侧栏检索功能 1.Mesh Database • 功能:确定规范检索词;查看词义注释、树状结构表;副主题词、扩展主要主题词等。 • 例:欲查SARS(严重急性呼吸窘迫综合症)是否有相关规范词,什么时候在系统中建立该词,有关治疗有无文献?
2.输入检索词 3.执行检索 4.点按此处可获详细注解 1.选择MeSH数据库检索
点击此处执行检索 点击此处确认 选择副主题词
通过MeSH Database 检索的结果
2.引文匹配器(Citation Matcher): • 功能:输入题录信息,查找特定文献进行补缺。 注意:刊名要准确,缩写要标准;著者姓名大小写均可 如查找:由Chang PY撰写在1975年taiwan yi xue hui za zhi 上发表的文献的其他著者
输入待检刊名 输入出版年 输入待检第一著者 特定文献查找(已知文献第一著者,欲查其他信息如其他著者等)
3.期刊数据库(Journal database): • 通过输入刊名全称或缩写名等浏览期刊文献。 • 提供电子原文的超链接。
输入待检期刊名 得出期刊详细信息
4.临床问题(Clinical Queries): • 专门检索临床研究方法学(循证医学)文献,主要涉及治疗、诊断、病因、和预后四个分类,并提供强调选择,即敏感度(强调查全)或专指度(强调查准)。
5.临床警示(Clinical Alerts): 1991年开始,美国卫生健康研究所( NIH )不定期公布能引起死亡率和致病率升高的临床试验项目重要新闻稿。
6、PMC (PubMed Center) • 生命科学期刊资源中心 • 免费提供185多种期刊全文(至2005/5/11止)
检索结果输出 • 显示检索结果 • 保存检索结果 • 保存检索策略 • 打印检索结果
显示字段选择(Display) • Abstract:来源期刊、标题、著者、著者地址、记录性质、文献类型、勘误、评论、PMID或UI、摘要。 • Citation: 显示除上述内容外,加MeSH词、化学物质名称、资助项目号等字段。 • MEDLINE: 字段最完整,有标识符
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