INFRAČERVENÁ A RAMANOVA SPEKTROSKOPIE aneb CO NÁM MOHOU VIBRACE ŘÍCI O (BIO)MOLEKULÁCH

1. INFRAČERVENÁ A RAMANOVA SPEKTROSKOPIE aneb CO NÁM MOHOU VIBRACE ŘÍCI O (BIO)MOLEKULÁCH Vladimír Baumruk Univerzita Karlova v Praze Matematicko-fyzikální fakulta Fyzikální ústav UK

2. vibrační spektroskopie • infračervená spektroskopie (IČ) • Ramanova spektroskopie (RS) Metody 2

3. Vibrační spektroskopie – princip nesymetrickáaktivní v IČ symetrickáaktivní v RS n = 33n – 5 = 4 2 valenční vibrace 2 deformační vibrace (degenerované)aktivní v IČ střed symetrie alternativní zákaz vibrace aktivní v IČ spektru nejsou aktivní v Ramanově spektru a vice versa (tedy komplementarita IČ a Ramana) frekvence vibrace f – silová konstanta (síla vazby) – redukovanáhmotnost CO2 - lineární molekula (O=C=O) se středem symetrie 3

4. Vibrační spektroskopie – princip nesymetrickáaktivní v IČ symetrickáaktivní v RS n = 33n – 5 = 4 2 valenční vibrace 2 deformační vibrace (degenerované)aktivní v IČ střed symetrie alternativní zákaz vibrace aktivní v IČ spektru nejsou aktivní v Ramanově spektru a vice versa (tedy komplementarita IČ a Ramana) frekvence vibrace f – silová konstanta (síla vazby) – redukovanáhmotnost CO2 - lineární molekula (O=C=O) se středem symetrie 4

5. Vibrační spektroskopie – princip Ramanův posuvnvib = n0-nR • vibrace aktivní v IČ spektru (změna dipólového momentu) • vibrace aktivní v Ramanově spektru (změna polarizovatelnosti) 5

6. Vibrační spektroskopie – spektra IČ daleká IČ (FIR) intenzita rozptylu propustnost (%) Raman vlnočet (cm-1) Infračervené absorpční a Ramanovo spektrum kyseliny benzoové 6

7. Jednoduché molekuly – symetrie a vibrace (příklad CCl4) n2 214 cm-1 2x degenerovaná n4 313 cm-1 3x degenerovaná n1 460 cm-1 plně symetrická n3 780 cm-1 3x degenerovaná polarizované spektrum depolarizované spektrum infračervená absorpce 7

8. Detailní pohled nan1pás v Ramanově spektru CCl4 C 35Cl337Cl C 35Cl237Cl2 C 35Cl4 n1 -symetrická valenční vibrace C 35Cl 37Cl3 vlnočet (cm-1) Izotopické štěpení díky existenci dvou stabilních izotopů 35Cl a 37Cl (jednotlivé komponenty odpovídají různému zastoupení těchto dvou izotopů v molekule CCl4) 8

9. Vyzařování oscilujícího dipólu směr šíření Oscilující elektrický dipól Úhlové rozdělení amplitudy E (---) a zářivosti I ( ) oscilujícího elektrického dipólu. 9

10. (b) (a) Rozptyl Rozptyl lineárně polarizovaného světla molekulou 10

11. Rozptyl Rozptyl nepolarizovaného světla molekulou 11

12. izotropní invariant anizotropní invariant Polarizovaný Ramanův rozptyl Depolarizační poměr tenzor polarizovatelnosti Totální spektrum Měření polarizovaných Ramanových spekter v pravoúhlé geometrii experimentu 12

13. Polarizovaná Ramanova spektra orthorombického monokrystalu x z y z x y x z y z z y rozptyl rozptyl rozptyl rozptyl rozptyl rozptyl y y x x z x excitace excitace excitace excitace excitace excitace monokrystal síranu adeninu x(yz)y y(xz)x z(xy)x Portova notace x(yy)z y(zz)x x(yy)z T=300K oblast vnitro-molekulárních vibrací z(xx)y 13

14. Polarizovaná Ramanova spektra orthorombického monokrystalu x x z x z y y x x y rozptyl rozptyl rozptyl rozptyl rozptyl y y z z z excitace excitace excitace excitace excitace monokrystal síranu adeninu x(zx)z bez analyzátoru x(zx+zy)z x(zy)z bez analyzátoru z(yx+yz)y T=10K nízkofrekvenční oblast (mezimolekulární vibrace) z(zy)y 14

15. 15

16. 16

17. pás polykrystalické komponenty pás amorfní komponenty Dvoufázový systém - mikrokrystalický křemík v amorfní matrici Tsu et al. Appl. Phys. Lett. 40, 534 (1982) 17

18. Proč vibrační spektroskopie ? • strukturní informaci lze získat v relativně krátkém čase (proto nachází využití například v proteomice) • neomezuje se pouze na statický obrázek(citlivost ke změnám, možnost dynamických studií) • velikost studovaných molekul a povaha okolního prostředí nepředstavují žádné omezení (a nebo jen výjimečně) • je to mimořádně vhodná metoda pro zkoumání vztahu mezi strukturouafunkcí biomolekul 18

19. Výhody vibračníspektroskopie • RS a IČ jsou nedestruktivní metody(možnost testování biologické aktivity po skončení měření). • Aplikovatelné na vzorky libovolné morfologie (roztoky vodné i nevodné, suspenze, precipitáty, gely, vrstvy, vlákna, prášky, monokrystaly, …). Pro biomolekuly lze tak ověřit nakolik se shoduje či naopak odlišuje jejich struktura v krystalu a v roztoku. • Nenáročné na objem vzorku (cca 10 ml pro konvenční RS, 20 ml pro IČ). • Rychlá časová škála absorpce i rozptylu ( 10-15 s)- využití vibrační spektroskopie pro časově rozlišené studie procesů, které nejsou přístupné pomocí fluorescence či NMR. • Existence rozsáhlé databáze IČ a Ramanových spekter (včetně přiřazení pásů jednotlivým vibracím a známých strukturně-spektrálních korelací). 19

20. Specifické výhody Ramanovy spektroskopie • Voda představuje ideální rozpouštědlo pro Ramanovu spektroskopii (na rozdíl od IČ). • Intenzívní pásy v Ramanových spektrech pocházejí od vibrací, při kterých dochází k velké změně polarizovatelnosti (např. aromatické molekuly). • Relativně snadné měření i v oblasti nízkých vlnočtů (pod 400 cm-1, daleká IČ oblast) v jediném experimentu se základní oblastí • Selektivní rezonanční zesílení (tzv. rezonanční Ramanův jev). • Povrchem zesílený Ramanův rozptyl (SERS) (design SERS aktivního povrchu spadá do oblasti nanotechnologií) 20

21. Nevýhody vibrační spektroskopie • Spektrální rozlišení je sice vyšší než v elektronových spektrech, ale nižší ve srovnání s NMR. Nedostatečné rozlišení může být částečně kompenzováno chemickou (izotopická záměna) nebo biologickou (bodová mutace) modifikací. • Jsou potřeba relativně vysoké koncentrace vzorku ( 10-100 g/l) byť v malých objemech. • Jak H2O tak i D2O nejsou ideálním rozpouštědlem pro IČ spektroskopii (na rozdíl od Ramanovarozptylu). • Ramanův jev (nepružný rozptyl světla) je ze své podstaty slabý jev (ve srovnání s absorpcí nebo emisí světla). Je tedy nutná značná čistota vzorků a péče při manipulaci s nimi (velmi vadí fluorescence příměsí). 21