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TRIzol 法提取 RNA. 白洁. TRIzol 的作用成分. 苯酚:主要作用是裂解细胞,使细胞中的蛋白,核酸物质 解聚得到释放。 8 -羟基喹啉:抑制 RNase 异硫氰酸胍:属于解偶剂,是一类强力的蛋白质变性剂, 可使蛋白质二级结构消失,导致细胞结构降 解,核蛋白与核酸分离 β- 巯基乙醇:破坏 RNase 蛋白质中的二硫键. 原理.
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TRIzol法提取RNA 白洁
TRIzol的作用成分 • 苯酚:主要作用是裂解细胞,使细胞中的蛋白,核酸物质 解聚得到释放。 • 8-羟基喹啉:抑制RNase • 异硫氰酸胍:属于解偶剂,是一类强力的蛋白质变性剂, 可使蛋白质二级结构消失,导致细胞结构降 解,核蛋白与核酸分离 • β-巯基乙醇:破坏RNase蛋白质中的二硫键
原理 • Trizol试剂能够裂解细胞,促使核蛋白体的解离,使RNA与蛋白质分离,将RNA释放到溶液中去,加入氯仿后离心,样品分成水样层和有机层。RNA存在于水样层中。收集上面的的水样层后,RNA可以通过异丙醇沉淀来还原。
试剂准备: TROzol:裂解细胞,使细胞中的蛋白核酸物质解聚得到释放 KAc(4M,PH=4.8):去多糖以及其它杂质,提供酸性环境 NaAc(3M,PH=5.2):提供一价阳离子中和RNA的负电荷,从而中和RNA 分子间排斥作用,以达到共沉淀的效果 氯仿:一是能变性蛋白,抑制RNase活性 ,二是把水相里残余的苯酚抽提 掉;三是作为溶剂抽提样品中的一些脂溶性杂质(比如油脂、脂溶 性色素等),起到一定除杂作用 异丙醇:沉淀RNA 75%乙醇 :洗去残留异丙醇以及盐离子 无水乙醇:沉淀RNA
提取过程 • 一、样品抽提: 1、取植株幼嫩的叶片60-70mg,快速装入EP管,投到液 氮当中 2、在通风厨内进行研磨,所用研磨棒在NaOH中浸泡20min 左右,再用DEPC水冲洗 3、研磨至粉状后加入1mlTROzol,迅速混匀后室温静置 10min以上
二、分相: 4、加入335µl KAc,混匀后静置20-30min,12000g,6℃离心15min 5、在装有裂解物的离心管中加入0.2ml的氯仿,手摇混匀30s,室温下静置5分钟 6、12000 rpm 6℃离心15min,分相为三层。上层:RNA;中间:DNA;下层:蛋白质。 7、小心吸取上清液,转移到另一EP管中。1ml裂解物产生的上清液体积约为0.4~0.6 ml,有机相和中间层含有DNA和蛋白质,避免触及。(除去了DNA和蛋白)
三、RNA沉淀: 8、上清液加入约0.5ml的异丙醇,放置1h以上(可过夜沉 淀)。 9、12000rpm, 6℃离心10min 。 10、RNA沉淀将在离心底的侧面形成。小心吸弃上清液,注 意避免吸弃RNA沉淀。
四、RNA清洗: 11、加入1ml 预冷的75%乙醇(1mlTrizol至少1ml乙醇清洗),用手将沉淀弹起来,7000g 6℃离心5min。(两次) 12、去上清,离心30s,将残余液体吸取除去 13、室温下干燥,加入0.2mlDEPC水,20µlNaAc,660µl无水乙醇,混匀后-20 ℃静置1h以上(可过夜) 14、 12000g,6℃离心5min,弃上清,离心30s,残余液体吸取除去,晾干后加入DEPC水溶解。
五、检测: 取0.5µlRNA样品,用1%琼脂糖电泳检测质量 用超微量紫外分光光度计进行定量 260/280 260/230 c(ng/µl) 2.05 2.04 1207.7 2.04 2.02 921.9
常见问题分析: • 得率低:A.样品裂解或匀浆处理不彻底。B.RNA沉淀未完全溶解。 • A260/A280<1.8 :A.样品匀浆时加的试剂量太少。B.匀浆样品时未在室温放置5分钟。C.吸取水相时混入了有机相(内含蛋白,酚类)。D.RNA沉淀未完全溶解。 • RNA降解:A.组织取出后没有马上处理或冷冻。 B.溶液或离心管未经RNase去除处理。
DNA污染: A. 样品匀浆时加的试剂量太少。B. 吸取水相时吸入了DNA。 • 蛋白聚糖和多糖污染: 沉淀RNA的过程中作以下改进可去除这些污染,步骤7中,每使用1ml TRIzol在水相中加0.25ml异丙醇和0.25ml高盐溶液(0.8M柠檬酸钠和1.2MNaCl)混合离心,按之前操作进行。这种方法可使蛋白聚糖和多糖留在溶液中,高效沉淀出纯RNA。从含有大量多糖的植物中提取RNA时应在匀浆后离心,并加上以上操作步骤。