ScienceDirect Update!

ScienceDirect Update! Ally Kim (김아연 과장) Account Development Manager July 17th, 2009

Elsevier and ScienceDirect entered into a partnership with NextBio! Elsevier는 2009년 6월 12일 ScienceDirect contents(life science/ health science/ chemistry 분야)를 더욱 강화하고 관련 학문의 연구자들에게 양질의 정보를 제공하고자 NextBio사와 제휴하게 되었습니다. • ScienceDirect • Peer-reviewed Literatures • Contents • NextBio • Research Data • (PubMed/clinical trials/ • experimental data correlations/ news articles) Powerful ScienceDirect!

About NextBio - • 회사명 : NextBio/ 2004년 설립/ 미국 California, Cupertino 본사 • NextBio사는 생명 과학분야의 연구자에게 자료를 효과적이고편리하게 찾고, 공유할 수 있게 하는 • 혁신적 platform을 제공하는 회사입니다. • NextBio의 platform은 새로운 과학적 정보의 기본적인 내용은 물론, 연관성이 있는 모든 컨텐츠와 연결해 • 매우 효과적인 tools을 제공합니다. 연구의 생산성 및 연구 협력을 높이는 것을 목표로 하고 있습니다. • 현재 세계 유수 대학 및 기관에서 100만 명 이상의 연구자들이 NextBio를 이용하고 있습니다. • ex) Burnham Institute for Medical Research/ Celgene/ Eli Lilly/ Genzyme/ Johnson & Johnson/ Merck/ • Regeneron/ Scripps Research Institute/ Stanford University/ Takeda/ etc.

Challenge & Benefits for Researchers - • Challenge • Life science/ Health science/ Chemistry분야의 연구자들은 자료를 많이 확인 할 수 있지만, 본인의 연구와 관련된 • 자료를 찾고, 자료들의 연관성을 평가하기 위해 많은 시간을 할애합니다. • 특히 Gene/ Pathways/ Diseases/ Tissues/ Compounds 정보를 온라인으로 확인 가능하지만, 너무나 방대하고 • 검색된 자료들의 연관성 확인이 힘들다는 문제가 있습니다. • 중요한 자료를 놓치지 않는 것! 연구자들에게 필요한 시점입니다. • Benefits for Researchers through ScienceDirect • Speed of research – 연구자들이 필요로 하는 항목에 가장 유용한 정보를 담아 원하는 자료를 빠른 시간내에 찾을 수 • 있습니다. 자료를 쉽고 빠르게 찾을 수 있으며, 이는 정확하고 빠른 연구와 연구 업적으로 • 이어질 수 있습니다. • Discoverability – Peer-reviewed literature와 정확하고 적합한 자료로 새로운 연구 결과를 내는데 도움이 될 것 입니다. • Value – NextBio의 정확한 선별 데이터를 토대로 연구자들에게 가장 필요한 data를 제공합니다. • Convenience – 연구자들은 clinical trials, experimental data correlations, news, ScienceDirect • PubMed literature를 ScienceDirect에서 한번에 확인하실 수 있습니다. • Breadth – ScienceDirect정보(published from 1995)와 관련 분야(clinical trials, experimental data correlations, • news, ScienceDirect, PubMed literature)의 data 중 70%이상의 정보를 제공함으로써 • 폭넓은 연구활동을 가능하게 합니다. • 자! 이제 달라진 ScienceDirect를 경험해볼까요?

Search – SD에서 ex. ‘p53’(특정 유전자명) 검색 후 관련 article의 full-text를 열어봅시다. SD에 추가된 section! ;by NextBio

추가된 내용을 자세히 봅시다. 검색한 논문의 예) SD에 새로 추가된 항목 (5 categories) 1) Topic : p53 in neuronal apoptosis Abstract : ~~~~~p53~~~~~~~~~~~~~~~~~ ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~BAX~~~~~~~~ ~~~~~~~~~~BCL2~~~~~~~~~~~~~ Key words : ~~~,~~~,~~~,~~~~~~ Body(Introduction/ …/conclusion) ~~~~ serine~~~~~~~ ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~Alzheimer’s disease~~~ ~~~~~~~~~cytosol~~~~~~~ ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Reference 1)~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 2)~~~~~~~~~~p53~~~~~~ 3)~~~~~~~prion protein~~~~~~~~~ 4)~~~~~~~~~~~~~~~~cisplantin~~ 5)~~~~~~~non-neuronal cells~~~~~ ….. 2) 3) 4) 5) • 검색한 논문의 full text에서 위와 같은 • 특정 용어<ex>들은 5개의 category로 분류. • 관련 용어를 한번에 검색할 수 있는 강력한 tool로 ScienceDirect가 더욱 더 많은/ 양질의 서비스를 제공할 수 있게 되었습니다.

1) Genes(tab)은 어떤 정보를 제공하는가?  BCL2라는 특정 Gene을 클릭하면 아래와 같은 세분화된 정보가 새창에 뜹니다. 검색 유전자에 대한 자세한 정보를 얻으실 수 있습니다. BCL2(Gene)에 대한 간략한 정보. View all을 클릭하시면 더 많은 정보를 얻으실 수 있습니다. (Type/description/source/synonyms/phenotype) BCL2(Gene)과 관련된 ScienceDirect내의 논문 중 가장 유용한 논문 2개의 preview. View all을 클릭하시면 BCL2와 비슷한 용어 및 관련 용어/저자/ 기관/질병 등 SD내의 모든 정보들을 한꺼번에 확인하실 수 있습니다. BCL2와 관련된 조직/질병/치료에 대한 정보. 자료출처: NCBI GEO/ EBI ArrayExpress/ Broad Institute CMAP 2.0/ OMIM / Jackson Laboratory’s Mouse Genome Database 오른쪽 green bar는 검색단어(BCL2)와의 관련성 정도를 score로 확인하실 수 있습니다. BCL2(Gene)과 관련된 가장 유용한 임상실험 자료 중 2개 자료의 preview. 자료출처: ClinicalTrials.gov (NIH, USA) BCL2(Gene)과 관련된 PubMed내의 논문 중 가장 유용한 논문 2개의 preview. View all을 클릭하시면 BCL2와 비슷한 용어 및 관련 용어/저자/ 기관/질병 등 SD내의 모든 정보들을 한꺼번에 확인하실 수 있습니다. BCL2(Gene)과 관련된 가장 유용한 news article중 Max. 2개 자료의 preview. 자료출처: over 475 news feeds BCL2(Gene)과 관련된 논문중 top50에 해당하는 논문의 저자/기관/ 임상실험sponsor를 확인하실 수 있습니다.

관련 용어의 SciencDirect 자료 검색 검색한 용어와 관련된 ScienceDirect의 articles에자주 등장하는 용어들. 알파벳 순서로 나열되어 있으나, 많이 거론된 단어는 글자의 크기가 크다. ScienceDirect에서의 검색 결과

관련 용어의 PubMed자료 검색(SciencDirect에서 보실 수 있습니다) ScienceDirect에서 PubMed검색 결과를 확인!!! (abstract/full text)

관련 용어의 Clinical trials 자료 중 하나의 논문을 클릭한 결과 • 임상 실험(Clinical Trials) 결과 자료에 포함되는 사항 • 임상 실험 시작일, 종료일/ 임상 실험 목적/ 임상 실험 대상(나이/성) • 임상 실험 실시기관 contact info./ 임상 실험 sponsor & collaborator’s info.

2) Diseases(tab)은 어떤 정보를 제공하는가?  Alzheimer’s disease라는 특정 질병을 클릭하면 아래와 같은 세분화된 정보가 새창에 뜹니다. 이전 slide와 마찬가지로 관련 질병에 대한 자세한 정보를 얻으실 수 있습니다.

3) Compounds(tab) 는 어떤 정보를 제공하는가?  Serine이라는 특정 물질을 클릭하면 아래와 같은 세분화된 정보가 새창에 뜹니다. 아래 화학 구조식을 클릭. NCBI의 PubChem Compound 페이지가 연결됩니다. 이전 slide와 마찬가지로 관련 물질에 대한 자세한 정보를 얻으실 수 있습니다. Serine view complete details PubChem Compound 6857549 Name: Serine Molecular weight: 105.093 g/mol Molecular formula: C3H7NO3 Hydrogen bond donor count: 2 Hydrogen bond acceptor count: 3 Rotatable bond count: 1 Topological polar surface area: 88 Canonical SMILES: C(C(C(=O)[O-])[NH3+])O Isomeric SMILES: C([C@H](C(=O)[O-])[NH3+])O IUPAC name: (2R)-2-azaniumyl-3-hydroxy-propanoate InChI: InChI=1/C3H7NO3/c4-2(1-5)3(6)7/h2,5H,1,4H2,(H,6,7)/t2-/m1/s1/f/h4H PubChem Compound ID: 6857549 MappedID: 3335292 Synonyms: CHEBI:35243; (2S)-2-ammonio-3-hydroxypropanoate; (2R)-2-ammonio-3-hydroxypropanoate; L-Serine; L-serine zwitterion; CHEBI:33384; Serine; serine zwitterion; 2-Amino-3-hydroxypropionic acid; ZINC00895034. View all을 클릭. Serine compound의 화학식 구조및 분자량 등 기본적인 정보를 제공합니다. 허가된 약물/ 약물의 type 및 작용기전/ /독성test result/ dosage 및 half-life등의 포괄적인 정보를 확인하실 수 있습니다.

4) Tissues(tab)는 어떤 정보를 제공하는가?  Cytosol이라는 특정 물질을 클릭하면 아래와 같은 세분화된 정보가 새창에 뜹니다. (세포/ 신경계/ 혈장/ 말초신경계/ 등..) 검색한 단어(Cytosol)의 설명 제공 자료출처: 대개 ‘MeSH용어집’ 이전 slide와 마찬가지로 검색한 용어에 대한 자세한 정보를 얻으실 수 있습니다.

5) Biogroups(tab)은 어떤 정보를 제공하는가?  Prion protein이라는 특정 물질을 클릭하면 아래와 같은 세분화된 정보가 새창에 뜹니다. • Prion protein • view complete details • Name: Prion protein • Description: Prion protein (PrP-c) is a small glycoprotein found in high quantity in the brain of animals infected with certain degenerative neurological diseases, such as sheep scrapie and bovine spongiform encephalopathy (BSE), and the human dementias Creutzfeldt-Jacob disease (CJD) and Gerstmann-Straussler syndrome (GSS). PrP-c is encoded in the host genome and is expressed both in normal and infected cells. During infection, however, the PrP-c molecule become altered (conformationally rather than at the amino acid level) to an abnormal isoform, PrP-sc. In detergent-treated brain extracts from infected individuals, fibrils composed of polymers of PrP-sc, namely scrapie-associated fibrils or prion rods, can be evidenced by electron microscopy. The precise function of the normal PrP isoform in healthy individuals remains unknown. Several results, mainly obtained in transgenic animals, indicate that PrP-c might play a role in long-term potentiation, in sleep physiology, in oxidative burst compensation (PrP can fix four Cu2+ through its octarepeat domain), in interactions with the extracellular matrix (PrP-c can bind to the precursor of the laminin receptor, LRP), in apoptosis and in signal transduction (costimulation of PrP-c induces a modulation of Fyn kinase phosphorylation). • Taxonomy/Path: InterPro : Prion protein View all을 클릭. 검색한 단어 설명 제공 이전 slide와 마찬가지로 검색한 용어에 대한 자세한 정보를 얻으실 수 있습니다.

Summary • ScicenceDirect와NextBio사의 partnership으로 ScienceDirect에서의 포괄적이고 정확하며, 편리한 연구 자료 검색이 가능해졌습니다. • NextBio의 자료를 유용하게 쓸 수 있는 분야는 아래와 같습니다. • Life Science • Health Science • Chemistry • ScienceDirect에추가된 항목 • Genes • Diseases • Treatments • Tissues • Biogroups • Data Correlations • Most Prolific Researchers • ScienceDirect • PubMed • Clinical Trials • News 끝이 없는 자료 검색! ScienceDirect에 해답이 있습니다. 단한번의 key word search로 ScienceDirect내에서 무한한 연구 자료를 경험하세요!!

Contact Information ScienceDirect와 관련 문의사항을 아래 연락처로 문의 바랍니다. Elsevier Korea L.L.C. (엘스비어 코리아) 담당자 : 김아연 Tel : 02) 6714-3106 Fax : 02) 732-8689 Email : S&T.Korea@elsevier.com

ScienceDirect Update!