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Organizzazione del genoma Parte 2. Genoma batterico I procarioti non possiedono un nucleo. Il DNA batterico si trova sotto forma di molecola circolare a doppio filamento, senza estremità libere 3’ e 5’. Il DNA cromosomico è organizzato in una struttura condensata ( nucleoide ).
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Organizzazione del genoma Parte 2
Genoma batterico • I procarioti non possiedono un nucleo. • Il DNA batterico si trova sotto forma di molecola circolare a doppio filamento, senza estremità libere 3’ e 5’. • Il DNA cromosomico è organizzato in una struttura condensata (nucleoide). • Proteine simil-istoniche sono coinvolte nel compattamento del DNA: • HU: proteina instabile al calore • IHT fattore di integrazione dell’ospite • HNS: proteina strutturale del nucleoide stabile al calore • SMC: proteina di mantenimento strutturale dei cromosomi
Plasmidi Piccole molecole circolari, a doppio filamento, presenti nei batteri, in alcuni funghi e piante. Localizzazione extracromosomica, indipendenti e capaci di autoreplicazione Dimensioni variabili, da 2 a 100 kb
DNA mitocondriale Molecola circolare, a doppio filamento, non compattata da istoni Dimensioni variabili (16-18 kb negli animali, 100 kb-2,5 Mb nei vegetali) Codifica prevalentemente per enzimi coinvolti nel metabolismo energetico
Genomi ad RNA Frequenze di mutazione >1000 rispetto ai genomi ad RNA (mancanza di proof-reading activity da parte dell’RNA polimerasi; elevata velocità di replicazione) Virus eucariotici: RNA a singolo o doppio filamento Retrovirus: RNA a singolo filamento che si replica tramite intermedio di DNA Viroidi: RNA a singolo filamento, patogeni delle piante Patogeni subvirali (RNA satelliti): RNA a singolo filamento, presenti sia in animali che piante