1 / 23

GENETICA VAN GEHOORVERLIES

GENETICA VAN GEHOORVERLIES. 27 6 16. Known Genes. AANGEBOREN GEHOORVERLIES. ~ 1 in 900 children has congenital hearing impairment >20 dB in one or more frequencies. 50% environmental. 50 % inherited. Ototoxic drugs Acustic trauma Infections. 70% Nonsyndromic.

media
Download Presentation

GENETICA VAN GEHOORVERLIES

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. GENETICA VAN GEHOORVERLIES

  2. 27 6 16 Known Genes AANGEBOREN GEHOORVERLIES ~ 1 in 900 children has congenital hearing impairment >20 dB in one or more frequencies 50% environmental 50 % inherited • Ototoxic drugs • Acustic trauma • Infections 70% Nonsyndromic 30% Syndromic • Usher • Alport • Pendred • Norrie • Waardenburg • Branchio-Oto-Renal • Jervell and Lange-Nielsen ~%22 AD ~%22 AD ~%77 AR ~%77 AR ~%1 X-linked <%1 Mitochondrial 6

  3. WAAROM IS HET OPHELDEREN VAN OORZAKEN VAN ERFELIJKE ZIEKTEN BELANGRIJK? • Diagnose • Vraag van patiënt naar de oorzaak beantwoorden: • is het erfelijk? • Adequaat erfelijkheidsadvies • Vroege diagnostiek van familieleden – goede • begeleiding • Inzicht in genen/eiwitten die essentieel zijn voor • ontwikkeling en functie van het binnenoor • Handvaten voor therapie

  4. IN DE PRAKTIJK

  5. AUDIOGRAMMEN

  6. ARTA

  7. MyosineVIIa Asn458Ile

  8. HET BINNENOOR

  9. INZICHT DOOR DOOFHEIDSGENEN Kazmierczak et al 2007

  10. IDENTIFICATIE VAN ZIEKTEGENEN • Familiestudies – goede klinische karakterisatie • Identificatie van de chromosomale regio waarin het defect ligt • - Koppelingsonderzoek – homozygotiemapping • Identificatie van het defecte gen • - Welke genen liggen er in de regio – genome browsers? • - Welk van die genen is mogelijk betrokken? - databanken • * Expressiepatroon • * Functie van het gen • * Diermodellen • * Selectie van genen voor mutatieanalyse • - Mutatieanalyse • - Interpretatie van sequentievarianten • Alternatief: NextGenerationsequencing

  11. TURKSE FAMILIES - CONSANGUINITEIT • Homozygote mutaties • Homozygotie mapping – linkage analyse

  12.     N N N N N M M M M M x mutation x  M M HOMOZYGOSITY MAPPING

  13. Single Nucleotide Polymorphisms - SNPs Person A: Person B: …cctcctagggttgcaaagcctccttggctatg… …cctcctagggttgcatagcctccttggctatg… …cctcctagggttgcatagcctccttggctatg… …cctcctagggttgcatagcctccttggctatg… G T A C C C T G A T A A A T T G C T T G G C A G A T A A A T T A ~ 500,000 SNPs

  14. FAMILIE TR57 • Linkage interval: 11q13.2–q13.4, • ~ 59 known genes , 18 hypothetical gene

  15. DFNB63 LOCUS Fam TR57 15.5 Fam FT1A-G Fam FT2 Fam PKDF702 15.4 DFNA32 15.3 15.2 15.1 USH1C 14.3 D11S987 14.2 14.1 D11S1337 26 bekende of voorspelde genen 13 DFNB51 12 D11S4113 11.2 11.12 11.11 D11S4136 11 12.1 ~5.29 Mb 12.2 DFNB63 1.03 Mb 12.3 D11S4139 13.1 FGF3 13.2 13.3 DFNB63 13.4 D11S1314 13.5 MYO7A 14.1 D11S916 14.2 14.3 D11S2371 21 22.1 22.2 D11S1291 22.3 23.1 DFNB24 D11S4179 23.2 23.3 TECTA 24.1 24.2 24.3 25 DFNB20

  16. LRTOMT KARAKTERISATIE Genome browser build 36.1 LRTOMT1 LRTOMT2

  17. EFFECT VAN MUTATIES G163VfsX4 (c.358+4G>A) 3’ UTR A215A 3’ UTR A29SfsX54 (c.358+4G>A) W105R E110K R81Q Catechol-O-methyltransferase domein

  18. MOLECULAR MODELING

  19. EFFECT VAN MISSENSE MUTATIES

  20. LRTOMT IN DE MUIS

  21. BINNENOOR

  22. SAMENVATTING • Toegepaste bioinformaticais essentieel voor • verschillende stappen in studies naar ziektegenen • De structuur en functie van het humane genoom • en genen zijn nog lang niet in kaart gebracht • De oorzaak van DFNB63 is gelegen in defecten in • het LRTOMT gen. Het precieze effect van • mutaties in dit gen op de functie van het • binnenoor is nog niet duidelijk.

More Related