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Unix Raymond Ripp
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Windows - Linux Disques - Processeurs /home /genomics Windows Mac OS Linux ssh ssh titus ssh IGBMC Windows Mac OS Linux star6 ssh
SSH sur star8 • mon_pc_> ssh –l ripp –X titus.u-strasbg.fr • titus_ripp_> ssh –l ripp –X star8 • star8_ripp_> pwd /groupes/poch/ripp • star8_ripp_> cd CoursUnix • star8_CoursUnix_> ls MonPremierScript.tcsh • star8_CoursTcl_>MonPremierScript.tcsh
Les commandes élémentaires • cd /home/ripp • pwd • ls • cat /home/ripp/www/fifi.txt • more ./www/fifi.txt • rm ./www/fifi.txt • mkdir /home/ripp/CoursUlp • rmdir CoursUlp
...élémentaires toujours, • mv fifi.txt CoursUlp/toto.txt • cp /home/depulp1/p.tcl prog.tcl • cd CoursUlp • cd .. • chmod 755 fichier rwx r-x r-x • chmod 644 fichier rw- r-- r-- • chmod 640 fichier rw- r-- ---
...élémentaires encore ? • alias llt ls -rt • setgscope • man commande • apropos truc • date • logout
Une commande, c'est ... • ls commande UNIX • xplor fichier exécutable (compilation, link) • settex alias • sauvetout shell script • /home/ripp/p.exe avec chemin d'accès explicite • rehash shell built-in command
C'est toujours et uniquement... • un alias taper alias pour les connaitre tous • une Built-In Command du shell utilisé • un fichier qui se trouve dans le path which commande commande aliased to quelquechose commande : shell built-in command /usr/bin/commande
Un fichier exécutable • Fichier de commandes (shell script) • Ou fichier binaire obtenu par compilation et link • Fortran, C, C++ ... ou fichier système • on le reconnait par • son extension (.tcl, .csh, .pl, …) • file fichiercoeff alpha executable binay
Un shell script • sh, ksh, csh, tcsh, tclsh, perl, ... .......................................... shell que j'aime: tcsh • c'est un fichier texte contenant .................................. des commandes • la première ligne contient le nom du shell #!/bin/tcsh ................. qui est le programme qui interprète vos commandes
... le shell script • on y met des commandes • on l'exécute en tapant le nom du fichier • ça crée un sous-process • qui exécute • /etc/csh.cshrc • ~/.cshrc • les commandes du fichier • qui oublie tout avant de revenir au process • ou alors (pourlesnuls) : source fichier
Le path, • quand on tape une commande • on exécute un fichier • qui se trouve sur un disque • dans un répertoire cité dans le path
le path, • est un ensemble de répertoires • qui contient les fichiers exécutables • est prédefini echo $path • est modifié par certaines commandes setmolscript • peut être modifié par set path=dir $path addpath dir(rr)
le path. • si vous voulez qu'un fichier /bidule/chose/fifi • devienne une commande fifi • trois solutions • addpath /bidule/chose • cp /bidule/chose/fifi /home/bin/fifi • ln -s /bidule/chose/fifi /home/ripp/bin/fifi
Les plaisirs du lien • ln -s fichier lien • ln -s /home/ripp/moyenne /bin/moy c'est comme si /home/ripp/moyenne était copié • on fait vraiment comme si /bin/moy existait • ls -l /bin/moy (lrwx--... /bin/moy -> /home/ripp/moyenne) • rm /bin/moy (/home/ripp/moyenne reste) • rm /home/ripp/moyenne (le lien, seul, reste)
Input Output Pipeline 1/3 • Un programme « sympa » • lit des données en entrée ( input = stdin) • calcule • écrit les résultats en sortie ( output = stout) • signale les erreurs ( error = stderr) xplor < fichin > fichout
Input Output Pipeline 2/3 • Si on ne met pas < ou > • l’entrée standart est le clavier • la sortie standart est l’écran • la sortie erreur est aussi l’écran (>2 ou >&) • … mais si on veut que : la sortie de l’un est l’entrée de l’autre ?
Input Output Pipeline 3/3 • progA < fichin | progB • progA | progB | progC > fichou • Attention tous les programmes n’acceptent pas ce mécanismestdin stdout • Ne pas confondre entrée standart (avec <) et arguments
... des questions? ... plus de question? ... merci !