UNIX

1. UNIX Pour débutant

2. Applications En direct Navigateur Courrier Mode console Fenêtrage Windows DirectX X smtp http ssh Protocoles de communication Windows Max OS Linux serveur

3. Windows - Linux Disques - Processeurs /home /genomics Windows Max OS Linux ssh ssh titus telnet ou ssh IGBMC Windows star6 ssh

4. login • login: ripp • password: tres_secret • star6_ripp_> • star6_ripp_> pwd • /home/ripp • star6_ripp_> • star6_ripp_> logout

5. Les commandes élémentaires • pwd • ls • cat fichier • more fichier • rm fichier • mkdir repertoire • rmdir repertoire

6. ...élémentaires toujours, • mv ancien nouveau • cp source destination • cd repertoire • cd .. • chmod 755 fichier rwx r-x r-x • chmod 644 fichier rw- r-- r-- • chmod 640 fichier rw- r-- ---

7. ...élémentaires encore ? • alias llt ls -rt • setgscope • man commande • apropos truc • date • logout

8. Une commande, c'est ... • ls commande UNIX • xplor fichier exécutable (compilation, link) • settex alias • sauvetout shell script • ~ripp/prog/coucou avec chemin d'accès explicite • rehash shell built-in command

9. C'est toujours et uniquement... • un alias taper alias pour les connaitre tous • une Built-In Command du shell utilisé • un fichier qui se trouve dans le path which commande commande aliased to quelquechose commande : shell built-in command /usr/bin/commande

10. Un fichier exécutable • on le reconnait par • file fichiercoeff alpha executable binay • obtenu par compilation et link • Fortran, C, C++ ... ou fichier système

11. Un shell script • sh, ksh, csh, tcsh, tclsh, perl, ... .......................................... shell que j'aime: tcsh • c'est un fichier texte contenant .................................. des commandes • la première ligne contient le nom du shell #!/bin/tcsh ................. qui est le programme qui interprète vos commandes

12. ... le shell script • on y met des commandes • on l'exécute en tapant le nom du fichier • ça crée un sous-process • qui exécute • /etc/csh.cshrc • ~/.cshrc • les commandes du fichier • qui oublie tout avant de revenir au process • ou alors (pourlesnuls) : source fichier

13. Le path, • quand on tape une commande • on exécute un fichier • qui se trouve sur un disque • dans un répertoire cité dans le path

14. le path, • est prédefini echo $path • est modifié par certaines commandes setmolscript • peut être modifié par set path=dir $path addpath dir(rr)

15. le path. • si vous voulez qu'un fichier /bidule/chose/fifi • devienne une commande fifi • deux solutions • addpath /bidule/chose • ln -s /bidule/chose/fifi ~/bin/fifi

16. Les plaisirs du lien • ln -s fichier lien • ln -s /home/ripp/moyenne /bin/moy c'est comme si /home/ripp/moyenne était copié • on fait vraiment comme si /bin/moy existait • ls -l /bin/moy (lrwx--... /bin/moy -> /home/ripp/moyenne) • rm /bin/moy (/home/ripp/moyenne reste) • rm /home/ripp/moyenne (le lien, seul, reste)

17. Input Output Pipeline 1/3 • Un programme « sympa » • lit des données en entrée ( input = stdin) • calcule • écrit les résultats en sortie ( output = stout) • signale les erreurs ( error = stderr) xplor < fichin > fichout

18. Input Output Pipeline 2/3 • Si on ne met pas < ou > • l’entrée standart est le clavier • la sortie standart est l’écran • la sortie erreur est aussi l’écran (>2 ou >&) • … mais si on veut que : la sortie de l’un est l’entrée de l’autre ?

19. Input Output Pipeline 3/3 • progA < fichin | progB • progA | progB | progC > fichou • Attention tous les programmes n’acceptent pas ce mécanismestdin stdout • Ne pas confondre entrée standart (avec <) et arguments

20. ... des questions? ... plus de question? ... merci !