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Présenté par Amine Ghozlane

Présenté par Amine Ghozlane. Internship 05 march 2008. Webnm@ and TMM@. Skjaerven L., Jonassen I. et Reuter N. Juillet 2007 – Bioinformatics. Introduction. 3 types de mouvements Rotation Translation Slide 4 paramètres structuraux ont une influence sur ces mouvements ANOVA :.

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Presentation Transcript

  1. Présenté par Amine Ghozlane Internship 05 march 2008 Webnm@ and TMM@ Skjaerven L., Jonassen I. et Reuter N. Juillet 2007 – Bioinformatics

  2. Introduction • 3 types de mouvements • Rotation • Translation • Slide • 4 paramètres structuraux ont une influence sur ces mouvements • ANOVA :

  3. Normal mode analysis • Domaines des protéines ayant des mouvements de basse fréquence • Protéine divisée en bloc de 6 acides aminés • Peut représenter 80-90% des changements conformationnel globaux

  4. Minimisation de l’énergie potentielle (obtenir la conformation la plus stable) • Calcul de la matrice hessienne (dérivée seconde de l’énergie potentielle) • Diagonalisation de la matrice hessienne • Modèle atome…

  5. Tmm@ : • Rotation et translation

  6. Rotation Translation of Blocks

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