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VARIABILITE GENETIQUE

VARIABILITE GENETIQUE. la variabilité intra-population la variabilité inter-populations. VARIABILITE GENETIQUE INTRAPOPULATION. Paramètres d’étude de la variabilité intra population : . Richesse allèlique Fréquences allèliques Indices de diversité -Taux d’hétérozygotie observé

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VARIABILITE GENETIQUE

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Presentation Transcript

  1. VARIABILITE GENETIQUE

  2. la variabilité intra-population • la variabilité inter-populations

  3. VARIABILITE GENETIQUE INTRAPOPULATION

  4. Paramètres d’étude de la variabilité intra population :  • Richesse allèlique • Fréquences allèliques • Indices de diversité -Taux d’hétérozygotie observé -Taux d’hétérozygotie théorique  -Taux d’hétérozygotie non biaisé 

  5. I- Richesse allélique Nombre d’allèles différents présents dans une population - Pour un locus donné : - Si plusieurs loci : Nombre moyen d’allèle par locus 1 locus ayant 4 formes alléliques Nombre individu=12 Sensible à la taille de l’échantillon Ne tient pas compte de l’abondance Un allèle rare a le même poids qu’un allèle commun A=4 A=4

  6. Tableau : Nombre d’allèles pour le microsatellite OarCP34 présents chez les 6 races ovines étudiées.

  7. II-Estimation des fréquences alléliques • les fréquences alléliques sont calculés à partir des génotypes des individus étudiés dans une population • Les fréquences alléliques sont calculées par le logiciel GENETIX 4.03 (Belkhir et al. 2002) 2 x nbr d’animaux homoz pr l’allèle i + nbr d’animaux hétéroz pr l’allèle i Pi= 2N N : nombre total d’animaux typés au locus K

  8. Exemple du groupe sanguin MN chez l'hommeL’examen de 730 aborigènes australiens a donné les résultats suivants

  9. Les fréquences alléliques calculées sont les suivantes:

  10. Tableau : Fréquences alléliques pour le microsatellite OarCP34 chez les 6 races ovines étudiées

  11. Figure : Histogramme des fréquences alléliques pour le microsatellite OarCP34 dans les 13 races ovines étudiées.

  12. III- Indices de diversité • Taux d’hétérozygotie observé • Taux d’hétérozygotie théorique  • Taux d’hétérozygotie non biaisé 

  13. Taux d’hétérozygotie théorique une valeur théorique qui correspond à l’hétérozygotie de la population, en la supposant à l’EHW. 1k Hth=1-∑ P2ikx i =1 PiKx  est la fréquence de l’allèle i au locus k dans la population x.

  14. Taux d’hétérozygotie observé • le rapport du nombre d’animaux hétérozygotes sur le nombre total d’animaux typés pour un locus.

  15. Taux d’hétérozygotie non biaisé • Utilisé lorsque le nombre d’animaux testés est faible. • Formule • logiciel GENETIX 4.03 (Belkhir et al. 2002).

  16. En raison du faible nombre d’animaux typés, pour le microsatellite OarCP34 (13 à 30 ADN), nous tiendrons compte des valeurs des taux d’hétérozygotie non biaisés

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