Genetic diversity 3

1. Genetic diversity3 Drs. Sutarno,MSc.,PhD.

2. Diversitas Genetik Diversitasgenetik: variasipada level gen secara individual (polymorphism), danmemberikanmekanismebagipopulasiuntukberadaptasiterhadaplingkungannya yang selaluberubah.

4. Diversitas Genetik • Variasi menurun dalam atau antar populasi organisme. • Dikodekan pada sekuen 4 pasangbasa yang menyusun DNA • Dimunculkan oleh adanya mutasi pada gen dan kromosom • Diperkirakan ada 109 macam gen dari semua biota • Merupakan pustaka genetik yang sebagian besar belum terkuak

5. Diversitas Genetik • Diversitas genetik merupakan dasar bagi semua level biodiversitas di atasnya • Diversitas genetik menyediakan “blue print” bagi populasi maupun spesies yang membentuk suatu komunitas dan ekosistem • Variasi genetik memungkinkan terjadinya perubahan evolusi dan seleksi buatan

6. Diversitas Genetik • Diversitas genetik bisa jadi memiliki nilai ekonomi langsung (eg gen untuk resistensi, senyawa2 bioaktif dll) • Untuk konservasi dengan tujuan apapun,tergantung pada keakuratan analisis diversitas genetik • Preservasi diversitas genetik pada umumnya merupakan prioritas yang tinggi pada program konservasi.

7. Diversitas genetik?? • Informasi bagi semua kehidupan yang tersimpan di dalam struktur DNA • Kode genetik atau unit (basa,nukleotida) yang menyusun DNA pada dasarnya universal.

8. Kromosom adalah struktur yang mengandung DNA

9. Struktur DNA

10. Diversitas genetik?? • Secara struktur, untaian DNA dengan protein2 membentuk suatu kromosom • Bagian DNA dari suatu kromosom yang mengandung informasi untuk menyusun protein (atau RNA) disebut sebagai suatu “gen”

11. Struktur Kromosom

13. Diversitas genetik?? • Suatu gen panjangnya dapat terdiri dari beberapa ratus sampai sekitar dua ribuan unit (pasangbasa) • Suatu gen mengandung informasi untukpenyusunan protein atau RNA • Gen merupakan suatu unit khusus pembawa informasi hereditas.

19. Prokaryotes • Terdiri dari satu sel, tidak memiliki inti • Materi genetik berada pada satu kromosom sirkuler. • Jadi hanya satu kopi dari masing-masing gen dari setiap bakteri • Bakteri pada umumnya memiliki sekitar 1,000-2,000 gen

20. Eukaryot • Terdiri dari satu atau banyak sel dan memiliki inti sel • Materi genetik berada pada dua atau lebih kromosom linier yg terpisah pada inti sel • Organisme eukaryot umumnya memiliki sekitar 50,000 gen

21. Asal usul diversitas genetik • Mutasi = perubahan pada sekuen DNA dari suatu kromosom • Mutasi dapat terjadi di mana saja pada suatu kromosom • inilah merupakan sumber dari semua variasi genetik.

22. Mutasi • Kemungkinan perubahan: • Point mutation / single nucleotide polymorphism ( SNP ) • 5’ A T A C G T A … • 5’ A T G C G T A … • Duplicate sequence • Inverted sequence • Insert / delete sequence

25. Mengukur Diversitas genetik • Kromosom = kumpulan dari gen-gen plus “extra” DNA yang berada diantaranya yang tidak mengkodekan protein maupun RNA. • Disamping itu diluar inti terdapat DNA extranuklear • Gen-gen ini digunakan untuk mengukur diversitas genetik. • “extra” DNA mupun DNA extranuklear juga berguna dalam penilaian diversitas genetik.

26. Bagian yang berbeda dari DNA mengalami evolusi dengan kecepatan yang berbeda, “extra” DNA mengalami perubahan lebih cepat dibanding yang di dalam gen. • “Extra” DNA dapat berubah secara lebih cepat dan masing-masing individu kecepatan perubahannya berbeda-beda.

27. Pengukuran diversitas umumnya melibatkan: • pembandingan sekuen DNA dan • pencarian perubahan susunan basa • Hilangnya diversitas genetik= hilangnya diversitas genetik yang berguna dalam waktu pendek dan reduksi kemungkinan evolusi dalam jangka panjang.