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MPI I/O

MPI I/O. MPI I/O Introdução. Definição de um conjunto de rotinas para transferência de dados, de e para, meios externos de armazenamento. O MPI I/O oferece várias vantagens sobre as tradicionais linguagens de I/O. MPI I/O Vantagens.

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  1. MPI I/O

  2. MPI I/O Introdução • Definição de um conjunto de rotinas para transferência de dados, de e para, meios externos de armazenamento. • O MPI I/O oferece várias vantagens sobre as tradicionais linguagens de I/O.

  3. MPI I/O Vantagens • Flexibilidade - MPI I/O fornece mecanismos para o acesso coletivo (muitos processos coletivamente lêem e escrevem em um único arquivo, I/O assíncrono e acesso strided. • Portabilidade - Muitas plataformas suportam a interface MPI I/O • Arquivos escritos pelo MPI I/O são portáveis entre plataformas.

  4. MPI I/O Conceitos Fundamentais • Um arquivo MPI é uma lista ordenada de estruturas de dados MPI (MPI_CHAR, MPI_INT, etc) • As rotinas MPI I/O suportam acesso seqüencial ou randomico. • Um arquivo pode ser aberto por qualquer processo MPI. Qualquer operação de I/O pode ser executada pelo pelos processos MPI relacionados, ou seja, este arquivo é visível para o conjunto de processos.

  5. MPI I/O Views • Uma view define como os dados são visiveis para cada processo. • Uma view é composta de: • Deslocamento • etype (Tipo elementar) • Filetype

  6. MPI I/O Views - Estrutura • Deslocamento: um deslocamento medido em bytes, do inicio do arquivo. • ETYPE: define a unidade dos dados acessados. Pode ser predefinido ou derivado do MPI • FILETYPE: define um “molde” para o acesso ao arquivo.

  7. MPI I/O Views - Filetype • Consiste em um número de etypes e “furos” (os quais são de tamanhos múltiplos do etype) • Um filetype básico, repete estas estruturas várias vezes, criando regiões de acesso permitidas (onde etypes são definidos) e regiões de acesso negado (onde os “furos” são definidos)

  8. MPI I/O Views - Filetype • É possível para diferentes processos definir diferentes filetypes, com diferentes views. Ex:

  9. MPI I/O Rotinas Básicas

  10. MPI I/O Rotinas Básicas

  11. MPI I/O Rotinas Básicas

  12. MPI I/O Rotinas de Acesso

  13. MPI I/O Rotinas de Acesso

  14. MPI I/O Rotinas de Gerais

  15. MPI I/O Link’s • http://www.mcs.anl.gov/romio • http://www-unix.mcs.anl.gov/mpi/mpich/ • http://www.mpi-forum.org/docs/mpi20html/mpi2-report.html • http://www.mpi-forum.org/docs/docs.html • http://wwwunix.mcs.anl.gov/romio/papers.html • http://hpcf.nersc.gov/software/libs/io/mpiio.html

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