1 / 51

Biomedicinske baze podataka dostupne u Hrvatskoj

Biomedicinske baze podataka dostupne u Hrvatskoj. Goran Škvarč, M.A., CARNet m r.sc. Jadranka Stojanovski, IRB. O Centru za online baze podataka Raspoložive baze podataka Načini pristupa Pretraživanje Posebnosti biomedicinskih informacija. Zašto baz e podataka ?.

shandi
Download Presentation

Biomedicinske baze podataka dostupne u Hrvatskoj

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. Biomedicinske baze podataka dostupne u Hrvatskoj Goran Škvarč, M.A., CARNet mr.sc. Jadranka Stojanovski, IRB

  2. O Centru za online baze podataka • Raspoložive baze podataka • Načini pristupa • Pretraživanje • Posebnosti biomedicinskih informacija MICC 2006, Zagreb, Medicinski fakultet Sveučilišta u Zagrebu, 7 i 8. lipnja 2006.

  3. Zašto baze podataka? • vjerodostojnost, ugled– proizđača baze, posrednika, informacijskog servisa • jedinstvenost, ujednačenost • pokrivenost - koji časopisi su uključeni u bazu, retrospektivnost, sadržaj baze, koliko i koje baze pokriva sam servis • ažurnost - kako često se baza ažurira • pristup – da li se pretraživanje provodi dovoljno brzo na poslužiocu proizvođača/agregatora MICC 2006, Zagreb, Medicinski fakultet Sveučilišta u Zagrebu, 7 i 8. lipnja 2006.

  4. ...značajke... • mogućnosti pretraživanja- Booleovi operatori, indeksi koje se može pregledavati, pretraživanje više baza podataka istovremeno, ograničavanje pretraživanja, složena pretraživanja, pohrana rezultata pretraživanja... • Pretraživanje uz pomoć tezaurusa • Pretraživanje slobodnog teksta, upiti na prirodnom jeziku • komandna sintaksa MICC 2006, Zagreb, Medicinski fakultet Sveučilišta u Zagrebu, 7 i 8. lipnja 2006.

  5. ...značajke • prikaz i izlaz (output)- broj rezultata, skraćeni prikaz, redanje rezultata, označavanje, formati za učitavanje na drugo računalo • lakoća korištenja, intuitivnost sučelja • podrška i izobrazba– materijali, upute, context sensitive help... • dokumentacija • odnos vrijednosti, dodane vrijednosti i cijene MICC 2006, Zagreb, Medicinski fakultet Sveučilišta u Zagrebu, 7 i 8. lipnja 2006.

  6. http://www.online-baze.hr MICC 2006, Zagreb, Medicinski fakultet Sveučilišta u Zagrebu, 7 i 8. lipnja 2006.

  7. Centar za online baze podataka je informacijski servis i projekt Ministarstva znanosti, obrazovanja i športa, CARNeta i Instituta Ruđer Bošković Osnovna je zadaća Centra omogućavanje što jednostavnijeg pristupa komercijalnim i drugim bazamapodataka akademskoj i znanstvenoj zajednici RH Nacionalni konzorcij Projekt je pokrenut 1995. godine Centar je u početku nudio jednu bazu podataka, a danas ih nudi šezdesetak, uključujući zbirke elektroničkih časopisa i arhive u otvorenom pristupu Centar za online baze podataka MICC 2006, Zagreb, Medicinski fakultet Sveučilišta u Zagrebu, 7 i 8. lipnja 2006.

  8. Centar za online baze podataka: • osigurava: • Nabavu bibliografskih baza podataka i baza podataka s cjelovitim tekstom; • Pristup; • Administraciju; • Financiranje; • Promociju; • Edukaciju. MICC 2006, Zagreb, Medicinski fakultet Sveučilišta u Zagrebu, 7 i 8. lipnja 2006.

  9. Podrška korisnicima, izobrazba i seminari • usprkos prijateljskim sučeljima i pomoći na svim razinama - izobrazba je nezaobilazna • jednodnevni ili dvodnevni besplatni seminari • učenje na daljinu (online tečajevi) • elektronički (help@baze.szi.hr) i telefonski "help desk" (01 4561 043 Jurica Grzunov). • priručnik za pretraživanje MICC 2006, Zagreb, Medicinski fakultet Sveučilišta u Zagrebu, 7 i 8. lipnja 2006.

  10. MICC 2006, Zagreb, Medicinski fakultet Sveučilišta u Zagrebu, 7 i 8. lipnja 2006.

  11. ŠTO JE NA RASPOLAGANJU? MICC 2006, Zagreb, Medicinski fakultet Sveučilišta u Zagrebu, 7 i 8. lipnja 2006.

  12. Područje biomedicinskih znanosti MICC 2006, Zagreb, Medicinski fakultet Sveučilišta u Zagrebu, 7 i 8. lipnja 2006.

  13. 32 biomedicinske baze podataka MICC 2006, Zagreb, Medicinski fakultet Sveučilišta u Zagrebu, 7 i 8. lipnja 2006.

  14. MICC 2006, Zagreb, Medicinski fakultet Sveučilišta u Zagrebu, 7 i 8. lipnja 2006.

  15. Neke od baza podataka u Centru • Current Contents (Institute for Scientific Information) 1993 do danas • MEDLINE (National Library of Medicine) 1966 do danas • Ovid Core Biomedical Collection (Ovid Technologies) 1993 do danas - uključen u Journals@Ovid Full Text • INSPEC (Institute for Electrical Engineers) 1969 do danas • EVIDENCE-BASED MEDICINE REVIEW (Ovid Technologies) 1991 do danas • AGRICOLA (National Agricultural Library ) 1979 do danas • ERIC (ERIC Processing and Reference Facility) 1966 do danas • PsycInfo (American Psychological Society) 1887 do danas • Web of Science (ISI Thomson) od 1991 do danas • Journal Citation Reports(ISI Thomson) • Scopus (Elsevier) • EI VILLAGE (Engineering Information) 1970 do danasCompendex, EngnetBase, US Patent Office, CSSInform (standardi) • INIS (International Nuclear Information System) 1970 do danas • HeinOnline – od 1885. do danas • FSTA – Food Science and Technology Abstracts • MathSciNet – 1946. do danas MICC 2006, Zagreb, Medicinski fakultet Sveučilišta u Zagrebu, 7 i 8. lipnja 2006.

  16. WoS 8600 MEDLINE 5000 * 2800 naslova časopisa je prisutno u obje baze podataka MICC 2006, Zagreb, Medicinski fakultet Sveučilišta u Zagrebu, 7 i 8. lipnja 2006.

  17. Ovid radovi u procesu indeksiranja mogu se zasebno pretraživati (MEDLINE In-Process) bolje sučelje za precizno provođenje upita temeljeno na Medical Subject Headings (MeSH) i raspoloživim ograničenjima više pretraživih polja potpuna kontrola nad korištenjem predmetnica ograničavanje na EBMR bolja kontrola procesa pretraživanja PubMed integracija s drugim bazama podataka i informacijskim servisima kao što su NCBI, uključujući BLAST, Entrez, GenBank, Molecular Modeling Database i OMIM. poveznice na MEDLINEplus i NLM Gateway za knjige Usporedba Medline baze podataka MICC 2006, Zagreb, Medicinski fakultet Sveučilišta u Zagrebu, 7 i 8. lipnja 2006.

  18. MICC 2006, Zagreb, Medicinski fakultet Sveučilišta u Zagrebu, 7 i 8. lipnja 2006.

  19. Elektronički časopisi • ScienceDirect (1700) • SpringerLink (450)+Kluwer (760) • WileyInterscience (180) • Blackwell Synergy (800) • Oxford Journals (200) • Cambridge Journals Online (200) • LWW (100) • EBSCO (ASP - 4600 časopisa cjelovitog teksta) • Nature Publishing Group • nekoliko tisuća časopisa u otvorenom pristupu! • više od 11.500 časopisa dostupno hrvatskoj akademskoj zajednici! MICC 2006, Zagreb, Medicinski fakultet Sveučilišta u Zagrebu, 7 i 8. lipnja 2006.

  20. MICC 2006, Zagreb, Medicinski fakultet Sveučilišta u Zagrebu, 7 i 8. lipnja 2006.

  21. Elektroničke knjige MICC 2006, Zagreb, Medicinski fakultet Sveučilišta u Zagrebu, 7 i 8. lipnja 2006.

  22. PRISTUP MICC 2006, Zagreb, Medicinski fakultet Sveučilišta u Zagrebu, 7 i 8. lipnja 2006.

  23. Bežični pristup online bazama podataka i elektroničkim kolekcijama stranih znanstvenih časopisa Informacije s bilo kojeg mjesta!

  24. Pristup biomedicinskim sadržajima: • Različite metode pristupa: • S računala iz vlastite mreže ustanove (LAN); • Preko telefonske parice: modem, ISDN; • EDGE; • GPRS; • UMTS i • HSDPA. MICC 2006, Zagreb, Medicinski fakultet Sveučilišta u Zagrebu, 7 i 8. lipnja 2006.

  25. Bežični pristup: • Alternativna metoda pristupa; • Sve veća potreba za mobilnošću; • Mobilan pristup mrežnim resursima čak i na mjestima gdje inače ne postoji standardni priključak na Internet; • Pristup Internetu brzinama do 1,5 Mbit/s; • Pristup sadržajima neograničen. MICC 2006, Zagreb, Medicinski fakultet Sveučilišta u Zagrebu, 7 i 8. lipnja 2006.

  26. Autentifikacija: • Izbjegava se potreba za klasičnim “logiranjem”: • Korisnik ne treba znati svoje korisničko ime i zaporku; • Autologin putem verifikacije IP adrese (koja dolazi iz CARNetovog adresnog prostora); • Preduvjet je postojanje valjane korisničke oznake [uid]@realm.hr i zaporke MICC 2006, Zagreb, Medicinski fakultet Sveučilišta u Zagrebu, 7 i 8. lipnja 2006.

  27. Pristup biomedicinskim sadržajima: • Centralno pristupno mjesto: • http://www.online-baze.hr • Sa weba Centra preusmjeravanje na korisnička sučelja različitih izdavača; • Autologin autentifikacija; • Potpuni pristup sadržajima. MICC 2006, Zagreb, Medicinski fakultet Sveučilišta u Zagrebu, 7 i 8. lipnja 2006.

  28. Ponuda: MICC 2006, Zagreb, Medicinski fakultet Sveučilišta u Zagrebu, 7 i 8. lipnja 2006.

  29. Ponuda: MICC 2006, Zagreb, Medicinski fakultet Sveučilišta u Zagrebu, 7 i 8. lipnja 2006.

  30. Više o novim uslugama: • http://www.carnet.hr/pristupinternetu; • http://www.carnet.hr/mobile/sustav i • http://www.online-baze.hr • Kontakti: MICC 2006, Zagreb, Medicinski fakultet Sveučilišta u Zagrebu, 7 i 8. lipnja 2006.

  31. PRETRAŽIVANJE BIOMEDICINSKIH INFORMACIJA MICC 2006, Zagreb, Medicinski fakultet Sveučilišta u Zagrebu, 7 i 8. lipnja 2006.

  32. Što jemedicina utemeljena na dokazima (EBM)? • Evidence based medicine (EBM)je osviješteno, ekplicitno i na pravu zasnovano korištenje trenutno najboljih praksi pri odlučivanju o njezi pacijenata. Praksa medicine zasnovane na dokazima znači objedinjavanje pojedinačnih kliničkih ekspertiza s najboljim rapoloživim kliničkim dokazima iz sustavnih istraživanja. • Sackett DL, Rosenberg WMC, Gray JAM, Haynes RB, Richardson WS. Evidence based medicine: what it is and what it isn't. BMJ. 1996 Jan 13; 312 (7023): 71-2. MICC 2006, Zagreb, Medicinski fakultet Sveučilišta u Zagrebu, 7 i 8. lipnja 2006.

  33. EBM – što je, a što nije Nije medicinska “kuharica” – zahtjeva integraciju u kliničku ekspertizu i kliničke dokaze Identificira i primjenjuje intervencije u svrhu najbolje kvalitete i kvantitete života pojedinih pacijenata Nije ograničena narandomizirane kliničke pokuse (randomized trials) i meta-analize – uključuje prepoznavanje najboljih dokaza koji mogu pomoći pri odgovorima na klinička pitanja MICC 2006, Zagreb, Medicinski fakultet Sveučilišta u Zagrebu, 7 i 8. lipnja 2006.

  34. EBM – zašto je potrebna? • VRIJEME – previše je radova iz časopisa koje je potrebno pratiti i sintetizirati (20radova dnevno samo iz opće medicine, a samo sat vremena tjedno raspoloživog vremena!) MICC 2006, Zagreb, Medicinski fakultet Sveučilišta u Zagrebu, 7 i 8. lipnja 2006.

  35. Potraga za dokazima:Probijanje kroz velike količine medicinske literature Grandage, Karen K, et al. , 2002 MICC 2006, Zagreb, Medicinski fakultet Sveučilišta u Zagrebu, 7 i 8. lipnja 2006.

  36. Vrlo važno pri pretraživanju medicinskih informacija • pažljivo oblikujte svoje pitanje MICC 2006, Zagreb, Medicinski fakultet Sveučilišta u Zagrebu, 7 i 8. lipnja 2006.

  37. Kako oblikovati pitanje • Pretraživanje literature uspješnije je ako ga započnete dobro oblikovanim pitanjem • Rastavite pitanje na dijelove da biste olakšali pronalaženje najboljih dokaza • Neophodno je pitanja fokusirati MICC 2006, Zagreb, Medicinski fakultet Sveučilišta u Zagrebu, 7 i 8. lipnja 2006.

  38. Oblikovanje upita • 1. Napisati rečenicu koja predstavlja naš upit - pokušati biti što precizniji (Kakav je utjecaj mobilnih telefona na zdravlje mladih?) • 2. Rasčlanite svoje pitanje na odvojene koncepte (mobilni telefon, zdravlje, mladi) • 3. Svaki koncept “pokriti” što boljom terminologijom, sinonimma i gramatičkim oblicima – povezati međusobno operatorom OR • 4. Koncepte međusobno “spojiti” korištenjem operatora AND • 5. Pregledati rezultate i korigirati izraze po kojima smo pretraživali • 6. Ograničiti pretraživanje MICC 2006, Zagreb, Medicinski fakultet Sveučilišta u Zagrebu, 7 i 8. lipnja 2006.

  39. AUTORSKO PRETRAŽIVANJE • PREDMETNO PRETRAŽIVANJE • PRETRAŽIVANJE PO ČASOPISU MICC 2006, Zagreb, Medicinski fakultet Sveučilišta u Zagrebu, 7 i 8. lipnja 2006.

  40. MICC 2006, Zagreb, Medicinski fakultet Sveučilišta u Zagrebu, 7 i 8. lipnja 2006.

  41. MICC 2006, Zagreb, Medicinski fakultet Sveučilišta u Zagrebu, 7 i 8. lipnja 2006.

  42. PICOT format – dijelovi dobrog upita • standardizirani format za oblikovanje kliničkog pitanja • grupacija pacijenata koja nas zanima • intervencija koja nas zanima • usporedba koja nas zanima • završni ishod (outcome) koji nas zanima • vremenski okvir MICC 2006, Zagreb, Medicinski fakultet Sveučilišta u Zagrebu, 7 i 8. lipnja 2006.

  43. Grupacija pacijenata • Dob • Spol • Rasa • Određeni poremećaj MICC 2006, Zagreb, Medicinski fakultet Sveučilišta u Zagrebu, 7 i 8. lipnja 2006.

  44. Intervencija • izloženost bolesti • rizično ponašanje • određeni prognostički čimbenik • najnovija praksa utemeljena na dokazima MICC 2006, Zagreb, Medicinski fakultet Sveučilišta u Zagrebu, 7 i 8. lipnja 2006.

  45. Usporedba • ono što uspoređujemo • lako se identificira ako se radi o terapiji npr., no ako je pitanje o predviđanju ishoda možda neće biti usporedbe MICC 2006, Zagreb, Medicinski fakultet Sveučilišta u Zagrebu, 7 i 8. lipnja 2006.

  46. Predviđeni ishod • predviđeni ishod prema kojem će se prosuđivati intervencija i usporedba • rizik bolesti • točnost dijagnoze • učestalost pojavljivanja drugačijeg ishoda MICC 2006, Zagreb, Medicinski fakultet Sveučilišta u Zagrebu, 7 i 8. lipnja 2006.

  47. Vremenski okvir • ne koristi se uvijek • svaki aspekt PICOT formata vodi do uspješnog i učinkovitog pretraživanja MICC 2006, Zagreb, Medicinski fakultet Sveučilišta u Zagrebu, 7 i 8. lipnja 2006.

  48. Oblikovanje pitanja Da li steroidi pomažu pacijentima oboljelima od sepse? • pacijenti sasepsom(grupacija) • da li tretmansteroidima(intervencija) • uspoređujući ih s onima koji ne uzimajusteroide (usporedba) • mijenjasmtnost(ishod)? MICC 2006, Zagreb, Medicinski fakultet Sveučilišta u Zagrebu, 7 i 8. lipnja 2006.

  49. Ključni koraci u strategiji pretraživanja • Dobro formulirajte kliničko pitanje, bez žargona • Odaberite bazu podataka • Unesite izraz po kojem pretražujete, kombinirajte međusobno rezultate • Ograničite rezultate sukladno studijama, metodama, jeziku, publikaciji, etc. MICC 2006, Zagreb, Medicinski fakultet Sveučilišta u Zagrebu, 7 i 8. lipnja 2006.

  50. Bibliotekari su tu da vam pomognu! • Dođite na naše tečajeve! • Pitajte nas ako ne znate nešto pronaći! • Zovite nas i šaljite nam poruke • help@baze.szi.hr MICC 2006, Zagreb, Medicinski fakultet Sveučilišta u Zagrebu, 7 i 8. lipnja 2006.

More Related