530 likes | 645 Views
Dominis Sh2 i Sh3. Xavi Fernández Alba González Alba Jené Macarena Toll. gag. pol. env. V-src. Introducció. 1911 Peyton Rous Virus Sarcoma Rous Transforma les cèl·lules càncer Src kinasa (primera Tyr-K). Src-Kinasa. Domini Src-Homolog 2 (SH2) Domini Src-Homolog 3 (SH3)
E N D
Dominis Sh2 i Sh3 Xavi FernándezAlba GonzálezAlba JenéMacarena Toll
gag pol env V-src Introducció • 1911 Peyton Rous Virus Sarcoma Rous • Transforma les cèl·lules càncer • Src kinasa (primera Tyr-K)
Src-Kinasa • Domini Src-Homolog 2 (SH2) • Domini Src-Homolog 3 (SH3) • Domini Tyr Kinasa • Autoinhibició per fosforilació de Tyr
DominiSH2 • Classe α/β • Plegament tipus SH2 • Superfamília: SH2 • Família: SH2
Fulles β Hèlixs α
FUNCIÓ • Modul no catalític, conservat, involucrat tant en modificar l’activitat quinasa com en direccionar les interaccions de les tyr kinases amb els seus substrats cel·lulars. • S’uneixen a residus de fosfotirosines
Xarxa de senyalització • Domini SH2 permet agrupar proteïnes (mòduls) senyalització • Aparició alhora de proteïnes SH2 i Tyr – Kinases Coevolució • Diversificació + especialització conjunta dels dos dominis
Kinases (TyrK): 13 • Fosfatases (TyrP): 2 • Adaptadores: 7 • Factors transcripció (Unió DNA): 4 • Altres: 3
... i conservació de l’Arg entre espècies Arg conservada Paper clau en l’estabilització de la unió a la Tyr P
Propietats del domini SH2 Unió específica i forta però reversible pTyr
Hidrofòbics Polar sense càrrega Polar amb càrrega +
Butxaca hidrofòbica Butxaca polar pTyr Arg
Unió al lligand - PTyr Lligand ESQpYEEIPpY PTyr
Butxaca hidrofobica PTyr-Arg Butxaca polar
2,723A 2,723A Domini SH2: interacció PTyr
Thr 215 Selectivitat unió Importància Thr 215 PTyr-X-Asn
Thr Trp PTyr-X-Asn Ptyr- val- asn val
Aromatics ( F, Y, W, H ) Domini SH3
Abl • Tyr Kinasa familia Src • 47% homologia en seqüència Diferent mecanisme d’inhibició !
SH2-Kinase loop SH2-SH3 linker SH3 Kinase Activation loop MYR C-lobe SH3
GRB2 SH2 SH3 SH3
Sos Receptor Tyr-K Fosforilat SH3 SH2 SH3
Syp Tyr fosfatasa
Arg PTyr
STATS • Factors de transcripció • Regulació creixement, supervivència i diferenciació cel·lular • Importants en el S.I. • Senyalització per citokines.
SH2 Domini dimerització Domini unió DNA (GAS) DNA STAT- 1
Preguntes PEM 1. Que caracteritza a la proteina Src? • a. que s'autoinhibeix • b. que és inhibida per Shp-2 • c. el seu loop sh2-kinasa és més flexible • d. totes les anteriors són falses • e. totes les anteriors són certes. 2. Un exemple/s de proteina/es que contenen el domini SH3 és: • 1. Shp-2 • 2. Nebulin • 3. Syp • 4. Grb2 • a. 1,2,3 • b. 1,3 • c. 2,4 • d.4 • e.1,2,3,4
3. El domini SH3 es caracteritza per ser: • a. tot alfa • b. alfa + beta • c. tot beta • d. ric en aminoàcids alifàtics • e. c i d són certes 4. El domini SH2 es caracteritza per ser: • a. tot alfa • b. tot beta • c. alfa / beta • d. alfa + beta • e. partially opened beta barrel 5. Quines butxaques trobem en el domini SH2? • a. 1 butxaca aromatica i una hidrofobica • b. 2 butxaques polars i una hidrofobica • c. 1 butxaca polar i una hidrofòbica • d. 1 butxaca apolar • e. 2 butxaques polars