1 / 16

TRANSLACIJA

TRANSLACIJA. TRANSLACIJA. TRANSLACIJA: prevođenje nukleotidnog slijeda mRNA, prepisanog iz DNA, u slijed aminokiselina (proteine) GENETSKI KOD: kako je informacija o aminokiselinskom slijedu zapisana u nukleinskim kiselinama

tia
Download Presentation

TRANSLACIJA

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. TRANSLACIJA

  2. TRANSLACIJA • TRANSLACIJA: prevođenje nukleotidnog slijeda mRNA, prepisanog iz DNA, u slijed aminokiselina (proteine) • GENETSKI KOD: kako je informacija o aminokiselinskom slijedu zapisana u nukleinskim kiselinama • Translacija je vrlo SLOŽEN proces koji ovisi o međuigri nekoliko stotina makromolekula (mRNA, ribosoma, tRNA, aminoacil-tRNA sintetaza, inicijacijskih i elongacijskih faktora te faktora otpuštanja...)

  3. GENETSKI KOD

  4. ZADACI • Pokusi sa polinukleotidima nasumičnog ili uređenog, pravilnog nukleotidnog slijeda imali su važnu ulogu u "razbijanju" genetskog koda. Uz pretpostavku da vam je od prije poznato da su aminokiseline kodirane slijedom tripleta nukleotida, na osnovi sljedećih podataka pokušajte odrediti koji kodoni pripadaju pojedinim aminokiselinama: • pomoću polinukleotid-fosforilaze sintetiziran je kopolimer A i C u omjeru 1:3 nasumičnog, slučajnog slijeda. In vitro translacijom takvog kalupa nastali su polipeptidi građeni od aminokiselina u sljedećem omjeru: Lys : Asn : Thr : Gln : His : Pro = 1 : 3 : 12 : 3 : 9 : 36

  5. ZADACI • translacijom kemijski sintetiziranog uređenog kopolimera ....ACACACACACACACACACAC.... nastao je polipeptid slijeda ....-Thr-His-Thr-His-Thr-His-Thr-.... • translacija na uređenom kopolimeru ....CAACAACAACAACAACAACA.... nastaju tri različita polipeptida koji se sastoje isključivo od treonina, glutamina ili asparagina - (Thr)n, (Gln)n i (Asn)n • kopolimer ....CCAACCAACCAACCAACCAA.... translacijom daje polipeptide građene od ponavljajućih tetrapeptida ...-Asn-Gln-(Pro-Thr-Asn-Gln)n-Pro-Thr-...

  6. ZADACI • Lanac kalup molekule DNA koja kodira N-terminalni dio nekog proteina iz bakterije E. coli ima slijed baza: GTAGCGTTCCATCAGATTT Napišite prve četiri aminokiseline tog proteina. • Nukleotidni slijed kodirajućeg lanca DNA koji kodira C-terminalni dio nekog proteina iz E. coli je: CCATGCAAAGTAATAGGTNapišite slijed aminokiselina koje su kodirane tim dijelom DNA. genetski kod

  7. ZADACI • Slijed nukleotida kodirajućeg lanca DNA koji kodira središnji dio proteina je: ...CAATACTAAGCAATCCCGCGACTAGACCTTAC... Napišite slijed aminokiselina kodiranih ovim dijelom DNA genetski kod

  8. ZADACI R: Tri su moguća okvira čitanja, ali u dva od njih pojavljuju se stop-kodoni: • ..CAA UAC UAAGCA AUC CCG CGA CUA GAC CUU AC.. • ..CA AUA CUA AGC AAU CCC GCG ACU AGA CCU UAC.. • ..C AAU ACU AAG CAA UCC CGC GAC UAG ACC UUA C. Budući da se radi o nukleotidnom slijedu koji kodira središnji dio proteina, traženi okvir čitanja je onaj koji ne sadrži stop kodone u okviru čitanja, tj. okvir čitanja pod br. 2: ...CA AUA CUA AGC AAU CCC GCG ACU AGA CCU UAC... ...-Ile-Leu-Ser-Asn-Pro-Ala-Thr-Arg-Pro-Tyr-...

  9. ZADACI • Nakon triptičke digestije i određivanja primarne strukture triptičkih peptida jednog proteina mutanta bakteriofaga T4 primjećeno je da postoji razlika u niže navedenom triptičkom fragmentu: divlji tip: Cys-Glu-Asp-His-Val-Pro-Gln-Tyr-Arg mutant: Cys-Glu-Thr-Met-Ser-His-Ser-Tyr-Arg Objasnite do kakvih je mutacija došlo i napišite najvjerojatniji slijed baza za obje mRNA koje kodiraju navedene nonapeptide. genetski kod

  10. ZADACI • Eksperimentalno je utvrđeno da se Cys-tRNACys može prevesti u Ala-tRNACys te koristiti u in vitro sustavu za sintezu proteina • Ako je u tako priređenoj Ala-tRNACys alanin radioaktivno obilježen sa 14C, da li će se radioaktivitet ugrađivati u protein na mjesta kodirana za alanin ili cistein? • Što vam taj eksperiment govori o utjecaju aminoacil-tRNA-sintetaza na točnost translacije?

  11. TRANSFER RNA (tRNA) Sekundarna i tercijarna struktura tRNA. Žuta boja predstavlja akceptorsku peteljku, siva predstavlja D-regiju, a plavom bojom označena je T-regija. Varijabilno područje obojano je narančasto. Lijevo: sekundarna struktura tRNA oblika lista djeteline. Sredina: shematski prikaz tercijarne strukture kvaščeve tRNAPhe. Većina je baza sparena i sudjeluje u interakcijama slaganja baza. Desno: kalotni model kvaščeve tRNAPhe. Uočljiva su helikoidalna područja i kompaktnost strukture.

  12. ZADACI • U skladu sa hipotezom kolebljive baze odredite minimalni broj tRNA potrebnih za čitanje šest kodona za leucin: UUA, UUG, CUU, CUC, CUA i CUG genetski kod

  13. HIPOTEZA KOLEBLJIVE BAZE • Neke tRNA prepoznaju NEKOLIKO kodona, pri čemu je prepoznavanje treće baze kodona relaksirano, manje strogo • Sparivanje baza kodona i antikodona prema teoriji kolebljive baze: Prva bazaTreća baza antikodona kodona C G A U U A, G G U, C I U, C, A

  14. ZADACI • Koliko kodona mogu prepoznati tRNA sa antikodonima GCU i CGA? Koje aminokiseline kodiraju odgovarajući kodoni? R: tRNAGCU - AGC i AGU (wobble; kodoni za Ser) tRNACGA - UCG (kodon za Ser)

  15. ZADACI • Koje kodone može čitati tRNA čiji je antikodon (položaji 34, 35 i 36) GA? • Kod bakterije E. coli koja ima dvije kopije gena za ovu tRNA došlo je do mutacije G  C u jednoj kopiji gena na položaju 34. Koje će biti posljedice ove mutacije? • Kakve bi bile posljedice kada bi došlo do ovakve mutacije u obje kopije gena? genetski kod

  16. GENETSKI KOD

More Related