470 likes | 1.17k Views
kromosoomid karüotüüp, karüogramm kliiniline tsütogeneetika. rakubioloogia praktikum okt. 2010. kati kuuse tsütogeneetik. rakutsükkel. kromosoomi struktuur. mitoosi metafaas. kromosoomide arv eri liikidel:. Karüotüüp – kromosoomide komplekt jagunevas rakus
E N D
kromosoomid karüotüüp, karüogrammkliiniline tsütogeneetika rakubioloogia praktikum okt. 2010 kati kuuse tsütogeneetik
rakutsükkel kromosoomistruktuur mitoosi metafaas
kromosoomide arv eri liikidel: Karüotüüp – kromosoomide komplekt jagunevas rakus Iseloomulik liigile/indiviidile/koele/rakule kromosoomide arv jamorfoloogia (kuju, suurus) • inimene • koer • kass • hobune • toakärbes • karpkala • mugulsibul • tomat • kartul Homo sapiens Canis familiaris Felis domesticus Equus calibus Musca domestica Cyprinus carpo Allium cepa Lycopersicon esculentum Solanum tuberosum 46 78 38 64 12 104 16 24 48
kromosoomide suurus: oder Spix macaw
kromosoomide kuju: telotsentriline: vöödistuse muster
inimese kromosoomid - 46 1956.a Tijo ja Levan Rahvusvaheline klassifikatsioon: 1960
kromosoomide vöödistuse muster 1956.a 1969.a
kromosoomide diferentsiaalvärving (banding): kogu kromosoomi ulatuses: Q-banding (quinakriin-dihüdrokloriid) G-banding (trüpsiiniga töötlus) R-banding (temperatuuriga töötlus) high-resolution banding teatud kromosoomipiirkonna värving: C-banding (tsentromeerid ja heterokromatiin) NOR-värving (tuumakese organisaatorpiirkond)
inimese karüogramm (G-banding): A B C E D F G karüotüüp: 46,XY
A B C E D F G
2 3 13 4 11 17 1 9 10 18 15 6 14 18 X 8 13 16 11 5 17 21 20 14 1 19 10 9 12 19 15 3 16 22 6 5 21 20 12 X 4 8 22 7
Q-band C-band
rakkude kasvatamine koekultuuris rakutsükli kontrollpunktid: X mitogeen (PHA) X X kolhitsiin kromosoomide uurimiseks sobiv materjal: • perifeerne veri • nahk • luuüdi X • amnionivesi • koorion • loote nabaväädi veri
koekultuuriprotokoll (perifeerne veri) • kultuuri initsiatsioon – mitogeen PHA (fütohemaglutiniin) • käävi inhibiitor – kolhitsiin • rakkude hüpotooniline töötlus – KCl, Na-tsitraat • rakkude fikseerimine – metanool/jää-äädikas • kromosoomipreparaadi valmistamine OK vaatame prepsi
rahvusvaheline tsütogeneetika nomenklatuur – ISCN 2009 karüotüübi analüüs 7. kromosoom band level: 300 400 550 700 850
*polümorfism e. normivariandid (qh+; p+; ps+; pstk+) 9qh+; Yqh+; 13p+; 21ps+; 21pss; 22pstk+ mitte kõik muutused karüotüübis ei põhjusta haigust *kromosoomide struktuuri balansseeritud muutused: balansseeritud translokatsioon
kromosoomide struktuuri balansseeritud muutus inversioon inv(9)(p12q13) inv(2)(p11q12)
kromosoomihaigused e. sündroomid tingitud kromosoomide arvu või struktuuri tasakaalustamata muutusest • ei ole ravitavad • diagnoosimine vajalik prognoosi ja kordusriski andmiseks • võimalik diagnoosida enne sündi
kromosoomihaigused / autosoomide trisoomiadtrisoomia 21 e. Downi sündroomsagedus 1:600 • lihashüpotoonia • liigeste üliliikuvus • mongoloidne silmade lõige • epikantus e. kolmas silmalaug • lai silmavahe • suur keel • väikesed düsplastilised kõrvad • lame profiil • südamerike • tsöliaakia
kromosoomihaigused Downi sündroom – 47,XY,+21
Eesti, 2009.a. Downi sündroom: 46 sündis 14 8 valenegatiivset skriiningtesti 3 loobusid kromosoomianalüüsist 2 ei teinud skriiningtesti 1 sünnieelse diagnoosiga 32 sünnieelselt diagnoositud, rasedus katkestatud
autosoomide trisoomiad trisoomia 13 Patau sündroom Sagedus 1:10 000 trisoomia 18 Edwardsi sündroom sagedus 1:7000 Eestis 2009: tri18 – 4 tri13 - 1
sugukromosoomide arvuanomaaliad 47,XXY 45,X 47,XYY 47,XXX Triplo-X sündroom 47,XXY Klinefelteri sündroom 45,X Turneri sündroom
kromosoomide balansseerimata struktuurimuutused: • deletsioon • duplikatsioon • insertsioon • translokatsioon • ringkromosoom • lisa(marker)kromosoom • isokromosoom
molekulaarne tsütogeneetika – FISH-analüüs kasutatakse fluorestsentsmärgisega DNA proove • denaturatsioon • hübridisatsioon • signaali detekteerimine fluorestsentsmikroskoobiga
mikrodeletsioon 22q11.2 – DiGeorge sündroom ish del(22)(q11.2q11.2)(TUPLE1-)
mikrodeletsioon 15. kromosoomi pikas õlas - Prader-Willi sündroom ish del(15)(q11q13)
molekulaarne tsütogeneetika interfaasi tuumadel 13.kromosoomi DNA proov – roheline 21.kromosoomi DNA proov - punane
18.kromosoomi DNA proov – sinine X-kromosoomi DNA proov – roheline Y-kromosoomi DNA proov - punane
molekulaarne ja klassikaline tsütogeneetika 21 47,XX,+21 Downi sündroom
molekulaarne ja klassikaline tsütogeneetika X 45,X Turneri sündroom
21 13 21 13 18X 18X triploidia (69,XXX)