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High Performance Computing Service in NTUCC

High Performance Computing Service in NTUCC. 2006/12/22 高效能運算服務推廣說明會 計算機及資訊網路中心 作業管理組 助理程式設計師 張傑生 jsc@ntu.edu.tw. 簡報大綱. 歷史演進 現有設備 系統架構 使用狀況 申請規範 未來展望 心得交流. 歷史演進. 1990~ 年代 Cray XMP Cray J916 They were retired several years ago. 2000~ 年代

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  1. High Performance Computing Service in NTUCC 2006/12/22 高效能運算服務推廣說明會 計算機及資訊網路中心 作業管理組 助理程式設計師 張傑生 jsc@ntu.edu.tw

  2. 簡報大綱 • 歷史演進 • 現有設備 • 系統架構 • 使用狀況 • 申請規範 • 未來展望 • 心得交流

  3. 歷史演進 • 1990~年代 • Cray XMP • Cray J916 • They were retired several years ago. • 2000~年代 • 2003 first cluster with 50 nodes(100 cpus) • 2005 second cluster with 78 nodes(156 cpus) • 2006 • IBM P595 SMP server with 64 cpus • HP cluster with 106 nodes(424 cpu cores)

  4. 現有設備 • 建置日期：2003 • 運算節點：50 • Nexcom Blade Server • Dual Intel Xeon 2.0GHz • 1GB memory • 效能 • Rpeak: 400GFlops • Rmax: 200GFlops • 未來計畫移做教育訓練用途

  5. 現有設備 • 建置日期：2005 • 運算節點：78 • IBM Blade Server • Dual Intel Xeon 3.2GHz • 5GB memory • 效能: • Rpeak: 998GFlops • Rmax: 500GFlops • 適合對象： • 已透過 MPI 平行化之程式

  6. 卓越計算中心 • 經費來源：邁向頂尖大學（五年伍佰億） • 2006 重點建設 • 以硬體採購為主 • 改善機房基礎建設 • 高效能計算設備 • IBM SMP p595 • HP cluster • 2007 規劃建設 • 軟硬體採購並重 • 軟體採購政策 • 普遍性、一致性、滿足大多數使用者需求。 • 一次買斷，非租賃。 • 將部分負擔納入採購優先權考量。 • 歡迎踴躍提供軟體建議。

  7. 建置中 • 建置日期：2006 • 運算節點： • IBM p595 • 64*Power5 1.9GHz CPU • 256GB memory • AIX 5.3 • 效能: • Rpeak: 486GFlops • Rmax: 418GFlops • 適合對象： • 已透過 OpenMP 平行化之程式 • 單一程式需要大量記憶體

  8. 建置中 • 建置日期：2006 • 運算節點：106 • HP DL145G3 Server • Dual Intel Xeon 3.0GHz • 4GB memory • 效能: • Rpeak: 4900GFlops • Rmax: 2900GFlops • 適合對象： • 已透過 MPI 平行化之程式

  9. 系統架構

  10. 軟體列表

  11. Job Queue Policy • IBM Blade (2005) • Long queue • 3 concurrent execution jobs maximum • For each job • 1152 hours(48days) maximum if using 1 cpu • 36 hours maximum if using 32 cpus • Short queue • 4 concurrent execution jobs maximum • For each job • 144 hours maximum if using 1 cpu • 9 hours maximum if using 16 cpus

  12. 研究團隊 • 服務對象 • 遍及校內物理系、化學系、凝態中心、土木系、機械系、工科系、農藝系、光電所、電子所、資工系與藥學系等單位之研究團隊約二十組 • 研究團隊介紹

  13. 使用狀況 • 綠線為 78，也就是「平均」每一組運算節點 load 都為1。 • 盡量讓每一顆 CPU load 維持在 0.5，也就是讓所有 CPU 都有工作計算，盡量降低閒置CPU。以提升整體利用率。 • 2006/05額外擴充40組計算節點。

  14. 使用狀況 • 紅線代表總記憶體量，也就是 5*78 = 390GB。 • 目前記憶體使用量大約為 50%。 • 2006/05 額外擴充40組計算節點。 • 2006/07 將每組計算節點之記憶體由 2GB 擴充為 5GB。

  15. 使用統計（2006/01~2006/10）

  16. 申請規範 • 由於資源有限，目前僅開放學術研究用途。 • 請先與計中方面聯絡，討論需求與程式內容。 • 以研究團隊為單位申請。 • 後續將依學校要求，訂定收費辦法，落實使用者付費觀念。 • 未來發表論文時，請 Acknowledge 計資中心。

  17. 時程規劃 • 2007/01 IBM SMP 主機教育訓練。 • 2007/02 開放 IBM SMP 主機帳號申請。 • 2007/03 HP cluster 主機教育訓練。 • 2007/03 開放 HP cluster 主機帳號申請。

  18. 教育訓練 • IBM SMP 與 HP cluster 廠商提供 • 2007/01~03 於計中電腦教室 • 高效能環境介紹與平行化程式寫作 • 進階平行化程式寫作與偵錯技巧 • 系統管理維護之教育訓練 • 程式開發環境之教育訓練 • 未來將放置課程錄影於網站上，提供線上學習。 • IMSL 廠商提供 • 2007/02 於計中電腦教室舉辦教育訓練 • 每月定期於該公司（忠孝東路五段）舉辦教育推廣活動，全程免費且附午餐便當。

  19. 教育訓練 • 後續規劃 • 計資中心教學研究組開課 • 邀約校內教授專家不定期開課

  20. 未來展望 • 定期舉辦服務推廣活動，發掘潛在使用者。 • 透過教育訓練，提升使用者技術能力。 • 平行化程式設計、MPI/OpenMP 使用說明 • 監控系統狀態，調整 queuing policy，以兼顧整體使用率與滿足使用者需求。 • 持續爭取經費，擴充計算設備。 • 廣徵各方意見，滿足軟硬體需求。

  21. 心得交流 • 謝謝大家 • 請踴躍發言

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