Vaya a ncbi.nlm.nih/entrez/query.fcgi?db=Genome

1. Trabajo especial de bioinformática 4368 • Vaya a http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=Genome • Seleccione la opción de Nucleotides localizada en la parte superior izquierda. • En el recuadro de Draft Human Genome, seleccione la opción de Map Viewer. • ¿Cuántos cromosomas tiene un perro, una rata y Arabidopsis? • Utilizando el recuadro de Search, determine en qué cromosoma(s), se encuentran los • genes relacionados con lo siguiente: (recuerde presioanr find luego de escribir la premisa) • a. Anemia falciforme (sickle cell anemia) • b. Parkinson • c. Alzheimer • d. fibrosis cística • e. Diabetes • f. cancer (seleccione uno de ellos y mencione el cromosoma en el que se encuentra) • 6. Vaya a http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ • Usando GenBank, realice una búsqueda de la siguiente secuancia de de acceso: AF321136 • Abra el archivo y conteste: • a. organismo del cual proviene la secuencia • b. número de genes presentes en la secuencia • c. función sugerida de alguno de el o los genes • d. Seleccione 20 nucleótidos de cualquier región de uno de los genes. • e. Seleccione los amino ácidos que desee de una de las secuencias de proteínas presentes. • 7. Vaya a http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/ y determine a qué organismo pertenece la siguiente • secuencia de: • a. Realice una búsqueda usando la secuencia de DNA y proteínas que • copio en 2d y 2e (arriba). • b. ¿Cuáles fueron los tres primeros “hits” obtenidos de cada una? • 8. Vaya a http://expasy.cbr.nrc.ca/tools/scnpsit1.html • a. Seleccione la secuencia completa de CcmH en AF321136 y realice una búsqueda. • b. Escriba el primer motif, motivo o secuencia conservada que encuentre y su función. Dr. Carlos RíosVelázquez