1 / 3

Input 1: Gelspots (MALDI/TRAP)

I. Bioinformatik Platform MPI/OVGU: Übersicht. Input 2: Gelfrei (MALDI/TRAP). Input 1: Gelspots (MALDI/TRAP). mgf .-file. mgf .-file. Suche mit X gegen: NCBIall / Swissprot Metagenom Spektrendatenbank Spotdatenbank. Suche mit X gegen: NCBIall / Swissprot Metagenom

yuma
Download Presentation

Input 1: Gelspots (MALDI/TRAP)

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. I. Bioinformatik Platform MPI/OVGU: Übersicht Input 2: Gelfrei (MALDI/TRAP) Input 1: Gelspots (MALDI/TRAP) mgf.-file mgf.-file • Suche mit X gegen: • NCBIall/Swissprot • Metagenom • Spektrendatenbank • Spotdatenbank • Suche mit X gegen: • NCBIall/Swissprot • Metagenom • Spektrendatenbank X Aktualisieren der DB  Spektren/ Spotdatenbank+ BLAST Aktualisieren der DB  Spektrendatenbank+ BLAST Biogasdatenbank Open: Quantifizierung Einbettung Datastorage Clustern/ PCA

  2. I. Bioinformatik Platform MPI/OVGU: SUCHEN X SUCHE: Standardsuche/Cloudcomputing mit Sequence, OMSA, MASCOT oder Pepnovo/BLAST (Auswahl) DB: NCBI/ Swissprot DB: Metagenome+ BLAST+ manuel BLAST+ Auswahl SUCHE: Ähnlichkeitssuche mit Spektren DB: Spektrendatenbank DB: Spotdatenbank SUCHE: Erhöhung des Scores für gelfreie Experimente

  3. I. Bioinformatik Platform MPI/OVGU: Einbettung • CLOUD-Computing+JAVA/SQL complet selber • OpenLIMS • Open MS • ProteinScape

More Related