160 likes | 352 Views
МИТОГЕНОМИКА ПРЕСНОВОДНЫХ РЫБ СЕМЕЙСТВА КАРПОВЫХ ( CYPRINIDAE ). Луданный Р.И., Хрисанфова Г.Г., Столбунова В.В. * , Слынько Ю.В. * , Рысков А.П., Семенова С.К. Институт биологии гена РАН. 119334, Москва, улица Вавилова д. 34/5.
E N D
МИТОГЕНОМИКА ПРЕСНОВОДНЫХ РЫБ СЕМЕЙСТВА КАРПОВЫХ (CYPRINIDAE) Луданный Р.И.,Хрисанфова Г.Г.,Столбунова В.В.*, Слынько Ю.В.*, Рысков А.П.,Семенова С.К. Институт биологии гена РАН. 119334, Москва, улица Вавилова д. 34/5. * Институт биологии внутренних вод РАН. 152742, пос. Борок, Некоузский район, Ярославская область.
Список исследуемых представителей карповых рыб
Список исследуемых пород и видов карпа C. carpio
Какова вариабельность контрольного региона у карповых ? • Как дифференцируются представители семейства карповых по контрольному региону ?
Полиморфизм контрольного региона
Количество нуклеотидных замен в доменах Число транзиций█ и трансверсий █ в разных доменах контрольного региона
Генетическая дифференциация карповых рыб на основании изменчивости в CSB-E домена контрольного региона
Генетическая дифференциация карповых рыб на основании изменчивости зоны предполагаемого промотора
Какова вариабельность двух митохондриальных генов coxIIи cox IIIу карповых рыб ? • Как дифференцируются представители карповых рыб по этим генам ?
Характеристика нуклеотидного разнообразия (в 1-ом, 2-ом и 3-ем положении кодонов) генов cox IIиcox III в исследованной выборке карповых рыб cox II cox III coxII cox III
Al1 1 Al2 1 4 Volga German 23 R(BB) 1 R(MM) 1 86 69 St 1 Hu 1 Ch1 1 98 Ch2 1 61 An1 1 An2 1 99 99 As 1 Purse red carp 1 98 85 Yuanjiang Big belly carp 1 Yangtze 92 73 Xingguo Xingtao 79 Qingtian 95 99 Japanese Koi Carassius auratus 1 Carassius auratus 99 Barbus barbus1 Barbus barbus 99 Phoxinus phoxinus Abramis brama 1 99 Abramis brama 2 Alburnus alburnus 99 Leuciskus soufia Rutilus rutilus 1 99 Rutilus rutilus 2 99 20 10 0 0.15 0.10 0.05 0.00 Генетическая дифференциация карповых рыб на основании изменчивости генов cox II, cox III иCR cox II CR cox III
Какова скорость накопления мутационных изменений в кодирующих и некодирующих участках мт генома карповых рыб ? • Применима ли гипотеза «молекулярных часов» для оценки дивергенции карповых рыб ?
Генетическая дифференциация карповых рыб на основании изменчивости генов cox II, cox III иCR Al1 1 Al2 1 4 Volga German 23 R(BB) 1 R(MM) 1 86 69 St 1 Hu 1 Ch1 1 98 Ch2 1 61 An1 1 An2 1 99 99 As 1 Purse red carp 1 98 85 Yuanjiang Big belly carp 1 Yangtze 92 73 Xingguo Xingtao 79 Qingtian 95 99 Japanese Koi Carassius auratus 1 Carassius auratus 99 Barbus barbus1 Barbus barbus 99 Phoxinus phoxinus Abramis brama 1 99 Abramis brama 2 Alburnus alburnus 99 Leuciskus soufia Rutilus rutilus 1 99 Rutilus rutilus 2 99 20 10 0 0.15 0.10 0.05 0.00 cox II CR cox III 27 MY (Zardoya & Doadrio, 1999) Vcox II&cox III= 0.35 %/MY; , Vcr = 0.7 %/MY
Европейский карп Азиатский карп Амурский сазан 1,65 млн. лет назад 0,4 млн. лет назад