190 likes | 346 Views
Семина А.В. лаборатория генетики ИБМ ДВО РАН. Молекулярная эволюция рода Tribolodon (Teleostei: Cyprinidae). T. hakonensis. T. brandti. T. nakamurai. T. sakhalinensis. Tribolodon brandti. Tribolodon nakamurai. Tribolodon sakhalinensis. Tribolodon hakonensis. Pseudoaspius leptocephalus.
E N D
Семина А.В. лаборатория генетики ИБМ ДВО РАН Молекулярная эволюция родаTribolodon (Teleostei: Cyprinidae)
T. hakonensis T. brandti T. nakamurai T. sakhalinensis
Tribolodon brandti Tribolodon nakamurai Tribolodon sakhalinensis Tribolodon hakonensis Pseudoaspius leptocephalus Leuciscus waleskii Охотское море Набильский залив Хабаровский край Сахалин Тумнин Татарский пролив Чибисон Бахура Фирсовка Сусуя Корсаковка Лютога о. Хонсю Приморский край Северо-запад Тихого океана Японское море Хоккайдо Залив Петра Великого
Положение четырех исследованных ПЦР-сегментов относительно линейной генной карты митохондриальной ДНК позвоночных • ND3/ND4/ND4L/ND5/ND6 • A6/A8 • COIII • 12S/16S
Consensus maximum parsimony tree Numbers above – bootstrap values nreps=1000 100 78 100 100 78 100 100 100 Leuciscus waleskii Pseudoaspius leptocephalus 100 Tribolodon sakhalinensis T. hakonensis южный тип 100 T. hakonensis северный тип T. nakamurai T. brandti
Leuciscus waleskii Pseudoaspius leptocephalus 98 T. nakamurai 98 T. brandti 99 T. sakhalinensis 98 T. hakonensis южный тип 98 Bayesian analysis Numbers above – posterior probability T. hakonensis северный тип 99
2002 Скорость молекулярной эволюции, полученная с помощью калибровки палеонтологических и молекулярных данных Разброс значений дивергенции при попарном сравнении последовательностей ДНК с момента исходной дивергенции (млн. лет), рассчитанной на основе появления в ископаемых находках диагностического апоморфного признака. 0.66% за 1 млн. лет
Maximum parsimony tree на основе последовательностей сyt b Dowling et al., 2002 Эволюционные взаимоотношения североамериканских карповых рыб Maximum parsimony tree на основе последовательностей сyt b Эволюционные взаимоотношения североамериканских карповых рыб и и исследуемой группы видов
Дивергенция северной и южной форм T. hakonensis ~3.5 млн. лет Дивергенция T. nakamurai ~8 млн. лет Поздний Миоцен Дивергенция T. hakonensis, T. brandti, T. sakhalinensisи P. leptochephalus ~14-15 млн. лет Средний Миоцен Дивергенция L. waleskii vs. Tribolodon и P. leptocephalus ~20 млн. лет Поздний Олигоцен Ископаемые находки Tribolodon sp. Начало млн. лет Продолж. млн. лет Период Эпоха 0.01 - Голоценовая Четвертичный период Плейстоценовая 1.6 1.6 Плиоценовая 5.3 3.7 Неогеновый период Миоценовая 23.7 18.4 Олигоценовая 33.7 10.0 Эоценовая 57.8 24.1 Палеогеновый период Палеоценовая 66.4 8.6
р. Амур р. Раздольная (Суйфун) Речная система палео-Амура о. Сахалин Речная система палео-Суйфуна Северо-запад Тихого океана Японское море о. Хоккайдо
T. hakonensis северный тип T. brandti Фрагмент гена гормона роста ~1300 пн T. hakonensis южный тип Зона гибридизации 501 489 404 331 242 190 147 111 67 T. hakonensis северный тип T. hakonensis южный тип T. brandti
Фрагмент, кодирующий А6/А8/ND3, после обработки рестриктазой RsaI М1 – 100 bp Ladder+1500 bp; M2 – λ/PstI Рестрикционные спектры являются строго видоспецифичными и не перекрываются
Северный типT. hakonensis Южный типT. hakonensis Фенограмма, иллюстрирующая филогенетические отношения между северными и южными популяциямиTribolodonhakonensis Популяции: 1. р. Фирсовка 2. р. Ильинское 3. р. Бахура 4. р. Корсаковка 5. р. Тумнин 6. р. Терней 7. зал. Восток 8. р. Раздольная
Филогенетические отношения впопуляциях кеты
Пиленгас Сем. Mugilidae Лобан Сингиль
Филогенетические отношения кефалей Японского, Азовского и Средиземного морей