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UNAM - BIOTECNOLOGIA
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JUNIO 2023 INFORME VISITA A LABORATORIO DE BIOTECNOLOGÍA PARA RECONOCIMIENTO DE EQUIPOS DOCENTE Soto Gonzales, Hebert Hernan ALUMNO Coacalla Cutimbo, Jorge Luis CURSO Biotecnologia
UNIVERSIDAD NACIONAL DE MOQUEGUA ESCUELA PROFESIONAL DE INGENIERÍA AMBIENTAL “Año De La Unidad, La Paz Y El Desarrollo” INFORME: “VISITA A LABORATORIO DE BIOTECNOLOGÍA PARA RECONOCIMIENTO DE EQUIPOS” Trabajo Presentado por: Coacalla Cutimbo, Jorge Luis Curso: Biotecnología Docente: Soto Gonzales, Hebert Hernan ILO-PERU Junio, 2023 1
ÍNDICE l. INTRODUCCIÓN.................................................................................................................3 ll. OBJETIVOS.........................................................................................................................4 2.1. Objetivo General...........................................................................................................4 2.2. Objetivos específicos.....................................................................................................4 III. UBICACIÓN DEL LABORATORIO..............................................................................4 IV. MATERIALES Y MÉTODOS..........................................................................................5 4.1.Materiales.......................................................................................................................5 4.2. Metodología.................................................................................................................. 6 4.2.1. Centrífuga mini spin.............................................................................................6 4.2.2. Espectrofotómetro Nanodrop OneC.....................................................................7 4.2.3. PCR -El termociclador CFX96............................................................................ 9 4.2.4. PCR- El termociclador T100..............................................................................10 4.2.5. QUBIT 4.............................................................................................................12 4.2.6. Concentrador de muestras..................................................................................13 4.2.7. Centrífuga Refrigerada GLP Eppendorf, Modelo 5910 RI................................15 4.2.8. Electroforesis en Gel de agarosa........................................................................16 V. CONCLUSIONES..............................................................................................................18 VI. BIBLIOGRAFÍA............................................................................................................. 19 2
l. INTRODUCCIÓN En el ámbito de la biotecnología, el constante avance tecnológico es un factor clave para la mejora y optimización de los procesos de investigación y desarrollo,en este contexto, la visita a un laboratorio especializado en reconocimiento de equipos se presenta como una oportunidad invaluable para adquirir conocimiento. La biotecnología se ha convertido en un pilar fundamental en diversos campos, como la medicina, la agricultura, la industria farmacéutica y la producción de alimentos, entre otros. La optimización de los equipos utilizados en los laboratorios de biotecnología es esencial para garantizar resultados precisos y reproducibles, así como para acelerar el progreso científico.Este informe tiene como objetivo presentar una descripción detallada de la visita realizada al Laboratorio de Biotecnología para Reconocimiento de Equipos, donde se exploraron las tecnologías y metodologías utilizadas en el reconocimiento y validación de equipos biotecnológicos. Durante la visita, se tuvo la oportunidad de conocer de cerca los diferentes tipos de equipos utilizados en el laboratorio, como los centrífuga, los PCR, espectrofotómetro, entre otros.En resumen, la visita al Laboratorio de Biotecnología para Reconocimiento de Equipos brindó una valiosa oportunidad para adquirir conocimientos prácticos y actualizados sobre la optimización y validación de equipos utilizados en la investigación y desarrollo biotecnológico con en que contamos en la universidad nacional de Moquegua (UNAM). A través de este informe, se espera compartir los aprendizajes obtenidos y fomentar un mayor interés y comprensión de la importancia de la tecnología en este campo en constante evolución. 3
ll. OBJETIVOS 2.1. Objetivo General ● Describir y comprender sobre el funcionamiento de los equipos de laboratorio de la Universidad Nacional De Moquegua (UNAM) 2.2. Objetivos específicos ● Familiarizarse con los diferentes tipos de equipos utilizados en el laboratorio de biotecnología. ● Investigar y analizar las buenas prácticas y normas de calidad aplicables al reconocimiento y validación de equipos en laboratorios de biotecnología. ● Conocer las características y su funcionamiento del los equipos de presentes en laboratorio III. UBICACIÓN DEL LABORATORIO La práctica ejecutada se llevó a cabo en el Laboratorio de Biotecnología ubicado en la Universidad Nacional de Moquegua, en la ciudad de Ilo, departamento de Moquegua. Esta práctica fue realizada por los alumnos de la escuela profesional de ingeniería ambiental de la misma universidad,con la guia del docente responsable del curso, 4
IV. MATERIALES Y MÉTODOS 4.1.Materiales Cuaderno o bloc de notas para tomar apuntes durante la visita y registrar información importante. Bolígrafos o lápices para escribir en el cuaderno de notas y tomar apuntes. Cámara o teléfono móvil para capturar imágenes de con cámara los equipos y las instalaciones del laboratorio. Ropa de laboratorio en caso de que se requiera usar bata, guantes, mascarillas u otros equipos de protección personal durante la visita. 5
4.2. Metodología 4.2.1. Centrífuga mini spin Figura 1: Centrifuga Minispin La centrífuga Mini Spin es un equipo de laboratorio utilizado para separar componentes de una muestra líquida mediante fuerzas de centrifugación. Es un dispositivo compacto y de tamaño reducido, diseñado para ser utilizado en aplicaciones de bajo volumen. Características ● Tamaño compacto y capacidad: El Mini Spin 5425R tiene un diseño compacto y ocupa poco espacio en el laboratorio. Puede acomodar hasta 24 tubos de centrífuga de 1,5 ml o 2 ml en su rotor fijo. ● Velocidad y fuerza de centrifugación: Este modelo puede alcanzar una velocidad máxima de 14,500 RPM (revoluciones por minuto) . Esto proporciona una separación efectiva de los componentes en muestras pequeñas en un corto período de tiempo. 6
● Panel de control intuitivo: La centrifuga Mini Spin 5425R cuenta con un panel de control fácil de usar y programar. Permite ajustar la velocidad, el tiempo de centrifugación y otras configuraciones. ● Pantalla digital: La centrifuga tiene una pantalla digital que muestra la velocidad en RPM, así como el tiempo restante de la centrifugación. Esto proporciona una visualización clara y precisa de los parámetros de funcionamiento. ● Funciones de seguridad: El Mini Spin 5425R está equipado con características de seguridad, como un sistema de bloqueo de tapa para evitar que se abra durante la centrifugación. Además, cuenta con detección de desequilibrio que detiene automáticamente la centrifugación si se detecta una carga desequilibrada. ● Diseño silencioso: Esta centrifuga ha sido diseñada para funcionar de manera silenciosa y con baja vibración, lo que proporciona un entorno de trabajo tranquilo y cómodo en el laboratorio. 4.2.2. Espectrofotómetro Nanodrop OneC Figura 2: Espectrofotómetro Nanodrop OneC 7
El Espectrofotómetro NanoDrop OneC es un instrumento utilizado para cuantificar y analizar ácidos nucleicos y proteínas en muestras biológicas. Está fabricado por Thermo Fisher Scientific, una reconocida empresa en el campo de equipos de laboratorio. Características ● Tecnología de medición de microvolúmenes: El NanoDrop OneC utiliza una tecnología de medición de microvolúmenes que permite cuantificar ácidos nucleicos y proteínas utilizando volúmenes de muestra muy pequeños. Esto reduce la necesidad de dilución y conserva la muestra, ya que solo se requiere una pequeña cantidad (generalmente alrededor de 1-2 μL) para realizar la medición. ● Amplio rango de longitud de onda: El espectrofotómetro NanoDrop OneC permite la medición de absorbancia en un amplio rango de longitud de onda, generalmente desde 190 nm hasta 850 nm. Esto abarca las principales longitudes de onda utilizadas en la cuantificación de ácidos nucleicos y proteínas, como 260 nm para ADN y ARN, y 280 nm para proteínas. ● Medición rápida y precisa: El NanoDrop OneC ofrece resultados rápidos y precisos, con una velocidad de medición típica de alrededor de 3-5 segundos por muestra. ● Software intuitivo: Este espectrofotómetro viene con un software intuitivo y fácil de usar que permite la configuración de métodos, el análisis de datos y la generación de informes. El software también proporciona herramientas para realizar correcciones de fondo, análisis de pureza y cálculos automáticos de concentración y rendimiento. ● Amplia gama de aplicaciones: Este espectrofotómetro se utiliza en diversas aplicaciones de laboratorio, incluyendo la cuantificación de ácidos nucleicos y 8
proteínas, la evaluación de pureza de muestras, la determinación de relaciones de absorbancia y la medición de muestras de micro volúmenes 4.2.3. PCR -El termociclador CFX96 Figura 3: termociclador CFX96 El termociclador CFX96 es un instrumento utilizado en laboratorios de biología molecular y genética para llevar a cabo la amplificación de ADN mediante la técnica de PCR en tiempo real (qPCR). Es producido por la empresa Bio-Rad Laboratories y es ampliamente utilizado en la investigación científica, el diagnóstico médico y otras aplicaciones biotecnológicas. El CFX96 es un termociclador con capacidad para alojar 96 tubos o pocillos individuales en una placa de PCR. Estos tubos contienen las reacciones de PCR, que incluyen la muestra de ADN 9
Características: ● Control de temperatura preciso: El CFX96 tiene la capacidad de calentar y enfriar los tubos a temperaturas específicas con alta precisión y uniformidad. Esto es esencial para garantizar que las diferentes etapas de la PCR, como la desnaturalización, la hibridación de primers y la extensión, se realicen en las condiciones óptimas. ● Detección de fluorescencia en tiempo real: El CFX96 está equipado con un sistema de detección óptica que permite monitorear la acumulación de ADN amplificado durante la PCR en tiempo real. ● Software de análisis y adquisición de datos: El CFX96 viene con un software dedicado que permite controlar el instrumento, programar los ciclos de PCR y adquirir y analizar los datos de fluorescencia generados durante la amplificación. Este software permite la cuantificación de la cantidad inicial de ADN en la muestra, la determinación de la eficiencia de amplificación y el análisis comparativo de diferentes muestras o condiciones experimentales. 4.2.4. PCR- El termociclador T100 Figura 4: Termociclador T100 10
El termociclador T100 es un instrumento utilizado en laboratorios de biología molecular para llevar a cabo la técnica de la Reacción en Cadena de la Polimerasa (PCR). El T100 es fabricado por Bio-Rad Laboratories y es ampliamente utilizado en investigaciones científicas, diagnóstico médico y aplicaciones biotecnológicas. Características: ● Capacidad de tubos: El T100 puede acomodar tubos individuales de PCR en un bloque térmico. La capacidad puede variar según el modelo específico del T100, pero generalmente estándar es de 96 tubos de PCR. ● Bloque térmico: El bloque térmico del T100 es donde se colocan los tubos de PCR para el calentamiento y enfriamiento durante los ciclos de PCR. El bloque térmico está diseñado para proporcionar una distribución uniforme y precisa de la temperatura en todos los tubos. ● Control de temperatura: El T100 ofrece un control preciso de la temperatura en todo el rango de PCR, ● Interfaz de usuario intuitiva: El T100 cuenta con una interfaz de usuario fácil de usar, con una pantalla LCD y controles simples para configurar y monitorear el progreso de la PCR. La programación de ciclos y el inicio de la PCR se pueden realizar de manera rápida y sencilla. ● Funciones de seguridad: El T100 incorpora características de seguridad para proteger las muestras y el equipo. Esto puede incluir la capacidad de bloquear la tapa durante 11
el funcionamiento para evitar aperturas accidentales y la función de apagado automático después de completar un ciclo de PCR. 4.2.5. QUBIT 4 Figura 5: QUBIT 4 El Qubit 4 es un sistema de medición de ácidos nucleicos fabricado por Thermo Fisher Scientific. Está diseñado para la cuantificación precisa y sensible de ácidos nucleicos, como ADN y ARN, en muestras biológicas. Características: ● Sensibilidad y precisión: El fluorómetro Qubit 4 ofrece una alta sensibilidad y precisión en la cuantificación de ácidos nucleicos. Puede detectar cantidades muy bajas de ADN o ARN, lo que lo hace ideal para muestras con concentraciones bajas. ● Tecnología de fluorescencia: Utiliza la tecnología de fluorescencia para cuantificar los ácidos nucleicos. Este método se basa en la emisión de luz fluorescente por parte de las moléculas de ADN o ARN marcadas con colorantes específicos. El fluorímetro 12
mide la intensidad de la fluorescencia y la convierte en una concentración cuantitativa. ● Rango de medición: El Qubit 4 tiene un amplio rango de medición que permite cuantificar tanto pequeñas como grandes cantidades de ácidos nucleicos. Puede medir concentraciones de ADN o ARN desde picogramos hasta microgramos. ● Facilidad de uso y velocidad: El fluorímetro Qubit 4 se caracteriza por su facilidad de uso y su rapidez en la obtención de resultados. Su interfaz intuitiva y su diseño ergonómico hacen que sea fácil de operar. Además, los resultados se obtienen en pocos minutos, lo que agiliza los experimentos y el análisis de muestras 4.2.6. Concentrador de muestras Figura 6: Concentrador de Muestras El Concentrator plus tiene tres modos principales de funcionamiento: concentración, centrifugación y desecación – para cubrir todas sus necesidades de aplicación. La elección de cuatro niveles de calentamiento (ambiente, 30 °C, 45 °C, 60 °C) permite una concentración 13
segura y eficaz de diversas muestras. Cuando trabaje con muestras delicadas, también tiene la opción de desactivar la función de freno. características: ● Viene en 3 configuraciones de sistema ● Funcionamiento extremadamente silencioso <50 dB (A) ● La bomba de membrana de PTFE, libre de mantenimiento y resistente a los productos químicos, elimina la necesidad de realizar cambios de aceite ● El diseño compacto ahorra espacio valioso en la mesa ● Gran variedad de rotores con 15 opciones diferentes para el alojamiento de tubos de 0,2 mL a 50 mL, microplacas y placas PCR ● Un accionamiento por inducción sin motor y una cámara de acero inoxidable resistente a las sustancias químicas para un funcionamiento sin problemas ● Se puede conectar a la mayoría de trampas de enfriamiento disponibles en el mercado para el uso con vapores ● Tapa revestida con resistencia química superior 14
4.2.7. Centrífuga Refrigerada GLP Eppendorf, Modelo 5910 RI Figura 7: Centrífuga 5910 Ri La centrífuga refrigerada GLP (Good Laboratory Practice) Eppendorf, Modelo 5910 RI, es un equipo de laboratorio utilizado para separar los componentes de una muestra mediante fuerza centrífuga. Características ● Capacidad de hasta 4 litros o 4.500 rpm (revoluciones por minuto). ● Control de temperatura desde -9 °C a +40 °C para mantener la muestra refrigerada durante la centrifugación. ● Pantalla digital para ajuste preciso de parámetros y monitoreo en tiempo real. ● Sistema de rotor autoclavable y compatible con múltiples adaptadores para adaptarse a diferentes formatos de tubos y placas. 15
● Funciones de aceleración y desaceleración rápidas para minimizar el tiempo total de centrifugación. ● Diseño de bajo nivel de ruido y vibración para un funcionamiento silencioso y estable. ● Cumplimiento con estándares de buenas prácticas de laboratorio (GLP) y requisitos de seguridad. 4.2.8. Electroforesis en Gel de agarosa Figura 8: Electroforesis en Gel de agarosa El sistema de electroforesis en gel de agarosa de Bio-Rad es una técnica ampliamente utilizada en biología molecular para separar y analizar muestras de ácidos nucleicos, como ADN y ARN. Características ● Tanques de electroforesis con diferentes tamaños y configuraciones. Esto permite adaptar el sistema a diferentes necesidades experimentales, ya sea que se trabaje con muestras de pequeño volumen o se requiera una mayor capacidad de carga. 16
● Diseño ergonómico: Los tanques de electroforesis de Bio-Rad están diseñados para ser fáciles de usar y cómodos de manejar. Cuentan con tapas herméticas que evitan fugas de tampón durante la electroforesis y permiten una fácil apertura y cierre. ● Compatibilidad con peines intercambiables: El sistema de electroforesis de Bio-Rad utiliza peines intercambiables que permiten crear diferentes números y tamaños de pozos en el gel de agarosa. Esto ofrece flexibilidad en la cantidad y el tipo de muestras que se pueden cargar en cada corrida. ● Sistema de filtración de calor: Algunos modelos de tanques de electroforesis de Bio-Rad cuentan con un sistema de filtración de calor que ayuda a mantener la temperatura del gel durante la electroforesis. Esto es especialmente útil cuando se trabaja con muestras sensibles al calor, ya que ayuda a mantener la integridad de las moléculas durante la migración. ● Compatibilidad con equipos de documentación: Los sistemas de electroforesis de Bio-Rad son compatibles con una variedad de equipos de documentación y análisis de geles, como los sistemas de imagen ChemiDoc™ y Gel Doc™. Esto facilita la captura de imágenes y el análisis de las bandas migradas en el gel. 17
V. CONCLUSIONES ● Durante el desarrollo de este informe, se ha logrado cumplir con el objetivo de familiarizarse con los diferentes tipos de equipos utilizados en el laboratorio de biotecnología. Se ha llevado a cabo una investigación exhaustiva y se ha recopilado información detallada sobre los equipos más comúnmente utilizados en este campo, como centrifugadoras, espectrofotómetros, termocicladores, sistemas de electroforesis, entre otros y se ha adquirido un conocimiento sólido sobre la función de cada equipo, sus componentes y su aplicación en experimentos de biotecnología. ● Se ha logrado cumplir con el objetivo de investigar y analizar las buenas prácticas y normas de calidad aplicables al reconocimiento y validación de equipos en laboratorios de biotecnología,también se investigaron las buenas prácticas recomendadas para el mantenimiento, calibración y verificación de los equipos, asegurando así la confiabilidad y precisión de los resultados obtenidos. ● El objetivo de conocer las características y el funcionamiento de los equipos presentes en el laboratorio se ha cumplido satisfactoriamente. Se ha llevado a cabo una descripción detallada de cada equipo, incluyendo sus características y se han analizado los principios fundamentales de funcionamiento de cada equipo, así como los procedimientos recomendados para su uso adecuado. Esta comprensión profunda de los equipos permite un uso eficiente y seguro en el laboratorio de biotecnología, garantizando la integridad de los experimentos y la calidad de los resultados obtenidos. 18
VI. BIBLIOGRAFÍA ❖ Sistema de detección CFX96. (n.d.). https://www.altona-diagnostics.com/files/public/Content%20Homepage/-%2003%20 Biorad%20CFX96/Biorad%20CFX96%20Manuals%20und%20Co/CFX96_IM_Span ish_ES_RevA.pdf ❖ Register your. (2015). Register your instrument! MiniSpin /MiniSpin plus. Manual de instrucciones - PDF Descargar libre. Docplayer.es. https://docplayer.es/18183381-Register-your-instrument-www-eppendorf-com-myepp endorf-minispin-minispin-plus-manual-de-instrucciones.html ❖ THERMO SCIENTIFIC NANODROP ONE GUIA DEL USUARIO Descargar en PDF. (2021, February 17). ManualsLib. https://www.manualslib.es/manual/200069/Thermo-Scientific-Nanodrop-One.html ❖ Artedinamico. (2022). KIT DE INICIO QUBIT 4 NGS - INVITROGEN - Q33229. Equipos Y Laboratorio de Colombia. https://www.equiposylaboratorio.com/portal/inicio ❖ Centrifuge 5910 Ri - centrífuga refrigerada - Eppendorf España. (2023). Eppendorf.com. https://www.eppendorf.com/es-es/Tienda-virtual-y-Productos/Centrifugaci%C3%B3n /Centr%C3%ADfugas-multiuso/Centrifuge-5910Ri-p-PF-963296 ❖ Horizontal Electrophoresis Systems. (2023). Bio-Rad Laboratories. https://www.bio-rad.com/es-pe/category/horizontal-electrophoresis-systems?ID=6712 bcc6-458e-43f7-9d93-3cdacdc741ac 19