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JOURNEES DES AVRIL 2014 ROUEN. PLAN. - Introduction - Tube digestif - Définition du Microbiote intestinal - Méthodes de caractérisation - Composition - Établissement, stabilité, Adaptabilité - Fonctions - Dysbiose - Applications thérapeutiques - Conclusion
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JOURNEES DES AVRIL 2014 ROUEN
PLAN - Introduction - Tube digestif - Définition du Microbiote intestinal - Méthodes de caractérisation - Composition - Établissement, stabilité, Adaptabilité - Fonctions - Dysbiose - Applications thérapeutiques - Conclusion - Bibliographie
10x plus de bactéries dans l'intestin que de cellules dans le corps humain !!!!!!! Grande Surface 400m2 !!! X2
MICROBIOTE = communautés de micro-organismes qui résident ou transitent dans le tube digestif. 14 -10 bactéries : 10 fois le nb de cellule de l’organisme environ 100 fois plus de gènes que le génome humain - >500 espèces différentes réparties le long du tube digestif
Seulement 20-30% des bactéries du tractus digestif sont cultivables par les méthodes classiques de culture A-
> Utilisation ARN ribosomal 16S en tant que marqueur de la diversité génétique • > Gène codant l’ARN 16S (ADNr 16S) présent chez toutes les bactéries • - méthodes de séquençage • - empreintes • - PCR quantitative • - Hybridation in situ • - METAGENOMIQUE = étude des génomes de l’ensemble des organismes présents dans un échantillon • ( MICROBIOME <-> Génome associé au Microbiote)
FLORE DOMINANTE – SOUS DOMINANTE Flore DOMINANTE 10-20 espèces avec Niveau de population élevé Flore SOUS-DOMINANTE Florede passage Bactéries Anaérobies Surtout BGN non sporulés Bacteroides +++ BG+ = eubacteria, clostridia Bifidobacterium Catenabacterium Cocci GP Bactéries aero/anaérobies facultatives Enterobacteries, strepto, Entérobacteries Citrobacter, klebsiella, proteus Levures Candia albicans présent dans 50-60% cultures.
3. SPECIFICITE. Chaque individu : Héberge environ 200 espèces A un Microbiote qui lui est propre On peut classer les individus selon leur Entérotype.
Synthèse Épithélium Intestinal Absorption
Fermentation des glucides ++++++ AGCC GAZ - -BUTYRATE :directement utilisé par l’épithélium colique tirant 60-70% de son énergie des produits de fermentation bactérienne. - ACETATE : fournit énergie au tissu musculaire + substrat à la synthèse de cholestérol. - PROPIONATE : utilisé par le foie pour la néoglucogénèse
Métabolisme des protéines Par Protéases désamination désamination
- Maturation épithélium intestinal - Vascularisation des villosités - Renforcement des jonctions cellulaires - Augmentation de la cellularité du chorion - Augmentation des cryptes Cellule souche Cellule de paneth Différenciation + Prolifération des cellules épithéliales intestinales Développement de l’angiogenèse Jonctions renforcées
5. FONCTIONS EMERGENTES -Neuromodulation Relation Microbiote -Intestin- Cerveau - Rôle dans la régulation du stockage des graisses
DYSBIOSE ET PATHOLOGIES
Ingestions de micro-organismes Prise IPP Prise ATB Voyages, changements d'environnements DYSBIOSE = état de déséquilibre
Implications de la Dysbiose dans : - Infections intestinales - Diarrhées aux ATB - Pullulation du grêle - Colites de diversion - MICI - SII - Cancérogènése dans le tractus digestif - Maladies extra-digestives : Syndrome Métabolique, Obésité Allergies
Ex : Diarrhées à Clostrium Difficile Exposition à un ATB Dysbiose Transitoire homéostasie Exposition à C.D Dysbiose Persistante INFECTION à CD
c v=> OBJECTIF = EUBIOSE => MOYENS : Approche Nutritionnelle modification des apports en fibres fermentescibles Approche Microbiologique Probiotique Prébiotique Symbiotiques ATB Transplantation Fécale
CONCLUSION - Microbiote intestinal = véritable organe complexe et riche - Unique = carte d’identité d’un individu - Interactions majeures avec l’hôte - Rôles : barrière + métabolique + immunologique - Implication dans de nombreuse pathologies en cas de déséquilibre - De nombreuses implications restent à explorer… Gigantesque et passionnant défi à relever !