1 / 19

bio5. fizyka .amu.pl/ www .amu.pl/ ~zbm

http://bio5. fizyka .amu.edu.pl/ http:// www .amu.edu.pl/ ~zbm. Kierownik: prof. dr hab. Adam Patkowski patkowsk@amu.edu.pl Web”master” dr Jacek Gapiński gapinski@amu.edu.pl. Zakład Biofizyki Molekularnej.

arlen
Download Presentation

bio5. fizyka .amu.pl/ www .amu.pl/ ~zbm

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. http://bio5.fizyka.amu.edu.pl/http://www.amu.edu.pl/~zbm Kierownik: prof. dr hab. Adam Patkowski patkowsk@amu.edu.pl Web”master” dr Jacek Gapiński gapinski@amu.edu.pl

  2. Zakład Biofizyki Molekularnej

  3. Badanie białek przetwarzających energię światła w procesie fotosyntezy 3 prace magisterskieopieka naukowa: dr Krzysztof Gibasiewicz (krzyszgi@amu.edu.pl) mgr Wojciech Giera mgr Maria Pajzderskapromotor: prof. Andrzej Dobek Zakład Biofizyki Molekularnej

  4. Motywacja prowadzonych badań Dokładne poznanie funkcjonowania biologicznych układów przetwarzających energię światła. Uzyskana wiedza ma służyć wykorzystaniu odnawialnego źródła energii, jakim jest światło, na potrzeby człowieka.

  5. TEMAT 1: Izolacja i charakterystyka spektroskopowa fotosystemu I z zielonego glonu Chlamydomonas reinhardtii. Jednokomórkowy glon Chlamydomonas reinhardtii. Fotosystem I - struktura krytalograficzna

  6. TEMAT 1: Izolacja i charakterystyka spektroskopowa fotosystemu I z zielonego glonu Chlamydomonas reinhardtii. Charakter pracy : eksperymentalny, biologiczno-spektroskopowy Biologia = hodowla + izolacja (współpraca z Wydziałem Biologii UAM) Fizyka = stacjonarna i ultraszybka spektroskopia laserowa (współpraca z CBUSL i Uniwersytetem w Amsterdamie)

  7. 5 ps 10 ns 200ps TEMAT 2: Badanie wpływu stanu uprotonowania aminokwasów na szybkość przeniesienia elektronu wewnątrz białka. Charakter pracy : eksperymentalno - obliczeniowy

  8. TEMAT 3:Badanie dyfuzji białek w błonach lipidowych. Charakter pracy : eksperymentalny

  9. Metody nieliniowe w badaniach biomakromolekuł 2 prace magisterskie • Optyczny efekt Kerra w roztworach NA (tRNA, DNA) • Magnetooptyczne badania polisacharydów i białek promotor: prof. Andrzej Dobek Ferrytyna tRNA

  10. Badanie cytokinin dr hab. Genowefa ŚlósarekZakład Biofizyki Molekularnej

  11. R H Cytokininy • hormony roślinne • w postaci nukleotydów wbudowane w cząsteczki tRNA • związki o znaczeniu farmaceutycznym

  12. Struktura krystaliczna kinetyny kinetyna

  13. Tematy prac magisterskich • Oddziaływanie cytokinin z metalami • krystalizacja cytokinin z metalami, głównie Cu2+; • analizaoddziaływań cytokinina– metal– spektroskopia elektronowa, • spektroskopia oscylacyjna • Kryształy cytokinin i innych cząsteczek • krystalizacja cytokinin z innymi zasadami nukleinowymi, • krystalizacja cytokinin z aminokwasami; badanie wiązań wodorowych; • analiza warunków krystalizacji • analiza dynamiki molekularnej metodami spektroskopii oscylacyjnej • poszukiwanie przemian fazowych;

  14. Sprawdzanie stosowalności uogólnionego prawa Einsteina-Stokesa.Pomiary mikro- i makro-lepkości w różnych ośrodkach.Promotor: prof. dr hab. Adam PatkowskiOpiekunowie: dr Jacek Gapiński, dr Ewa Banachowicz

  15. Prawo Einsteina dotyczące dyfuzji swobodnej Opór ruchu = f v Podana przez Stokesa postać wzoru na współczynnik f dla kuli f = 6R, gdzie  to lepkość rozpuszczalnika, a R to promień kuli. Wzór Einsteina-Stokesa: W przypadku cieczy złożonych (niejednorodnych zawiesin) lub przechłodzonych okazuje się, że wzór ten przestaje działać w świecie mikro, jeśli stosować lepkość rozpuszczalnika. Uogólnie-nie prawa E-S polega na wprowadzeniu pojęcia mikrolepkości.

  16. Zakład Biofizyki Molekularnej http://bio5.fizyka.amu.edu.pl Dyfuzja swobodna (Einstein) <x2>(t) = 6 D t Spektroskopia kore-lacji fluorescencji (FCS) Dynamika polimerów/biopolimerów/koloidów w roztworach • FCS mierzy czas dyfuzji sondy przez ognisko mikroskopu konfokalnego –Zalety: • Oświetlona objętość: ~0.15 fl (femtolitr), • Objętość próbki: >20 l (parowanie), • Stężenie próbki: ~10 nM, • Wysoka selektywność (sonda fluorescencyjna).

  17. Określenie wpływu struktury ośrodka na dyfuzję

  18. Zakład Biofizyki Molekularnej Sprawdzanie stosowalności uogólnionego prawa Einsteina-Stokesa. Pomiary mikro- i makro-lepkości w różnych ośrodkach. • Oddziałujące układy koloidalne. Pomiary techniką FCS. • Śledzenie cząsteczek koloidowych przy pomocy mikroskopu i kamery filmowej. • Pomiar lepkości cieczy przechłodzonych w zależności od temperatury przy pomocy FCS. • Pomiar lepkości cieczy przechłodzonych w zależności od ciśnienia przy pomocy FCS. W tym zakresie mamy rozwiniętą współpracę krajową (ICHF PAN prof. R.Hołyst) międzynarodową (USA, Niemcy, Francja).

  19. http://bio5.fizyka.amu.edu.pl/http://www.amu.edu.pl/~zbm Kierownik: prof. dr hab. Adam Patkowski patkowsk@amu.edu.pl Web”master” dr Jacek Gapiński gapinski@amu.edu.pl

More Related